牟一
- 作品数：3 被引量：0H指数：0
- 供职机构：北京协和医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金卫生部卫生公益性行业科研专项北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- PDZ结构域中间序列结合特性及其临床应用
- 2012年
- PDZ结构域在生物体中广泛存在,介导着大量的蛋白质相互作用,参与和执行多种生物过程和生理功能。PDZ结构域常规地结合配体蛋白C末端4～5个氨基酸残基。然而,蛋白质的相互作用可能比想象中复杂得多。研究发现PDZ结构域还存在着非常规的结合特性,PDZ结构域非常规结合的特性研究有助于丰富蛋白质相互作用网络,发现蛋白质新功能,并能以结合特性为基础研发安全有效的药物应用于相关疾病的治疗。
- 牟一蔡鹏飞高友鹤
- 关键词：PDZ结构域
- PDZ结构域结合中间序列结合特性的研究
- 第一部分研究了PDZ结构域结合中间序列的结合特性
蛋白质-蛋白质相互作用在生命活动中广泛存在，主要由蛋白质结构域来高效介导。大规模的蛋白质相互作用可以通过研究结构域的结合特性来实现。PDZ、SH3、SH2、WW等结...
- 牟一
- 关键词：蛋白质相互作用PDZ结构域酵母双杂交日本血吸虫
- PDZK1和PDZK2结合特性的比较
- 2010年
- 目的比较同一种属同一家族两种相近的简单接头蛋白PDZ结构域结合配体的特性。方法采用酵母双杂交筛选新型随机多肽文库联合高效验证筛选特定PDZ配体库,分别鉴定PDZK1-PDZ1和PDZK2-PDZ1结合线性多肽序列,分析发现两种PDZ结构域结合共有序列特性。通过生物信息学方法比对PDZ结构域,确定结构域中与配体相互接触面位点,进而详细比较这两个相似结构域结合特性的区别及其产生原因。结果分别获得PDZK1-PDZ1和PDZK2-PDZ1的结合特性,发现两者的共有序列分别可以归纳为-[S/T]-x-Φ和-[S/T]-[K/R/H]-[F/L],两个PDZ结构域间相互作用接触面位点大部分相似,主要差异表现在接触面位点比对中的37～45氨基酸序列,特别是42位氨基酸(F和H)差异较大。结论成功鉴定PDZK1-PDZ1和PDZK2-PDZ1结构域的结合特性,发现了这两个PDZ结构域及其结合配体特性的差异。
- 李嫄胡斯奇马素参邵晨牟一高友鹤
- 关键词：蛋白质相互作用PDZ结构域酵母双杂交生物信息学
