丁裕斌
- 作品数：90 被引量：217H指数：8
- 供职机构：重庆医科大学公共卫生与管理学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金重庆市自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学文化科学更多>>
- PPBP基因通过调控滋养细胞融合参与胎儿生长受限的发生
- 2021年
- 胎盘发育异常与胎儿生长受限(fetal growth restriction,FGR)密切相关,但其发生机制并未被完全阐明。该文利用GEO数据库获得97个正常胎盘样本和81个FGR胎盘样本的基因芯片数据集,生物信息学分析发现,差异表达基因(DE-mRNAs)主要富集于趋化因子、HIF1α和mTOR等信号通路,参与细胞炎症、增殖、凋亡和缺氧应答反应等生物过程。PPI网络分析共发现12个关键基因(hub gene)。利用RT-qPCR验证PPI网络分析发现的关键基因(hub基因) PPBP、DUSP1、LEP和CXCL10等与生物信息学分析结果一致。FGR胎盘组织病理学检查显示,与正常胎盘相比,FGR胎盘末端绒毛发育不良、合胞体数量增加以及合体化过程受损。进一步的RT-qPCR方法证实,PPBP在FGR组胎盘中的表达低于正常组胎盘组织。PPBP在弗斯可林诱导BeWo细胞合体化过程中表达上调。干扰PPBP后BeWo细胞融合比率和合体化标记物β-hCG、Syn-1和GCM1的表达以及CREB磷酸化水平下调。研究初步发现,PPBP可能通过调控滋养细胞融合分化参与FGR的发生发展。
- 阮灵灵刘太行吴芝红王永恒丁裕斌丁裕斌付利娟
- 关键词：胎儿生长受限滋养细胞
- Hsa-miR-200a真核表达载体的构建及鉴定
- 2012年
- 目的:通过构建及鉴定miR-200a的真核表达载体pcDNA3.1(+)-miR-200a,为进一步研究miR-200a的功能奠定实验基础。方法:RT-PCR扩增pre-miR-200a基因序列,连接于表达载体pcDNA3.1(+)中,对重组质粒双酶切鉴定并测序验证。结果:pcDNA3.1(+)-miR-200a真核表达载体经酶切及测序鉴定正确。结论:pcDNA3.1(+)-miR-200a真核表达载体构建成功,为下一步深入研究miR-200a的生物学功能和验证miR-200a的靶基因提供有效工具。
- 陈倩陈雪梅何俊琳王应雄丁裕斌杨德辉刘学庆
- 关键词：MICRORNAS真核表达载体肿瘤
- c-Myc基因在人滋养细胞合体化中的作用被引量：1
- 2020年
- c-Myc属于bHLH家族转录因子,在人多能干细胞维持细胞自我更新中发挥着重要作用,但在人胎盘滋养细胞分化中的功能尚不明确。该研究采用免疫组化、免疫荧光、Western blot及qRT-PCR技术,初步证实人早孕绒毛、原代滋养细胞及福斯科林诱导BeWo细胞合体化前后c-Myc均高表达于细胞滋养细胞,并在滋养细胞合体化过程中表达下调。qRT-PCR检测c-Myc网络相关因子在滋养细胞合体化过程中的作用,发现细胞周期相关因子CCNA2及CDK2表达下调,CDKN2A表达上调;c-Myc调控网络中滋养细胞干性相关因子OCT4、SOX2及hTERT在滋养细胞合体化过程中表达下调。研究初步发现,c-Myc可能通过其调控网络及细胞周期,影响滋养细胞增殖及分化平衡,从而参与滋养细胞合体化。
- 徐增伟王永恒刘太行王应雄丁裕斌
- 关键词：滋养细胞C-MYCBEWO
- 基于基因芯片整合分析筛选及验证BeWo细胞合体化相关调控因子被引量：1
- 2019年
- 目的:合体滋养层细胞(syncytiotrophoblast,STB)是一类多核化上皮细胞位于人类胎盘最外层,由单核滋养细胞(cytotrophoblast,CTB)分化、融合而来,肩负妊娠维持关键激素的分泌和母胎间营养交换的重要职责,也是母胎屏障重要组成部分之一。然而,目前关于胎盘滋养细胞的合体化过程的调控机制仍不明确。本研究即利用生物信息学的方法筛选并初步验证潜在调控绒毛膜癌BeWo细胞合体化调控的关键基因。方法:从GEO数据库检索并下载BeWo细胞合体化前后的基因芯片数据集,并利用生物信息学分析方法对所有相关数据集进行综合分析,筛选出差异表达基因并进行GO及KEGG聚类分析,进一步通过PPI蛋白互作网络寻找节点基因,最后利用qRT-PCR验证候选基因在合体化前后的差异表达。结果:从2组数据中共筛选出137个差异表达基因,其中25个差异基因为2组数据集共有,参与细胞迁移、细胞黏附、激素代谢、MAPK信号通路等。进一步借助蛋白质互作网络分析,得到3个候选基因并通过qRT-PCR验证,结果与信息分析结果一致。结论:本研究为滋养细胞合体化研究提供了潜在靶基因,也为解析其分子调控机制提供了线索。
- 顾珺巍丁裕斌付利娟王永恒王应雄刘太行
- 关键词：BEWO基因芯片生物信息
- 地西泮结合抑制因子调控胎盘滋养细胞合成类固醇激素基因的表达被引量：3
- 2021年
- 目的:探讨地西泮结合抑制因子(diazepam binding inhibitor,DBI)是否参与胎盘滋养细胞合成类固醇激素基因表达的调控。方法:收集自然流产以及正常孕6~8周绒毛组织,Western blot比较2组样本DBI蛋白的表达,免疫组织化学分析DBI在绒毛组织中的表达和定位。利用siRNA分别敲低DBI表达并采用Forskolin FSK诱导BeWo滋养细胞合体化,免疫荧光检测DBI的蛋白表达、RT-qPCR检测激素合成酶的表达水平,EdU试剂盒检测细胞增殖能力。结果:自然流产绒毛中的DBI较正常组呈现下调表达;FSK可诱导DBI及激素合成酶P450scc、HSD3β1和CYP19A1上调表达;而敲低DBI不仅可以抑制合体化进程,同时也抑制激素合成酶的表达。结论:DBI可能通过调控P450scc介导滋养细胞类固醇激素合成功能,进而参与胎盘发育。
- 黄成渝张雪段福梅徐增伟刘太行陈雪梅丁裕斌
- 关键词：滋养细胞激素合成增殖自然流产
- 滋养层细胞侵袭相关基因表达谱分析被引量：5
- 2007年
- 分离收集正常妊娠第8～12周的细胞滋养层细胞和绒毛外滋养层细胞,提取细胞总RNA,制备cRNA探针并与AffymetrixU133plus2.0基因芯片进行杂交,获得正常细胞滋养层细胞和绒毛外滋养层细胞基因表达谱芯片。经计算机分析共筛选到1318个差异表达基因,其中上调基因813个,下调505个。所有差异表达基因按GeneOntoloty功能分类标准进行了功能检索。为胚胎发育早期绒毛外滋养层细胞侵袭的基因调控机制的研究提供了实验基础。
- 范才波何俊琳王应雄刘学庆陈雪梅丁裕斌
- 关键词：细胞滋养层细胞基因芯片基因表达谱
- 小鼠围着床期子宫内膜甲基化CpG结合域蛋白2的表达规律
- 2014年
- 为研究甲基化CpG结合域蛋白2(methyl-CpG binding domain protein 2,MBD2)在围植入期小鼠子宫内膜的表达规律,通过采用实时荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,qPCR)、Western blot和免疫组化技术检测未孕小鼠(d0)和不同孕天小鼠子宫MBD2的表达情况。qPCR结果显示,d0至d7的小鼠子宫内膜组织均有MBD2 mRNA表达,在d5至d7高表达。MBD2蛋白在子宫内膜的表达规律与qPCR结果相符。MBD2蛋白在孕d1到d4中度表达于腔上皮、腺上皮和基质细胞,在d5至d7基质细胞表达增强,主要表达于蜕膜区。假孕小鼠子宫内膜中,MBD2在腔上皮、腺上皮和基质细胞中中度表达,d5至d7基质细胞表达明显减弱。动物模型中,宫角注射MBD2基因反义寡聚脱氧核苷酸,可抑制MBD2的表达,降低人工诱导蜕膜化反应和蜕膜化标志物PRL的表达。MBD2在早孕小鼠子宫内膜的表达模式提示其可能参与了蜕膜化过程。
- 周一青何俊琳陈雪梅王应雄刘学庆丁裕斌
- 关键词：小鼠蜕膜化
- 甘草甜素在改善多囊卵巢综合征中的应用及其研究方法
- 本发明公开了甘草甜素在改善多囊卵巢综合征中的应用及其研究方法，涉及医药技术领域；甘草甜素能够改善子宫肿胀现象；抑制HMGB1在血清和卵巢组织中的表达；通过抑制HMGB1的表达以改善体内外炎症因子表达的升高，进而改善子宫组...
- 丁裕斌冯倩杨君璞
- DNA甲基化数据分析方法和软件应用被引量：2
- 2012年
- 目的分析DNA甲基化芯片实验过程质量控制方法、数据统计分析要点及实验结果的验证和数据的可视化处理。方法利用文献、DNA甲基化实验数据探讨DNA甲基化研究中的方法学。结果 DNA甲基化芯片初筛异常过程应多在步骤质量控制工作中,包括DNA片段化、免疫共沉淀阳性对照的选择、去除原始扫描噪音信号和数据均一化处理。DNA甲基化芯片的结果可采用常用的甲基化特异性PCR(MSP)和甲基化测序PCR(BSP),引物设计软件包括Methprimer和Methyl Primer Ex-press。DNA甲基化芯片分析数据的可视软件为Signal map;BSP结果的可视化可采用Windows系统下的执行软件QUMA和BISMA。结论 DNA甲基化研究,应从多角度控制实验的设计和数据的产生及结果的分析。
- 付利娟夏映曦何俊琳刘学庆陈雪梅王应雄丁裕斌
- 关键词：DNA甲基化数据分析
- Nme2基因参与小鼠基质细胞蜕膜化过程
- 2017年
- 目的:检测Nme2(nucleoside diphosphate kinase 2)基因在小鼠早期妊娠和人工诱导蜕膜化的子宫内膜组织中的表达规律;探究Nme2基因与子宫基质细胞蜕膜化的相关性。方法:利用免疫组织化学、Western blot和实时荧光定量PCR(q RTPCR)分别检测小鼠妊娠第5天着床点(D5IS)、着床旁(D5IIS),D6IS、D6IIS、D8IS、D8IIS及人工诱导蜕膜化模型小鼠子宫内膜中Nme2的表达定位,m RNA和蛋白质水平的表达水平。结果:小鼠D5、D6、D8子宫内膜中着床点Nme2基因的m RNA和蛋白水平的表达明显高于着床旁;免疫组织化学结果显示Nme2表达定位表达于D5着床点的初级蜕膜区(primary decidua region,PDZ)、D6和D8着床点的次级蜕膜区(secondary decidua region,SDZ);人工诱导蜕膜化模型中,Nme2基因的m RNA和蛋白质水平在诱导组的表达明显高于对照组。结论:Nme2基因的表达上调与小鼠基质细胞的蜕膜化过程相关。
- 张雪张爽陈雪梅刘学庆何俊琳王应雄丁裕斌付利娟
- 关键词：子宫内膜蜕膜化
