夏军红
- 作品数:20 被引量:207H指数:7
- 供职机构:中国水产科学研究院南海水产研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技基础条件平台建设计划广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学天文地球更多>>
- 用微卫星指纹识别天鹅洲保护区长江江豚个体被引量:27
- 2005年
- DNA指纹个体识别技术是保护遗传学研究中的一种非常重要的手段。为了准确地识别天鹅洲保护区中的每一头长江江豚以开展保护遗传学及其它相关研究 ,并实施有效的种群管理 ,本研究应用 4个微卫星座位初步构建了该群体的DNA指纹图谱 ,并利用此图谱成功地对不同时期在保护区捕获的江豚进行了个体识别研究。
- 夏军红郑劲松王丁
- 关键词:微卫星座位天鹅DNA指纹图谱保护遗传学动物学
- 中国近海黑鲷线粒体DNA控制区序列多态性分析被引量:10
- 2006年
- 采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序的方法,测定了广西北海、广东深圳和山东青岛3个地理群体共72尾黑鲷(Acanthopagrusschlegeli)线粒体Dloop第一高变区5′端547~549bp序列,以探讨黑鲷种群的遗传变异。分析结果表明:72条序列T、C、A、G4种核苷酸的平均含量分别为30.8%、21.8%、36.3%、11.0%。共检测到55个变异位点,其中转换位点32个,颠换位点19个,缺失/颠换位点1个,插入/颠换位点3个。72个个体具有51种单倍型(haplotype),单倍型比率为70.8%,黑鲷线粒体Dloop控制区表现出较为丰富的核苷酸多态性。对其所有单倍型依据序列距离使用NJ法构建的亲缘关系树并无明显的系谱分支,没有显示出明显的地理分布族群,说明黑鲷线粒体DNA控制区第一高变区序列无法用于黑鲷种群的鉴别。
- 龚金波苏天凤夏军红龚世园江世贵
- 关键词:黑鲷DNA序列线粒体控制区多态性
- 中国南海海域斑节对虾群体与西印度洋、西太平洋群体种群遗传结构的比较分析被引量:7
- 2008年
- 采用聚合酶链式反应(PCR)技术对海南三亚、深圳、湛江、北海4个斑节对虾群体共95个个体的延伸因子1-alpha内含子序列进行了扩增,对扩增产物进行克隆转化,并将阳性克隆产物进行序列测定,最终获得了大小约216bp的可供分析的核苷酸序列。将获得的序列与从Genbank上下载的西太平洋、西印度洋种群的序列进行比较分析,结果表明,中国海域种群的基因多样性最低,西太平洋海域的基因多样性水平最高;通过对遗传分化指数FST的分析,发现西太平洋群体和西印度洋群体之间以及两者与中国海域群体间遗传分化具有极显著性差异(P<0.001)。UPGMA系统树显示,10个斑节对虾群体形成两大分支,一支由西太平洋群体和中国海域群体组成,另一支由西印度洋群体单独组成;中国海域群体中北海群体单独聚成一支。序列差异的分析结果表明,中国海域群体与西印度洋群体之间的亲缘关系最远,与西太平洋群体之间的亲缘关系较近;中国海域内部各群体之间,北海群体与海南、深圳、湛江群体之间的亲缘关系较远,形成一个独特的地理种群。
- 熊小飞江世贵夏军红苏天凤龚世园
- 关键词:斑节对虾种群结构
- 玉米Rf_3近等基因系的分子标记辅助回交选育与效益分析被引量:90
- 2002年
- 本研究在玉米 S组 CMS恢复基因 Rf3精细定位的基础上 ,对不同亲本来源的两个群体 HSBC1 F1 、 MYBC2 F1 及HSBC2 F1 、 MYBC3F1 代 ,利用多种分子标记开展 Rf3近等基因系的辅助选择 (MAS)研究 ,在 HSBC1 F1 群体中 ,通过一代标记辅助选择 ,可育单株遗传背景与轮回亲本最高相似程度已达到 83.9% ,并且 ,单侧连锁累赘的长度已被控制在8.9c M以内。在 MYBC3F1 群体中 ,通过一代表型选择和两代 MAS,可育单株遗传背景与轮回亲本最高相似程度已达到 98% ,单侧连锁累赘的长度已被控制在 2 .2 9c M以内。并对采用的标记数量、选择时期与代数、选择策略等方面对分子标记辅助选择的效益进行了分析。同时 。
- 夏军红郑用琏
- 关键词:玉米分子标记回交选育
- 玉米恢复系的分子标记辅助回交选育与效益分析
- 该研究在恢复基因Rf<,3>精细定位的基础上,对不同亲本来源的两个群体BC<,1>F<,1>、BC<,2>F<,1>代利用各种分子标记开展了标记辅助选择(MAS)研究.
- 夏军红
- 关键词:玉米标记辅助选择表型选择
- 文献传递
- 两个不同江豚群体ISSR遗传多样性初步分析被引量:20
- 2005年
- 采用ISSR分子标记对中国水域隶属于不同江豚(Neophocaena phocaenoides)亚种的两个群体即长江群体和渤海群体的遗传多样性进行分析。用19条ISSR引物及3对引物组合对两个群体共36个样品的基因组DNA进行PCR扩增,共得到115个清晰的扩增位点,其中多态性位点48个,多态位点百分率(PPL)为41.71%。POPGENE分析结果表明:两个江豚群体的总体遗传多样性水平相对较低(He=0.1643;Ho=0.2413);长江群体的遗传多样性水平(He=0.1530;Ho=0.2223)稍高于渤海群体(He=0.1402;Ho=0.205 9)。Ne i's遗传多样性分析结果表明群体结构水平较低而基因流水平较高(Gst=0.104 9;Nm=4.267 6),提示在历史上可能发生过较强的基因交流。我们建议在保护上将两个群体划分为不同的管理单元。
- 李东明林刚郑劲松夏军红胡成钰王丁
- 关键词:江豚ISSR
- 鲮原种群体的AFLP分析被引量:3
- 2007年
- 运用AFLP技术,对广东鲮鱼原种场保存的鲮原种2个子群体(子群体h、q)各29个个体进行遗传多样性分析。25对AFLP引物组合中的6对引物扩增共产生173条条带,其中多态位点数为72,多态位点比例为41.5%。在6对引物产生的173条扩增条带中,有一条扩增条带在子群体h中的出现频率远远高于其在子群体q中的出现频率(72.4%>20.6%),编号为E2M4-1。遗传多样性分析结果表明,子群体h的遗传多样性指数高于子群体q(0.1367>0.0998)。该研究为筛选鲮原种群体2个子群体间的特异性分子标记做了初步尝试。
- 叶卫符云朱彩艳夏军红
- 关键词:扩增片段长度多态性
- 鲮原种群体的D-loop序列分析被引量:3
- 2008年
- 设计了1对可从鲮总DNA中扩增出线粒体D-loop区的引物,获得了937bp的鲮D-loop全序列。应用该对引物对鲮原种群体(子群体h11个样本,子群体q10个样本)进行PCR扩增,测序获得了5′端750bp的有效序列。21个个体共检测到15种单倍型,29个变异位点(4%)。遗传多样性分析发现,原种群体的序列差异为1.0%,子群体h与子群体q各自的序列差异为1.2%和0.9%。UPGMA分子系统树显示,用于研究的21个样本相互混杂,子群体h与子群体q并未出现独立的分支,表明该批鲮原种的子群体h和子群体q并非2个相互独立的母系来源。
- 朱彩艳江世贵张殿昌夏军红苏天凤
- 关键词:线粒体控制区
- 海南、深圳和北海斑节对虾群体遗传多样性研究被引量:3
- 2008年
- 采用聚合酶链式反应(PCR)技术对北海、深圳和海南斑节对虾群体共60个个体的延伸因子1-alpha内含子序列进行了扩增,对扩增产物进行克隆转化,并将阳性克隆产物进行序列测定,最终获得了大小约200 bp的可供分析的核苷酸序列。数据分析结果表明:深圳群体的基因多样性为最高,北海群体基因多样性为最低;通过对遗传分化指数Fst的分析,发现北海群体、深圳群体和海南群体之间遗传分化不具有极显著性差异(P>0.05)。UPGMA系统树显示,3个斑节对虾群体形成2大分支,1支由北海群体组成,另1支由海南群体和深圳群体组成。从序列差异的分析中得出,北海群体与海南、深圳群体之间的亲缘关系较远,海南群体与深圳群体之间的亲缘关系较近。
- 熊小飞夏军红苏天凤龚世园
- 关键词:斑节对虾种群结构
- 应用细胞色素b序列对鲷科鱼类进行种类鉴定的可行性研究被引量:5
- 2007年
- 从NCBI分子生物学数据库下载鲷科鱼类10属12种共24条Cytb序列,通过序列比对最终获得1070bp的共有序列。其中,共检测到675个单态位点,393个变异位点,2个未知位点,没有检测到插入缺失。每个种具有的种特征性位点数为4到24个不等,平均约为12.42个。种间遗传距离分布范围为0.105±0.010(SE)到0.220±0.017(SE),均值为0.180±0.0231(SD),而种内遗传距离要小于或等于0.018±0.004(SE),均值为0.007±0.006(SD),因此,种间遗传距离要远远大于种内遗传距离。系统发育分析发现,来源于同一种内的2条序列都被聚为一个类群。以上分析显示不同鲷科种类能够通过Cytb序列较好的进行区分,据此提出,当2个鲷科鱼类个体基于以上Cytb序列计算得到的遗传距离如小于0.018时可以初步判断属于同一种,大于0.105则为不同种。研究为鲷科鱼类的分子种类鉴定提供了部分基础资料。
- 夏军红
- 关键词:鲷科细胞色素B