黄国英
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：北京养猪育种中心更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目北京市科技计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 美系大白猪生长性状全基因组关联分析被引量：1
- 2018年
- 猪的生长性状是重要的经济性状之一,直接影响到养猪企业的经济效益,同时还间接反映了猪育种工作的现状和进展。为了了解猪生长性状的遗传机制,寻找与生长性状显著相关的位点,进而定位与生长性状有关联的功能基因,研究利用全基因组关联分析(Genome-wide Association Study, GWAS)研究猪的生长性状相关基因。试验选择571头美系大白猪作为研究对象,采用基于线性模型的单标记回归方法,同时借助Illumina猪80 K高密度SNP芯片(共有68 528个SNP位点)对样本个体的基因型进行分型,对大白猪的两个生长性状100 kg体重活体的背膘厚和达100 kg体重的日龄,进行了全基因组关联分析。研究将群体进行全基因组关联分析后使用FDR方法对关联分析的结果进行多重检验校正,发现了4个位于15号染色体上与100 kg体重日龄性状相关的基因组水平显著的SNP位点,分别是WU_10.2_15_142776834、WU_10.2_15_142743420、WU_10.2_15_142698412、WU_10.2_15_142730007。2个位于1号染色体上与活体背膘厚性状相关的基因组水平显著的SNP位点,分别是ALGA0005769、ASGA0004384。进而利用EnseMble在线平台的猪SusScrofa10.2版本数据库,将显著的SNP位点向上下游各扩展1 Mb进行基因富集分析,定位到了可能与生长性状有关联的基因。其中,与100 kg体重日龄相关的基因有9个,分别是SLC19A3、CCL20、DAW1、SPHKAP、RHBDD1、IRS1、COL4A4、TM4SF20、AGFG1;与活体背膘厚相关的基因有16个,分别是ONECUT1、ARPP19、MYO5A、MYO5C、GNB5、BCL2L10、MAPK6、LEO1、TMOD3、SCG3、LYSMD2、TMOD2、DMXL2、GLDN、CYP19A1、TNFAIP8L3。结论,ARPP19可以控制有丝分裂,ONEUT1具有促进细胞分裂和生长发育的功能。因此这两个基因最可能与生长性状存在功能联系。
- 孟庆利高虹黄国英丁向东周海深
- 关键词：生长性状全基因组关联分析生物信息学分析
- 猪VEGF基因5′调控区多态性与产仔数的关联分析被引量：1
- 2011年
- 研究通过PCR-SSCP技术对大白猪、长白猪和杜洛克猪共计574头母猪的VEGF基因进行多态分析,并将基因多态性与猪总产仔数(TNB)和产活仔数(NBA)进行关联分析,旨在探讨猪VEGF基因多态性对其产仔数的影响。结果表明:在VEGF 5′调控区内有2个突变位点。P1产物第191位点处由A突变为G,在3个猪品种中只发现AA、AG 2种基因型,其中AG为优势基因型,A为优势等位基因。长白猪第1胎中AG型的TNB和NBA比AA型分别高出1.34头和1.44头(P<0.01),杜洛克猪所有胎次中AG与AA的TNB差异显著(P<0.05),NBA差异极显著(P<0.01)。P2产物第103位点处由C突变为T,在3个猪品种中发现TT、TC、CC 3种基因型,T为优势等位基因。TT、TC分别比CC型的TNB高出2.63头(P<0.05),在杜洛克所有胎次中TC比TT的TNB和NBA分别高出0.84头和0.94头(P<0.05)。P1位点和P2位点能否作为产仔性状的标记基因还需进一步研究。
- 陈文成傅金銮付言峰黄国英王爱国
- 关键词：VEGF基因PCR-SSCP多态性产仔数
- 养猪生产信息网络平台的开发与应用
- 2013年
- 随着养猪规模的不断扩大,管理水平的逐步提升,信息化技术的快速发展,集团化的养猪生产、育种管理面临严峻的挑战,原有的管理方式和管理工具已不能适应目前的养猪生产管理需求。因此,北京养猪育种中心组织开发建设了养猪生产信息网络化平台——KFNetsKing,该平台的建设与应用消除了"信息孤岛"、实现了信息整合和共享、简化了操作流程、实现了细致化、量化的指标性管理、及时准确地统计了生产、育种数据,为联合育种的实施提供快捷的计算,为管理者提供了实时的数据,以便于做出精准的决策。
- 卢纪和武建亮孟庆利鲁春刚黄国英
- 关键词：信息网络平台
