孙媛媛
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：南京信息工程大学更多>>
- 发文基金：中国博士后科学基金江苏省博士后科研资助计划项目江苏省自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- 一种在格点模型上模拟蛋白质折叠结构的优化算法
- 2014年
- 蛋白质折叠问题是生物信息学中一个经典的多项式复杂程度的非确定性(non-deterministic polynomial,NP)难度问题.势能曲面变平法(ELP)是一种启发式的全局优化算法.通过对ELP方法中的直方图函数提出一种新的更新机制,并将基于贪心策略的初始构象的产生,基于牵引移动的邻域搜索策略与ELP方法相结合,为面心立方体(FCC)格点模型的蛋白质折叠问题提出一种改进的势能曲面变平(ELP+)算法.采用文献中9条常用序列作为测试集.对于每条序列,ELP+算法均能找到与文献中的算法所得到的最低能量相等或更低的能量.实验结果表明,ELP+算法是求解FCC格点模型的蛋白质折叠问题的一种有效算法.
- 刘景发宋蓓蓓刘朝霞孙媛媛黄维波
- AB非格点模型蛋白的混合型结构预测算法研究
- 蛋白质在生命活动中担任着重要的角色,它的生物学功能是由其空间结构决定的。研究表明,人体的许多疾病都是由于蛋白质的结构发生变化所导致的,所以了解蛋白质的空间结构具有重要的实际意义。然而,蛋白质结构预测问题是一个NP难度问题...
- 孙媛媛
- 关键词：蛋白质结构预测
- 文献传递
