目的了解近10年来乳腺癌转移相关基因的研究概况,寻找未来的研究方向。方法文献检索数据库为Embase、Medline/Pubmed及BIOSIS Preview 3个数据库。文献检索年限为2001年1月至2010年12月,对最终纳入的363篇文献的出版年、作者、国家、研究机构、发表期刊及基因进行计量学分析。结果近10年乳腺癌转移基因相关文献在2001～2007年间呈缓慢增长趋势,2008～2010年开始呈现明显上升趋势。发文量最大的国家、期刊、研究机构分别为中国、Breast Cancer Research andTreatment、天津医科大学。论文中涉及的乳腺癌转移相关基因共计567个,研究最多的基因为ERBB2。结论近10年间对乳腺癌转移相关基因的研究逐渐增多,中国在该研究领域也有一定的优势。采用多基因模型评估乳腺癌转移风险将是未来研究的趋势。
目的:筛选胃癌患病风险关键基因,为进一步相关性研究提供参考。方法:检索Pubmed/Medline和Embase数据库,收集胃癌患病风险相关基因的文献,运用生物信息学的方法对获得的基因进行分析。结果:954篇文献符合要求,共涉及268个基因,其中不同功能的GO分类780种,京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路67种,而贝叶斯因子>1、P≤0.001且误判率≤0.001的GO分类有94种,KEGG通路有6种,主要涉及应激反应、DNA损伤修复、细胞生理调控过程、细胞凋亡、免疫反应、细胞因子与细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、Jak-STAT信号通路以及MAPK信号通路相关。所涉及基因的蛋白产物通过在线String 9.0软件构建蛋白网络,运用Cytoscape 2.8.2软件将构建的蛋白网络图可视化及量化。筛出24个关键候选基因,包括STAT3、EGFR、NFKB1、GSTP1、IL4、IFNG、PARP1、MMP9、JUN、IL6、TNF、IL1B、CD4、CDH1、SMAD4、HRAS、PTGS2、EGF、VEGFA、MLH1、TP53、CASP3、TGFB1和CCND1,其中5个关键基因是PTGS2、TNF、IL6、NFKB1和TP53。结论:胃癌患病风险关键基因可为胃癌遗传易感性研究提供参考,针对这些基因的大样本跨种族及高质量的临床研究可能是未来的方向。
