郭晓波
- 作品数：4 被引量：4H指数：2
- 供职机构：上海交通大学医学院附属瑞金医院更多>>
- 发文基金：上海市浦江人才计划项目国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 胃癌相关基因启动子甲基化的研究进展被引量：2
- 2009年
- 随着人类基因组“序列图”的绘制成功,以测序为主的“结构基因组学”研究已趋于尾声．基因组学进入了后基因组学（也称“功能基因组学”）时代。人类基因组约由数亿个碱基对构成。在功能基因组时代，如何在这浩如烟海的序列数据中定位基因组中的各种功能单元及建立这些能功单元间的相互作用网络，从而在分子水平上揭示肿瘤的发生机制已成为巨大挑战。
- 郭晓波于颖彦
- 关键词：肿瘤相关基因启动子转录调控
- 胃癌相关基因IRX1的表达调控机制研究
- 目的： IRX1基因是本研究室前期在胃癌的等位基因杂合性丢失(LOH)筛查中锁定的胃癌相关新基因。该基因位于5号染色体5p15.33位点,属于同源盒类转录因子。前期一系列分析显示,胃癌中该基因表达明显下降,但测序分析并未...
- 郭晓波
- 文献传递
- 胃癌临床病理分期相关基因MGP的发现及其表达验证被引量：2
- 2010年
- 目的通过对基因芯片数据库中一组大样本胃癌表达谱芯片的数据挖掘分析，筛选并验证与临床病理分期及预后密切相关的基因。方法检索基因表达谱芯片数据库，对其中符合分析要求（大样本、病理分型、临床病理分期以及随访资料齐全）的胃癌表达谱芯片数据进行再挖掘分析。利用基因芯片显著性差异基因分析（SAM）方法筛选出不同临床病理分期的差异基因，并通过逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）、即时荧光定量PCR、Westernblot方法验证胃癌细胞株及54例胃癌组织MGP表达，利用免疫组织化学EnVision法观察MGP在胃癌中的定位特点。结果通过对GEO开放数据库内GES4007数据的挖掘分析，发现14个基因表达与胃癌临床病理分期显著相关，其中MGP基因表达升高与临床病理分期呈正相关，对预后有明显影响。定量PCR和Westernblot方法证实MGP在胃癌细胞系中存在不同程度表达，免疫组织化学染色显示MGP定位于肿瘤细胞胞质内。RT．PCR分析54例胃癌组织和对应癌旁组织内mRNA，结果显示22例癌组织MGP的mRNA表达明显高于癌旁组织（40．7％）。MGP的高表达与胃癌临床病理分期（P=0．001）和预后呈明显相关（P=0．006）。结论公共数据库存储的芯片数据具有再分析价值。MGP基因是与胃癌临床病理分期和预后相关的新型分子标志物。
- 郭磊郭晓波蒋金玲张佳年计骏刘炳亚朱正纲于颖彦
- 关键词：寡核苷酸序列分析MATRIXGLAPROTEIN
- 同源盒基因IRX1的启动子克隆及其在人胃黏膜细胞中的启动活性分析
- 2010年
- 目的 克隆同源盒基因IRX1的核心启动子序列,并探讨其转录调控机制.方法 通过生物信息学预测IRX1基因启动子范围：利用PCR方法扩增并构建含有IRX1基因启动子不同片段的真核报告基因质粒,瞬时转染GES-1胃黏膜细胞,通过检测不同片段的荧光素酶报告质粒活性,判断不同片段的启动子活性.结果 生物信息学预测IRX1基因启动子位于转录起始点上游700 bp范围内.通过PCR技术扩增获得IRX1基因5＇侧翼区8个截短片段报告基因质粒,其活性由大到小依次为p-416＞p-584＞p-715＞p-350＞p-687＞p-320＞p-188＞p-92 除p-92与p-188片段外,其余各片段与PGL3-basic空载体的差异均有统计学意义（均P＜0.05）,其中以p-416片段活性最强,片段p-320与片段p-188之间出现较大活性落差.结论 IRX1基因上游序列启动子以p-416转录活性最高,核心启动子位于-320～-188区间,该区间具有Sp1、TFⅡD等转录因子结合序列,是下一步转录调控机制研究的重要位点.
- 郭晓波郭磊吴建林刘卫仁计骏张佳年刘炳亚朱正纲于颖彦
- 关键词：启动子报告基因胃黏膜细胞
