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张文娟

作品数：3 被引量：28H指数：2
供职机构：复旦大学生命科学学院更多>>
发文基金：国家重点基础研究发展计划中国博士后科学基金国家自然科学基金更多>>
相关领域：医药卫生生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 2篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 2篇医药卫生
  • 1篇生物学

主题

  • 2篇适应性进化
  • 2篇密码子
  • 2篇进化
  • 1篇正选择
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇同义密码子
  • 1篇最大似然法
  • 1篇进化研究
  • 1篇检索表
  • 1篇哈希
  • 1篇哈希表
  • 1篇翻译
  • 1篇分子进化
  • 1篇肝病
  • 1篇肝炎
  • 1篇肝炎病毒
  • 1篇包膜蛋白
  • 1篇丙肝

机构

  • 3篇复旦大学
  • 1篇福建农林大学
  • 1篇上海生物信息...

作者

  • 3篇张文娟
  • 2篇钟扬
  • 1篇张原
  • 1篇刘雄恩

传媒

  • 1篇科学通报
  • 1篇复旦学报（自...

年份

  • 1篇2008
  • 2篇2006
共 3 条 记 录，以下是 1-3
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排序方式：
应用最大似然法检测丙肝病毒包膜蛋白编码基因的适应性进化被引量：2
2006年
非同义-同义置换速率比值(dN/dS)是藉蛋白质编码序列评价选择压力的一种重要测度,而基于密码子置换模型的最大似然法业已成为检测承受正选择的氨基酸位点及适应性进化的统计分析工具.本研究应用最大似然法分析了丙型肝炎病毒的包膜蛋白编码序列,从全世界18个常见的基因型/亚型中,发现了4个正选择/适应性位点.由于这些氨基酸位点位于不同的免疫表位,本研究结果具有潜在的生物医学价值,同时表明最大似然法可以作为一种检测高分歧度病毒蛋白中适应性进化存在与否的有效手段.
张文娟张原钟扬
关键词：适应性进化最大似然法正选择丙型肝炎病毒包膜蛋白
基于密码子水平的生物信息学分析及进化研究
密码子水平的生物信息学分析是研究基因组进化、蛋白质功能以及遗传和环境相互作用等课题中一个的重要环节。本文中，我们从密码子使用模式的比较基因组分析、密码子用法作为构建系统发育树的方法以及基于密码子置换模型的适应性进化检测等...
张文娟
关键词：生物信息学分子进化同义密码子适应性进化
两种快速的密码子检索方法
2008年
许多生物信息学软件涉及将核苷酸序列翻译成对应的氨基酸序列的操作.密码子检索表的结构及检索算法强烈地影响蛋白质翻译的速度.本文提出了2种快速的密码子检索方法.一是平均检索长度约为7,最大检索长度为9的分块检索;二是没有空间冗余和地址冲突的哈希表检索,其平均检索长度和最大检索长度均为3.对几种密码子检索方法的检索效率进行比较,结果表明哈希表的检索速度最快.
刘雄恩张文娟钟扬
关键词：密码子翻译检索表哈希表
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