赵涵
- 作品数:77 被引量:243H指数:10
- 供职机构:江苏省农业科学院更多>>
- 发文基金:江苏省农业科技自主创新基金国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>
- 基于基因组重测序信息构建玉米第5染色体的片段代换系被引量:1
- 2015年
- 利用玉米自交系齐319与郑58杂交衍生的重组自交系群体,通过筛选剩余杂合体(RHL)以达到快速构建CSSLs的目的。在接近纯合的重组自交系群体中,结合基因组重测序信息扫描玉米第5染色体上的In Del位点,定点开发分子标记,筛选剩余杂合体进行自交快速获得了多个位点的染色体片段代换系。在玉米5号染色体的19 130 718 bp^214 379 898 bp区间内,共获得41个染色体片段代换系。两个染色体片段代换系位点间的间距为0.2~26.4 Mb,平均为2.5 Mb。其中8个染色体片段代换系群体中只含有1个多态位点,为单片段代换系。本研究所建立的CSSLs可为玉米第5染色体上QTL的精细定位及功能分析提供支撑,并为玉米育种提供中间材料。
- 林峰葛敏宝华宾赵涵
- 关键词:玉米染色体片段代换系
- 藜麦二态性InDel分子标记及其开发方法与应用
- 本发明属于分子标记技术领域,具体涉及一种藜麦二态性InDel分子标记及其开发方法与应用,该分子标记通过38个位点所对应的正向、反向引物对来对异源四倍体藜麦基因分型,可极大的提高藜麦基因分型的准确性,降低了高多态性分子标记...
- 张体付赵涵
- 文献传递
- 基于高通量测序的大麦InDel标记开发及应用被引量:12
- 2020年
- 分子标记是遗传研究的基础工具,广泛应用于遗传多样性研究、种质鉴定、遗传图谱构建和基因定位等领域。本研究基于大麦的全基因组重测序数据鉴定出的二态性SNP位点,开发出遍布全基因组的118对InDel引物。以49份不同地理来源的大麦种质检测其有效性,筛选出2个等位基因的共显性InDel标记72对,进一步对288份大麦种质进行遗传距离分析及构建系统发育树。结果显示,筛选到32个有效性的核心InDel标记,覆盖大麦7条染色体上,平均PIC为0.44,平均MAF为0.34;基于InDel标记位点的供试大麦的系统发育树结果揭示供试大麦具有丰富的遗传多样性,且能够将具有相同地理来源的多数品种聚为一类。表明开发的32个二态性InDel标记可有效地用于鉴定品种间的亲缘关系,且丰富了大麦品种鉴定的分子标记。上述核心InDel标记在大麦品种鉴定、大麦资源亲缘关系分析以及群体划分方面具有一定的理论意义和应用价值。
- 徐婷婷汪巧玲邹淑琼狄佳春杨欣朱银赵涵颜伟
- 关键词:大麦INDEL标记
- 植物品种DNA指纹鉴定原理及其鉴定方案被引量:10
- 2018年
- 植物品种鉴定对保证种子质量及粮食安全具有重要意义。DNA指纹技术在植物品种鉴定中具有独特的优势,DNA指纹鉴定已从间接证据转变为主流方法。本研究总结提炼出品种DNA指纹鉴定技术方案—核心位点组合法,即采用一套固定的核心位点组合来鉴别不同品种,该方案自2003年提出以来不断得到完善:一是在原有核心位点的基础上增加位点数量形成扩展位点组合,以应对派生品种涌现对品种鉴定的更高要求;二是将核心位点进一步分解为群特异位点和品种特异位点,群特异位点发挥快速准确分群的功能,品种特异位点则具有较强的品种鉴别功能;三是在借鉴二倍体作物成熟经验的基础上,进一步提出适合多倍体作物的核心位点组合,即二倍体化的单标记法和组合标记法。从未来发展趋势看,测序技术、基因编辑技术等新技术的飞速发展将大大推动DNA指纹检测方案的完善,提升其在实践中的应用效果。本研究系统阐述了品种鉴定的概念及特点,总结了品种DNA指纹鉴定的主要类型及鉴定思路,提炼了品种DNA指纹鉴定的技术方案,展望了品种DNA指纹鉴定的未来发展趋势,以期对各作物DNA指纹品种鉴定标准的研制及分子技术在DNA指纹库构建和品种鉴定中的应用发挥指导作用。
- 王凤格田红丽易红梅赵涵霍永学匡猛张力科吕远大丁曼卿赵久然
- 关键词:植物DNA指纹
- 控制玉米籽粒淀粉含量QTL定位
- 玉米是我国第一大粮食作物,在国民经济中占有重要的作用。玉米籽粒主要由蛋白质、淀粉、油分及维生素等成分组成。其中,淀粉含量约为75%。目前控制淀粉含量的基因或位点尚不明确。我们利用玉米重组自交系群体(211个单株)对玉米淀...
- 张晓林吕远大李坦赵涵
- 文献传递
- 激发江苏种业强“芯”活力被引量:2
- 2022年
- 粮食安全是“国之大者”,是影响国家长治久安的重要因素。种子是我国粮食安全的关键,种业是保障国家粮食安全的核心所在。习近平总书记高度重视种业发展,强调要实现种业科技自立自强、种源自主可控,为种业高质量发展指明方向。江苏地处东部沿海,气候条件优越、种质资源丰富,既是我国粮食作物的重要产区,也是种子生产和使用大省。为响应国家种业振兴行动,我们应牢牢扭住种业科技创新不松劲,深入推进种业体制改革,强化创新能力建设,积极培育创新竞争主体,为推进种业高质量发展赋能添力。
- 赵涵袁娜
- 关键词:粮食安全自立自强种业科技种业发展创新能力建设
- 调控玉米籽粒长度主效QTL的分子标记及其应用
- 本发明涉及作物分子育种领域,具体公开了一种调控玉米籽粒长度主效QTL的分子标记及其应用。调控玉米籽粒长度主效QTL的分子标记,由InDel14和umc1269两对引物组成。一种辅助选择长籽粒玉米的方法,包括:提取待测玉米...
- 张体付赵涵
- 文献传递
- 藜麦EST-SSR分子标记及其开发方法与应用
- 本发明涉及分子标记技术领域,具体涉及藜麦EST-SSR分子标记及其开发方法与应用。一组藜麦EST-SSR分子标记包括66个位点所对应的正向和反向引物,其开发方法包括步骤:1)从NCBI数据库获得RNA-seq及EST序列...
- 张体付赵涵戚维聪
- 文献传递
- 用于区分玉米杂种优势群的玉米KASP分子标记组合及其开发方法和应用
- 本发明提供了一种用于区分玉米杂种优势群的玉米KASP分子标记组合,包括202个KASP分子标记,202个KASP分子标记分别特异性检测202个玉米SNP位点SNPjs0001~SNPjs0202。较佳地,每个KASP分子...
- 陆海燕林峰赵涵
- 文献传递
- 玉米ZmZIM家族基因鉴定及其对氮素的响应特征
- 2024年
- 为明确玉米ZmZIM家族基因结构、位置、编码蛋白质性质及其对氮素的响应特征,本研究利用TBtools、MEGA X等软件分析玉米ZmZIM家族基因的结构、染色体位置、顺式作用元件及系统发育关系及其编码蛋白质的理化性质、保守结构域及基序,结合玉米不同发育时期不同器官的转录组数据及充足氮与低氮水平下四叶一心期玉米地上部转录组数据解析玉米ZmZIM家族基因的表达模式及差异。结果表明:从玉米全基因组中共鉴定到32个玉米ZmZIM基因,主要分布于1号、2号、5号和7号染色体,8号和10号染色体上无ZmZIM基因。32个ZmZIM基因可划分为4个亚类,其编码蛋白质由134~467个氨基酸残基构成,均为亲水性蛋白质且全部定位在细胞核中。32个ZmZIM基因启动子区域顺式作用元件主要有调控元件、光信号响应元件、激素信号响应元件、胁迫响应元件、生长发育元件及蛋白质结合位点等6大类。不同发育时期,ZmZIM基因在玉米不同器官中存在差异性表达;在充足氮与低氮处理下,随着处理时间的增加,玉米植株地上部12个ZmZIM基因无表达或相对表达量较低,6个ZmZIM基因相对表达量较高且稳定,其余的14个ZmZIM基因的相对表达量差异较大;ZmZIM5、ZmZIM16、和ZmZIM313个基因的相对表达量普遍高于其他基因。充足氮条件下,ZmZIM8、ZmZIM15、ZmZIM20、ZmZIM24、ZmZIM29和ZmZIM31基因的相对表达量普遍高于低氮条件。本研究结果为玉米氮高效吸收利用基因筛选和利用奠定基础。
- 孙扬名张明亮葛敏邬奇赵涵
- 关键词:玉米