周宇芳
- 作品数：7 被引量：45H指数：4
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- 青蟹野生与养殖群体遗传多样性的微卫星分析被引量：4
- 2011年
- 利用微卫星分子标记对青蟹东海三门湾野生群体和浙江三门养殖群体的遗传多样性进行分析。6个微卫星位点在2个青蟹群体中共检测到66个等位基因,多态信息含量为0.746～0.895,均表现为高度多态性,可有效应用于青蟹遗传多样性的研究。青蟹野生群体与养殖群体的等位基因数分别为4～18,6～14,平均杂合度分别为0.577,0.561,平均多态信息含量分别为0.779,0.828;群体间遗传分化指数FST值为0.0317,遗传相似性指数为0.7930,遗传距离为0.2319。结果表明,青蟹野生与养殖群体的遗传多样性均较丰富,群体间存在一定的遗传分化。
- 周宇芳舒妙安赵晓枫朱晓宇
- 关键词：青蟹野生群体养殖群体微卫星
- 中国沿海拟穴青蟹群体遗传多样性的微卫星分析被引量：17
- 2011年
- 利用17对微卫星引物对我国沿海7个拟穴青蟹野生群体(杭州湾、三门湾、闽江口、东山湾、珠江口、北部湾、清澜港)进行了遗传多样性分析。结果表明,17个位点在所有青蟹群体中均为高度多态(PIC>0.5),共检测到253个等位基因;7群体的平均等位基因数(A)为9.41～10.94,平均有效等位基因数(Ne)为5.42～6.87,平均杂合度(H)为0.511～0.563,群体遗传多样性水平较高。分子方差分析(AMOVA)结果显示,94.13%的遗传变异存在于群体内,5.87%的遗传变异存在于群体间,两两群体间FST值为0.035 5～0.081 7(P<0.01),表明群体间遗传分化水平中等偏低。Hardy-Weinberg平衡检测表明,7群体普遍存在杂合子缺失现象。青蟹群体间遗传距离为0.253 0～0.571 9,UPGMA聚类分析表明,杭州湾与三门湾群体首先聚在一起,再与闽江口群体、东山湾群体聚为一支;珠江口群体与清澜港群体聚为另一支;两分支最后与北部湾群体聚类在一起。
- 舒妙安周宇芳朱晓宇赵晓枫郭晓令
- 关键词：拟穴青蟹野生群体微卫星
- 长江中下游黄鳝遗传多样性的微卫星分析被引量：9
- 2011年
- 为了解我国长江中下游地区野生黄鳝(Monopterus albus)的种质资源现状,利用黄鳝微卫星分子标记分析我国长江中下游4个黄鳝野生群体(湖北群体、安徽群体、江苏群体和浙江群体)的遗传多样性水平。通过磁珠富集法获得50个黄鳝微卫星序列,设计并合成了30对微卫星引物,经筛选得到8对多态性稳定的引物,均为高度多态位点。每对引物扩增得到等位基因数12-26,平均等位基因数17。4个群体的平均多态信息含量分别为0.804、0.864、0.824和0.736,平均等位基因数分别为9.13、11.00、9.00和7.25,平均期望杂合度分别为0.865、0.918、0.882和0.813,表明4个黄鳝群体遗传多样性丰富,其中安徽群体遗传多样性水平最高,浙江群体相对较低。4个群体间遗传分化指数(FST)为0.031 2-0.096 5,6.28%的遗传变异存在于群体间,表明4个群体间存在一定的遗传分化。聚类分析显示,浙江群体与安徽群体先聚在一起,再与江苏群体聚为一支,湖北群体单独聚为一支。
- 周宇芳胡杭娇张龙韬舒妙安
- 关键词：黄鳝磁珠富集法微卫星标记
- 青蟹微卫星DNA的筛选及特征分析被引量：5
- 2010年
- 利用磁珠富集法,结合生物素标记的(CA)16寡核苷酸探针从青蟹基因组MboI酶切片段中筛选微卫星DNA序列。将得到的片段与pGEM-T Easy载体连接后转化克隆构建微卫星富集文库。经PCR筛选检测,对89个阳性克隆进行测序,其中52个克隆中含有64个微卫星,完全型占87.50%,重复次数超过11次的占78.12%。根据所获微卫星的侧翼序列设计并合成了30对引物,通过优化PCR反应条件,并在35只青蟹个体中进行PCR扩增检测,最终获得了10对具有多态性的引物,为进一步开展青蟹遗传多样性分析、遗传图谱构建等研究提供了基础资料。
- 周宇芳舒妙安朱晓宇
- 关键词：青蟹磁珠富集法微卫星DNA
- 拟穴青蟹(Scylla paramamosain)两种Ⅰ型高血糖激素基因全长cDNA的克隆及组织表达分析被引量：4
- 2012年
- 采用RT-PCR及RACE技术,从拟穴青蟹眼柄组织中克隆了两种Ⅰ型高血糖激素CHH基因(分别命名为C1与C2)cDNA全序列。序列分析结果表明:C1基因全长1859bp,开放阅读框长420bp,编码139个氨基酸,分子量为15.326kDa,等电点为5.540;C2基因全长1739bp,开放阅读框长426bp,编码141个氨基酸,分子量为15.621kDa,等电点为7.618。与其它物种CHH氨基酸序列进行同源性比较分析显示,拟穴青蟹CHH基因与榄绿青蟹CHH基因同源性最高(92%),依次为日本鲟(80%)、三疣梭子蟹(78%)。聚类分析表明,拟穴青蟹CHH氨基酸序列与榄绿青蟹和日本鲟紧密聚为一支。经荧光定量检测,拟穴青蟹CHH基因在眼柄、肝胰腺、心脏、肠中表达量较高,鳃、胃中表达量很少,肌肉中表达极少。盐度骤变试验结果表明:盐度胁迫24h后,C2的表达量是C1的30倍以上;C2基因盐度5时与对照组的表达量差异不显著(P>0.05),盐度15时差异显著(P<0.05),盐度22、25、30时差异极显著(P<0.01);盐度变化越大,C2的表达量越大。上述结果为进一步深入研究CHH基因的功能及调控机理奠定基础。
- 舒妙安张龙韬周宇芳胡杭娇徐宾朋郭晓令
- 关键词：拟穴青蟹基因克隆
- 三角帆蚌微卫星的分离及遗传多样性分析被引量：3
- 2010年
- 通过磁珠富集法筛选三角帆蚌微卫星标记并对其特征进行分析。用生物素标记的寡核苷酸探针（CA）16进行微卫星序列的富集,挑选96个阳性克隆测序获得77个含有微卫星的DNA序列,设计并合成了30对微卫星引物。以三角帆蚌（Hyriopsis cumingii）基因组DNA为模板,进行PCR扩增,结果筛选出11个多态性微卫星标记,1对引物等位基因数（NA）3~14,观察杂合度（HO）0.098~0.976,期望杂合度（He）0.336~0.917,多态信息含量（PIC）0.306~0.898,11个微卫星位点都偏离Hardy-Weinberg平衡,呈极显著差异（P〈0.01）,说明洞庭湖养殖群体遗传多样性不高,遗传变异小,可能存在近交现象。
- 朱晓宇周宇芳舒妙安
- 关键词：三角帆蚌磁珠富集
- 青蟹种质资源研究进展被引量：7
- 2012年
- 青蟹广泛分布于我国东南沿海,是我国重要的海水经济蟹类。从青蟹形态学、细胞遗传学、生化遗传学及分子遗传学等方面阐述了青蟹种质资源研究现状及进展,探讨了青蟹种质资源研究的发展方向,为系统开展青蟹种质资源研究提供了基础资料。
- 周宇芳张龙韬胡杭娇舒妙安
- 关键词：青蟹种质资源线粒体DNA
