为探讨了甘南尕海自然保护区草原毛虫(Gynaephora aureate Ghou et Ying)肠道细菌群落结构组成,采集甘南尕海高寒草地3个不同地点的4龄草原毛虫幼虫,通过Illumina Hi Seq高通量测序平台对甘南尕海自然保护区草原毛虫肠道细菌群落结构组成进行分析,总共获得了206 098条序列。甘南尕海草原毛虫中肠的细菌由Proteobacteria(变形菌门)、Bacteroidetes(拟杆菌门)、Firmicutes(厚壁菌门)、Actinobacteria(放线菌门)、Tenericutes(软壁菌门)、Verrucomicrobia(疣微菌门)、Fusobacteria(梭杆菌门)、Acidobacteria(酸杆菌)、Deinococcus-Thermus(异常球菌-栖热菌门)和Planctomycetes(浮霉菌门)等10个门组成,优势菌群为Proteobacteria和Bacteroidetes。在属的水平上,Providencia(普罗威登斯菌)含量最丰富,其次是Brevundimonas(单胞菌属)、Bacteroides(拟杆菌属)和Methylotenera(甲基柔膜菌属)。阐明了甘南尕海草原毛虫肠道细菌群落的组成,为研究草原毛虫肠道微生物和草原毛虫对人畜的危害提供理论基础。
【目的】研究橘小实蝇(Bactrocera dorsalis)3个种群(实验室正常喂养种群、实验室无菌糖水喂养种群和野生种群)成虫肠道可培养细菌的群落结构组成。【方法】利用16S r RNA基因的聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)分析技术,结合菌落形态观察和生理生化特征鉴定细菌种类。【结果】从橘小实蝇3个种群成虫肠道600株可培养细菌得到53种不同细菌遗传型,分属于肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、肠球菌科(Enterococcaceae)和芽孢杆菌科(Bacillaceae)等3个科。其中肠杆菌科是肠道可培养细菌最优势的细菌种类。同样以序列相似性大于97%的菌株归为相同的细菌种类为标准,找到了橘小实蝇3个种群可培养细菌的共有菌种,结合菌落形态观察和生理生化特征鉴定,确定共有菌种为肠杆菌属5株,克雷伯氏菌属2株,柠檬酸杆菌属1株,泛菌属1株,肠球菌属2株,以及芽孢杆菌属4株。【结论】通过研究橘小实蝇成虫肠道可培养细菌群落结构组成,可为探讨肠道菌群对寄主的生理功能和生态学意义奠定基础,最终为利用微生物防治此类害虫提供新思路。
草原毛虫(Gynaephora ruergensis Chou et yin)是我国高原牧草中的一种有害害虫。草原毛虫核型多角体病毒新分离株(EupsNPV-Gr)具有典型的杆状病毒特征,呈单粒包埋型病毒粒子,ODV颗粒呈不规则的多边形,直径为1.0μm~1.35μm。EupsNPV-Gr能有效杀灭草原毛虫幼虫,它对草原毛虫的半致死浓度LC_(50)为4×10^(4)PIB/mL,是一种理想的生物防治剂。本研究对第一个EupsNPV-Gr基因组进行了测序和鉴定。EupsNPV-Gr基因组全长140684bp,包含134个开放阅读框。它与茶毛虫核型多角体病毒(EupsNPV)关系最为密切,序列同源性高达99%。系统进化分析表明,EupsNPV-Gr属于杆状病毒科alpha杆状病毒属,根据公认的种属划分标准,EupsNPV-Gr是EupsNPV的一个株系。新报道的基因组为研究该物种毒力的分子机制提供了基础。
