王聪聪
- 作品数:16 被引量:37H指数:3
- 供职机构:山东农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金山东省农业良种工程项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 人工诱导银杏垂乳形成的方法
- 本发明公开了一种人工诱导银杏垂乳形成的方法。本发明采用5-50年生、根系发达、生长健壮、无病虫害的银杏作为试验材料,采用刻伤的方法获得银杏垂乳,以满足学术研究的需要,同时达到观赏的目的。该方法利用环割、环剥技术原理,阻止...
- 邢世岩王聪聪付兆军刘莉娟
- 克服银杏无性繁殖位置效应的方法
- 本发明公开了一种克服银杏无性繁殖位置效应的方法。本发明通过采用树冠阳面中上部生长健壮、芽饱满、无病虫害的枝条作插穗,应用扦插平茬法解决银杏无性繁殖过程中位置效应的问题,采用平茬后产生的复干可直接进行扦插或嫁接繁殖,主干可...
- 邢世岩王聪聪任娟霞
- 不同单株叶籽银杏间DNA甲基化差异分析
- 银杏(Ginkgo biloba L.)是第四纪冰川之后现存种子植物中最古老的孑遗植物。在其漫长的进化过程中,银杏的叶片和种子均发生了明显的形态变异。Shirai于1891年在日本发现了第一株叶籽银杏(Ginkgo bi...
- 王聪聪
- 关键词:叶籽银杏DNA甲基化表观遗传学
- 文献传递
- 银杏基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析被引量:23
- 2011年
- 利用EcoRⅠ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于银杏基因组的甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)分析体系,在全基因组水平检测银杏DNA甲基化修饰水平、模式及位点等表观遗传信息。结果显示,从54对MSAP选扩引物中,选出16对MSAP引物组合,共扩增产生454条清晰可辨且可重复的DNA条带,平均每对引物扩增获得28.38条带。在全部扩增位点中,检测到甲基化位点200个,CCGG/GGCC位点甲基化修饰比例为44%。部分银杏基因组甲基化修饰位点进行回收,最终分离了18条存在甲基化修饰的基因组DNA序列。BLASTn比对分析表明,银杏基因组中包括转录调控因子、反转录转座子、通道蛋白、启动子结合蛋白、蛋白激酶等在内的多种类型的DNA序列中均存在DNA甲基化修饰现象。
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- 关键词:银杏表观遗传学DNA甲基化MSAP
- 用于叶籽银杏MSAP分析的DNA提取方法
- 本发明公开了一种用于叶籽银杏MSAP分析的DNA提取的方法。本发明通过嫁接复壮的叶籽银杏嫩叶为材料,采用改良CTAB法进行全基因组DNA的提取,通过提高β-巯基乙醇和PVP的浓度,去除杂质并防止褐化,加入氯仿异戊醇,二次...
- 邢世岩王聪聪付兆军
- 文献传递
- 叶籽银杏DNA甲基化水平与模式变异的研究被引量:3
- 2014年
- 以萌动期与展叶期的叶籽银杏和银杏为试材,采用基于DNA甲基化敏感扩增多态性分析(Methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)方法,在全基因组水平上探究叶籽银杏、银杏不同发育期DNA序列中CCGG位点的甲基化水平及模式变化特征。萌动期选用22对引物,在叶籽银杏和银杏中检测到扩增位点为498和384个,甲基化位点为237和165个,其总甲基化率分别为47.6%和42.4%;展叶期选用40对引物,在叶籽银杏有叶生胚珠(YZ2)、无叶生胚珠(YC)及银杏(CK)叶片中检测到扩增位点767、600及367个,甲基化位点分别为370、244及152个,其总甲基化率分别为48.3%、40.5%及41.5%。进一步对不同发育期叶籽银杏、银杏DNA甲基化模式的变化特征进行分析,结果显示:萌动期、展叶期叶籽银杏与银杏相比均有超过半数的位点(52.1%、54.6%及64.2%)DNA甲基化模式发生多态性变化,萌动期叶籽银杏相对于银杏其变化趋势以超甲基化为主;展叶期叶籽银杏有叶生胚珠相对于叶籽银杏无叶生胚珠及银杏甲基化的变化趋势以超甲基化为主,叶籽银杏有叶生胚珠相对于银杏DNA甲基化模式变异幅度更大,超甲基化水平更高,显示出叶籽银杏基因组独特的DNA甲基化特征。
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- 关键词:叶籽银杏DNA甲基化
- 不同单株叶籽银杏DNA甲基化MSAP分析被引量:4
- 2013年
- 利用MSAP(甲基化敏感扩增多态性)技术对11株叶籽银杏的胞嘧啶甲基化水平和模式进行评估。结果表明,叶籽银杏基因组的CCGG序列中检测到36.86%~46.43%的DNA发生甲基化。本研究从36对选扩增引物中筛选出14对引物组合,共得到2879条清晰可辨的带,叶籽银杏总体平均DNA基甲基化水平为42.14%,甲基化模式以内侧胞嘧啶为主,其中,外侧胞嘧啶甲基化水平为11.90%~23.90%,内侧胞嘧啶甲基化水平为17.03%~28.37%。UPGMA聚类分析和主成分分析结果一致,不同单株的叶籽银杏可分为3大类。推断叶籽银杏的变异机制可能与DNA甲基化有关。
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- 关键词:叶籽银杏DNA甲基化表观遗传学
- 银杏倒插皮舌接古树复壮的方法
- 本发明公开了一种银杏倒插皮舌接古树复壮的方法。本发明通过采用3-5年生、生长良好、根系发达、无病虫害的实生幼苗做接穗,用根系腐烂、生长衰弱的银杏古树做砧木,应用倒插皮舌接法解决百年以上树龄、受危害较重、根系基本失去活力的...
- 邢世岩王聪聪
- 文献传递
- 黑蒜中5-羟甲基糠醛的生成规律及安全性评价
- 黑蒜作为大蒜的深加工产品,具有更高的营养价值,在近几年越来越受到消费者的欢迎。然而在黑蒜的加工过程中,由于发生糖类热降解反应和美拉德反应,生成了一定量的5-羟甲基糠醛(5-HMF)。研究表明,5-HMF既具有毒理性,又具...
- 王聪聪
- 关键词:黑蒜5-羟甲基糠醛安全性评价
- 文献传递
- 不同单株叶籽银杏DNA甲基化水平与模式的MSAP分析被引量:6
- 2013年
- 以叶籽银杏和普通银杏叶片为试材,利用EcoRⅠ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于叶籽银杏全基因组的甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析体系,在全基因组水平对11株叶籽银杏和1株正常银杏的胞嘧啶甲基化水平和模式进行评估。结果表明,从36对MSAP选扩引物中,选出14对MSAP引物组合,共扩增产生2766条清晰可辨且可重复的DNA条带,产生3种类型的甲基化条带。在全部扩增位点中,检测到叶籽银杏基因组CCGG序列的甲基化比率为26.42%~65.79%,正常银杏总甲基化率达30.79%,不同单株的叶籽银杏平均总甲基化率达38.61%,叶籽银杏甲基化事件的发生频率为11.27%~27.34%。方差分析显示不同单株间DNA甲基化水平差异极显著。主成分分析绘制的主分量散点图与聚类分析结果一致,不同单株的叶籽银杏可分为3大类。
- 王聪聪邢世岩李际红王东升张倩
- 关键词:叶籽银杏DNA甲基化表观遗传学