肖安
- 作品数:14 被引量:101H指数:4
- 供职机构:北京大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金全球变化研究国家重大科学研究计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 人工锌指核酸酶介导的基因组定点修饰技术被引量:38
- 2011年
- 锌指核酸酶(ZFN)由锌指蛋白(ZFP)结构域和Fok I核酸内切酶的切割结构域人工融合而成,是近年来发展起来的一种可用于基因组定点改造的分子工具。ZFN可识别并结合特定的DNA序列,并通过切割这一序列的特定位点造成DNA的双链断裂(DSB)。在此基础上,人们可以对基因组的特定位点进行各种遗传操作,包括基因打靶、基因定点插入、基因修复等,从而能够方便快捷地对基因组实现靶向遗传修饰。这种新的基因组定点修饰方法的突出优势是适用性好,对物种没有选择性,并且可以在细胞和个体水平进行遗传操作。文章综述了ZFN技术的研究进展及应用前景,重点介绍ZFN的结构与作用机制、现有的靶点评估及锌指蛋白库的构建与筛选方法、基因组定点修饰的策略,以及目前利用这一技术已成功实现突变的物种及内源基因,为开展这一领域的研究工作提供参考。
- 肖安胡莹莹王唯晔杨志芃王展翔黄鹏佟向军张博林硕
- 关键词:锌指核酸酶锌指蛋白基因打靶
- 人工核酸内切酶介导的新一代基因组编辑技术进展被引量:5
- 2015年
- 对基因组特定位置进行针对性修饰的实验方法称为基因组编辑技术。近年出现的ZFN、TALEN、CRISPR/Cas等一系列人工核酸内切酶逐渐形成了新一代基因组编辑技术,极大地促进了基因组靶向修饰技术的发展,并在基因功能研究、基因治疗等领域开始发挥巨大作用。文中对这一技术的基本原理、发展历程和应用方式进行了简要总结。
- 肖安张博
- 关键词:基因突变基因打靶TALEN反向遗传学
- 大众化的基因组定点修饰技术--从TALEN到CRISPR/Cas系统
- 近年来,以锌指核酸酶(ZFN)和TALEN为代表的人工构建的序列特异性核酸内切酶为基因组定点修饰技术带来了革命性的飞跃,使原来只能在小鼠、果蝇等极少数物种中实现的基因打靶迅速扩展到多种实验材料.本实验室在斑马鱼中建立了一...
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- 关键词:斑马鱼基因打靶
- TALEN在斑马鱼基因组定点修饰中的应用
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- 关键词:TALEN斑马鱼反向遗传学
- 利用密码子优化的Cas9在斑马鱼基因组中实现高效基因突变
- 有规律间隔的短回文重复序列簇及其相关系统(CRISPR/Cas)是广泛存在于古细菌和真细菌中的一种消除外源DNA 的防御系统。最近,人们优化了这一体系,利用Cas9 蛋白与向导RNA(guide RNA,gRNA)构成一...
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- 关键词:斑马鱼基因打靶
- 利用Tol2转座子介导的增强子诱捕技术获得血管相关转基因斑马鱼系(英文)被引量:13
- 2010年
- 心血管系统形成于胚胎发育极早期并为其他器官的发育、维持、修复所必需,血管生长异常可造成多种疾病.然而,由于研究对象所限,胚胎血管的发育机制尚未完全阐明,调控血管发育的基因也所知有限.通过Tol2转座子介导的大规模增强子诱捕筛选到26个血管特异表达绿色荧光蛋白(EGFP)报告基因的转基因斑马鱼系,其中有一些品系在胚胎的某些特异血管结构中表达绿色荧光.通过linker-mediated PCR克隆到22个鱼系中Tol2插入位点附近的斑马鱼基因组序列,其中有17个鱼系的Tol2插入可定位到现有的斑马鱼基因组中的单一位点.通过整体胚胎原位杂交对插入位点附近的基因进行表达谱分析,得到8个表达谱与转基因鱼系一致的基因,涵盖了9个鱼系,其中dusp5基因对应于2个不同的鱼系.这8个基因中包括hhex、ets1a和dusp5等3个功能已知的基因,但是大部分(5个)基因在斑马鱼中尚无功能研究,分别为zvsg1、micall2a、arl8b(1of2)、zgc:73355以及hecw2(1of2).hhex和ets1a基因对血管与血细胞前体的发育具有重要作用,所获得的EGFP报告基因受hhex或ets1a基因增强子控制的转基因斑马鱼(mp378b和mp430c-2)为国际首例,为深入研究这两个基因在血管与血液发育中的作用机制提供了新的机遇.筛选到的功能未知基因可以用来进一步研究其在血管发育中的功能;同时,利用所获得的转基因鱼系,可以实现实时、动态观察成血管细胞的起源、分化与基因表达调控,并可用于高通量小分子药物筛选等重要研究.
- 薛峪霖肖安文路贾岳高岳朱作言林硕张博
- 关键词:斑马鱼血管转基因
- 一种构建TALE重复序列的方法
- 本发明公开了用于构建TALE重复序列的旁单元,其为两端含有同尾酶或不同的平末端酶识别位点的重复单元DNA片段,所述的重复单元DNA片段编码含有NI、NG、HD、NK或NN的重复可变二残基RVD的重复单元或其变体,其中,在...
- 黄鹏张博林硕肖安
- 文献传递
- 类转录激活因子效应物核酸酶(TALEN)介导的基因组定点修饰技术被引量:53
- 2013年
- 人工构建的序列特异性核酸内切酶能够识别并切割特定的DNA靶序列,造成双链断裂,从而引起基因组结构的定点改变。人工核酸内切酶技术使得研究人员有可能对任意物种的基因组进行定点修饰,开启了反向遗传学研究的新天地。类转录激活因子效应物核酸酶(Transcription activator-like effector nuclease,TALEN)自2010年底开始成功应用于基因打靶,很快成为一种比锌指核酸酶(Zinc-finger nuclease,ZFN)更容易设计、特异性更高和毒性更低的人工核酸内切酶。文章综述了TALEN技术的研究进展及应用前景,重点介绍TALEN的结构、作用机制与构建方法和利用TALEN进行基因组定点修饰的策略,以及目前利用这一技术已成功实现突变的物种及内源基因,特别是在斑马鱼中的应用,为开展这一领域的研究工作提供参考。
- 沈延肖安黄鹏王唯晔朱作言张博
- 斑马鱼基因和蛋白质命名规则简介被引量:3
- 2012年
- 本文简要介绍斑马鱼(Danio rerio)基因和蛋白质的命名规则,内容主要译自《zFIN斑马鱼命名指南》中的相应部分(https://wiki.zfin.org/display/general/ZFIN+Zebrafish+Nomenclature+Guidelines),并对其组织与行文进行了整理,还更新了其中的示例。
- 肖安杨志芃张博
- 关键词:斑马鱼蛋白质基因DISPLAYWIKI
- 斑马鱼突变体和转基因鱼系命名规则简介被引量:1
- 2012年
- 本文简要介绍斑马鱼(Danio rerio)突变体和转基因鱼系的命名规则,内容主要译自《ZFIN斑马鱼命名指南》的相应部分(https://wiki.zfin.org/display/general/ZFIN+Zebmfish+Nomenclature+Guidelines),并对其进行了较大幅度的整理,添加了更多的细节与解释。
- 肖安杨志芃张博
- 关键词:转基因鱼斑马鱼突变体DISPLAY