林凤
- 作品数：28 被引量：171H指数：8
- 供职机构：肇庆市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：广东省肇庆市科技创新计划项目肇庆市科技创新计划项目广东省医学科学技术研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生轻工技术与工程理学农业科学更多>>
- 细菌性食物中毒的微生物学检验分析被引量：27
- 2017年
- 目的通过分析细菌性食物中毒出现的原因,找出病原学特征,对微生物检验的效果进行分析,然后总结出微生物检验的操作经验。方法在2011年6月至2016年1月期间共确定了105起由细菌引起的的食物中毒,在这105起细菌性食物中毒中,我们对85例患者使用过的食品,以及他们的粪便或呕吐物进行了检验,对28例细菌性食物中毒事件中的厨师或食品销售员的手进行手试子检验,对44例细菌性食物中毒事件中的食品操作间进行涂抹样的采集检查。对菌落总数、沙门氏菌、致病性大肠杆菌、金黄色葡萄球菌等的检查方法都是参照《食品安全国家标准食品微生物学检验标准汇编GB4789系列》,同时参照《霍乱防治》手册第5版进行霍乱弧菌的检测。结果在最后的检验结果中,在已知晓的细菌类型中,副溶血性弧菌的占比是最多的,达到了31.43%,其次是大肠杆菌,占比9.52%,沙门氏菌,占比4.76%,金黄色葡萄球菌、志贺菌和变形杆菌的占比都一样,占比3.85%,最少的是蜡样芽孢杆菌,占比只有2.86%。另外不详的因素占到了40.00%。细菌性食物中毒的季节性规律是第3季度最多,有38起。其次是第2季度,有32起,第1季度有20起,最少的是第4季度,有15起。在取的这些样品中,检查细菌最多的是粪便,占比65.00%。然后是肛试子,占比38.73%。再次是呕吐物,手试子,食品。最后的才是厨具。在同一起食物中毒中,不同的取样中含的细菌种群是不一样的,比如在某一起中毒事件中,致谢性大肠埃希菌占到了60.78>(31/51),沙门氏菌占到了46.94%(23/49),11株金黄葡萄球菌中,8株A型,A-C型有2株,A-D型有1株。结论微生物学检验细菌性食物中毒有利于将菌种、血清类型和菌属确定出来,有利于污染源的确定。给细菌性食物中毒的治疗提供必要的依据,控制病因。
- 朱颖梅谭海芳林凤苏乐斌
- 关键词：食物中毒细菌性食物微生物学检验
- 广东省肇庆市肺炎克雷伯菌临床分离株的耐药性与MLST分型研究被引量：12
- 2019年
- 目的了解广东省肇庆市肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae, KP)临床分离株的抗生素耐药情况及多位点序列分型(multilocus sequence typing, MLST)特征。方法收集肇庆市两家医院KP临床分离株63株,采用肉汤微量稀释法进行30种抗生素的体外药物敏感性试验,并对所有菌株进行多位点序列分型。结果 63株KP临床分离株的耐药谱特点可分为4类,即全敏感的高毒力肺炎克雷伯菌(hypervirulent K. pneumoniae, hvKP)、产超广谱β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌(extended spectrumβ-lactamases K.pneumoniae, ESBLsKP)、耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistantK. pneumoniae, CRKP)和其他类型的多重耐药肺炎克雷伯菌(multidrug-resistant K. neumoniae,MDRKP);MLST分型结果显示63株临床分离株可分成41个ST型。其中,ESBLsKP以ST37型(9株,39.13%)为主,CRKP以ST11型(5株,62.50%)为主,hvKP以ST65(5株,25.00%)型和ST23(3株,15.00%)型为主,而其他类型的多重耐药KP的ST型(12株9种ST型)则呈现明显的多态性。结论我市肺炎克雷伯菌临床分离株的耐药情况比较严重,要加强院内感染监测,警惕其成为优势菌型并引发院内感染的风险。
- 苏乐斌李柏生谭海芳朱颖梅林凤黎碧坚
- 关键词：肺炎克雷伯菌抗生素敏感性试验多位点序列分型
- 诺如病毒遗传组Ⅱ型TaqMan-MGB探针实时荧光PCR的检测研究被引量：2
- 2008年
- 目的建立特异、灵敏的诺如病毒遗传组Ⅱ型TaqMan-MGB探针实时荧光PCR快速检测方法。方法根据GenBank诺如病毒遗传组Ⅱ型代表株保守序列设计特异引物对和TaqMan-MGB探针,调整引物、探针浓度,优化最佳反应条件,建立一步法实时荧光PCR快速检测反应体系,进行灵敏度、特异性、稳定性试验,以评价反应体系,并与引物P289/P290常规RT-PCR进行灵敏度比较。结果诺如病毒遗传组Ⅱ型TaqMan-MGB探针实时荧光PCR检测时限短,仅1h就出结果;最低检出下限为100拷贝/mL,比引物P289/P290常规RT-PCR灵敏度高100倍;与轮状病毒、腺病毒、星状病毒、甲肝病毒无交叉反应;4份核酸含量不同的标本重复检测5次,平均Ct值变异系数范围0.96%～2.27%。结论诺如病毒遗传组Ⅱ型TaqMan-MGB探针实时荧光PCR快速、特异、灵敏、稳定性好,可应用于突发公共卫生应急检测,提高快速检测能力。
- 陈华谭翰清郭赐贶谭海芳程洁萍林凤孔秀珍丁丽娜
- 关键词：人类杯状病毒诺如病毒实时荧光PCRTAQMAN
- 广东省肇庆市2014-2015年登革病毒分子分型及初步溯源研究
- 谭翰清谭海芳朱颖梅程洁萍苏乐斌林凤邓廷国黄强黎碧坚
- 2019年肇庆市不同来源金黄色葡萄球菌分离株分子流行与耐药特征研究被引量：4
- 2020年
- 目的了解2019年肇庆市不同来源金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,本文简称金葡菌)分子流行特征和耐药谱构成情况。方法对2019年分离自食品样、医院环境涂抹样和患者样中的117株金葡菌进行肠毒素基因聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测、抗生素敏感性试验及多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST),并对优势序列型(sequence type,ST)菌株进行脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分析。结果117株金葡菌中sea、seb毒力基因在不同来源的菌株间的携带情况存在差异,pvl毒力基因在不同耐药表型的菌株间携带情况也存在差异;肇庆市金葡菌耐药表型分为耐甲氧西林金葡菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)株和甲氧西林敏感金葡菌(methicillin sensitive staphylococcus aureus,MSSA)株,MRSA株有4个优势耐药谱型,MSSA株则有3个优势耐药谱型。MSRA株耐药表型以多重耐药的MRSA株为主,且耐药情况严重;MLST分型、PFGE和ST型遗传进化分析显示,117株金葡菌可分为50个ST型,其中优势ST型有4个,分别为ST239、ST1891、ST3191和ST7,以患者分离株为主。4个优势ST型菌群间亲缘聚类距离较远,除ST7型菌群外,其他3个ST型菌株群中,不同来源的金葡菌间存在一定的亲缘关系。50个ST型可分为2个进化分支,其中有43个ST型在进化分支1上,7个ST型在进化分支2上,进化分支1与进化分支2间的菌株进化差异较大。结论肇庆市金葡菌毒力基因sea、seb在不同来源的菌株间携带情况存在差异,毒力基因pvl在不同耐药表型的菌株间携带情况也存在差异;耐药表型以多重耐药的MRSA株为主;肇庆市金葡菌流行4个优势ST型。不同来源间金葡菌存在相互散播的风险。肇庆市菌株主要位于进化分支1;防控部门应对不同来源和不同耐药表型的金葡菌制定相应的分级防控方案,并警惕不同来源的金葡菌相互散播的风险,防�
- 苏乐斌李柏生熊流新谭海芳陆丽苗朱颖梅邓廷国林凤黎碧坚郭凯华
- 关键词：毒力基因抗生素敏感性试验多位点序列分型脉冲场电泳
- 食物中毒沙门菌PFGE分子分型及耐药性研究被引量：3
- 2009年
- 目的:对本地区食物中毒的沙门菌的分子分型及耐药性进行分析。方法:菌株分离、生化鉴定和血清型确定参照GB/T4789.4-2003方法进行,采用PFGE进行分子分型,利用药敏卡通过仪器对菌株进行药敏试验。结果:从12份标本中,检出8株塔克松尼沙门菌,经PFGE分型,8株源于食物中毒病人和食物标本的塔克松尼沙门菌其带型一致,为相同菌株。对8株塔克松尼沙门菌进行了21种抗生素的药敏试验,受试菌对大多数常用的头孢类和喹酮类抗生素敏感。结论:PFGE是一种非常有效的分子分型方法,建立细菌PFGE指纹图谱数据库及PulseNet,对于控制食源性疾病非常重要。
- 谭海芳谭翰清丁丽娜林凤
- 关键词：食物中毒沙门菌PFGE耐药性
- 诺如病毒遗传组I型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR的研究被引量：4
- 2008年
- 目的建立诺如病毒遗传组I型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR快速、特异、灵敏的检测方法,为疾病预防控制提供可靠的依据。方法根据GenBank诺如病毒遗传组Ⅰ型代表株保守序列设计特异引物对和TaqMan-MGB探针,建立一步法实时荧光RT-PCR快速检测反应体系,优化反应条件,评价反应体系的灵敏度、特异性、重复性,并与常规RT-PCR比较。结果诺如病毒遗传组Ⅰ型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR检测时限短,仅1h就出结果,与轮状病毒、腺病毒、星状病毒、甲肝病毒、诺如病毒遗传组Ⅱ型无交叉反应,最低检出下限为100拷贝/反应,比常规RT-PCR灵敏100倍,5份浓度不同的诺如病毒遗传组Ⅰ型标本重复检测5次,平均Ct值变异系数范围为0.39%～1.02%。结论诺如病毒遗传组Ⅰ型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR快速、特异、灵敏、重复性好,可应用于突发公共卫生应急检测和诺如病毒遗传组Ⅰ型监测,提高快速检测能力。
- 谭翰清郭赐贶谭海芳陈华程洁萍林凤孔秀珍丁丽娜
- 关键词：人类杯状病毒诺如病毒实时荧光PCR逆转录PCR
- 2014—2016年广东省肇庆市人感染H7N9禽流感病毒基因组特征分析被引量：5
- 2017年
- 目的了解广东省肇庆市2014-2016年人感染H7N9禽流感病毒基因进化特征。方法对肇庆市17例H7N9患者咽拭核酸直接进行8节段基因序列扩增与测定,用BioEdit5.0、MEGA6.0进行同源性和重要氨基酸位点分析,采用Neighbor-Joining法构建进化树,参比序列从GenBank下载。结果 7份H7N9病例标本获得8节段全基因序列,HA与A/chicken/Dongguan/695/2014(H7N9)相似度最高,NA与A/chicken/Dongguan/1075/2014(H7N9)相似度最高;内部基因与2013—2014年广东东莞、深圳禽源H7N9及H9N2相似度较高。HA和NA基因与广东省东莞、广州、深圳等地市的H7N9序列同处于珠三角进化分支,与安徽、浙江、江苏等长三角分支的序列相似性低。HA蛋白受体结合位点发生G186V、Q226L变异,裂解位点序列均为PEIPKGR↓GLF,含有2个碱性氨基酸;M2蛋白上发现耐药位点S31N,PB2蛋白上发现E627K突变,NA蛋白上未发现耐神经氨酸酶的位点变异。结论肇庆市人感染H7N9病毒株可能来源于2013—2014年广东省珠三角地区禽源H7N9和H9N2,G186V、Q226L和E627K位点变异增强了对人的易感性。
- 谭翰清程洁萍谭海芳朱颖梅林凤梁晓晴陈捷麦炜
- 关键词：血凝素基因神经氨酸酶基因
- 医院消毒监测金黄色葡萄球菌主要毒力基因和耐药基因研究
- 目的研究医院分离金黄色葡萄球菌分离株的毒力基因和耐药基因携带情况,为加强医院感染控制提供科学依据。方法采用分离培养与鉴定方法和多重基因扩增技术对金黄色葡萄球菌分离株进行了毒力基因和耐药基因检测,同时进行药敏试验。结果在医...
- 谭翰清林凤谭海芳陈华程洁萍区意高向雄叶坚
- 关键词：金黄色葡萄球菌临床分离菌株毒力基因耐药基因
- 文献传递
- 基于全基因组测序的单核细胞增生李斯特菌食品分离株分子特征分析被引量：7
- 2019年
- 目的了解肇庆市单核细胞增生李斯特菌(以下简称单增李斯特菌)食品分离株的基因组特征、毒力岛的携带情况及遗传多样性。方法对肇庆市13株单增李斯特菌食品分离株进行全基因组测序,将组装好的contings/Scaffolds上传至在线分析平台Center for Genomic Epidemiology、Rast和VFanalyzer进行基因组注释与毒力因子基因鉴定,并应用基于全基因组测序的单核苷酸多态性分型(wg-SNPs)方法与美国生物技术信息中心(NCBI)上获取的25株国内外单增李斯特菌的基因组进行遗传进化分析。结果 13株单增李斯特菌食品分离株的基因组大小为2.82~3.04 Mb,CG含量为37.9%~38.1%,可分为6个ST型(ST1、ST3、ST8、ST59、ST87、ST101),分属于6个克隆复合群(CC1、CC3、CC8、CC59、CC87、CC101)。其中,ST3型菌株均携带LIPI-3毒力岛基因,ST87型菌株均携带完整LIPI-4毒力岛基因。wg-SNPs遗传进化分析显示13株单增李斯特菌食品分离株可分为2个进化分支,其中ST3型菌株位于进化树的根部,与其他ST型菌株进化上存在差异。结论肇庆市单增李斯特菌食品分离株以高毒力的ST87型和ST3型为流行型,并发现一株同时携带LIPI-1~LIPI-4毒力岛的ST87型菌株,应加强对此类菌株的监测,警惕高毒力菌株在肇庆市引起感染性暴发的风险。
- 苏乐斌李柏生谭海芳朱颖梅林凤黎碧坚郭凯华周日辉
- 关键词：单核细胞增生李斯特菌全基因组测序
