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郑喜亮
作品数:
2
被引量:5
H指数:1
供职机构:
吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
理学
化学工程
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合作作者
张红星
吉林大学理论化学研究所理论化学...
孙家锺
吉林大学理论化学研究所理论化学...
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2006
1篇
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双金属存在下整合酶和抑制剂5CITEP的分子对接研究
被引量:5
2006年
在H IV-1整合酶(IN)和5C ITEP复合物晶体结构的基础上,用分子对接程序(A ffin ity)将含有单Mg2+和双Mg2+的H IV-1 IN核心区与抑制剂5C ITEP进行对接,获得了能形成复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间的相互作用能和结构分析给出此种抑制剂的结合模式,并与晶体结构进行比较,揭示出引入的第二个Mg2+原子在整合过程中所起的重要作用.前后相互作用能的变化趋势很明显,配体和受体的作用模式比单Mg2+体系更加清晰.由单Mg2+体系的4种作用方式改变到双Mg2+体系的两种作用方式,相互作用能提高了将近40 kJ/mol.为基于整合酶结构的药物设计提供了参考信息.
郑喜亮
张红星
孙家锺
关键词:
分子对接
双金属
HIV-1IN与抑制剂的分子对接研究
本论文利用分子对接方法对HIV-1 整合酶(IN)与抑制剂5CITEP相互作用方式进行了探讨,讨论第二个Mg2+对在整合过程中所起的重要作用,为基于整合酶结构的药物设计提供了参考信息。还利用该方法对一些有研究前景的抑制剂...
郑喜亮
关键词:
分子对接
抑制剂
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