杨德
- 作品数：4 被引量：4H指数：1
- 供职机构：中南大学更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”长江学者和创新团队发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
- DNA序列中弱信号基序查找算法比较与分析
- 2008年
- 在DNA序列中查找基序是生物信息学中一个重要的计算问题,人们针对这一计算问题提出了多种模型和算法。由于DNA序列数据的复杂性,在其中有许多是比强信号基序更难提取的弱信号基序。而目前植入(l,d)基序问题(PMP)和扩展植入(l,d)基序问题(EMP)是较适合模拟弱信号基序查找的问题模型。本文归纳分析了基序查找的基本方法、策略和基序模型,指出了各种策略和模型的优势与不足。在此基础上对现有的基于植入基序查找问题模型的主要弱信号基序查找算法进行了分析和实验评估,为选择计算方法查找弱基序信号提供了参考,并讨论了该方向上尚未解决的问题和发展趋势。
- 王建新杨德黄元南
- 关键词：弱信号
- PBR在PCPA致失眠大鼠脑干中的表达
- 目的:本研究拟采用腹腔注射对氯苯丙氨酸(PCPA.)制作失眠大鼠模型,同步设立生理盐水对照组和地西泮干预组,通过行为学、体重的观察及检测大鼠脑干组织中PBR mRNA和蛋白的表达变化,初步探讨其与失眠的关系。
方法...
- 杨德
- 关键词：失眠脑干组织病理生理
- 基于统一投影和邻居桶聚集提炼策略的基序查找算法被引量：1
- 2007年
- 基序查找是生物信息学中的一个重要问题,由于生物序列中大多数信号的复杂性,一直没有很好的模型或可靠的算法来求解这一问题.本文提出了一种基于统一投影和邻居桶聚集提炼策略的基序查找算法UPNT(Uniform Projection with Neighbourhood Thresholding).在UPNT算法中,利用统一投影策略有效减少了投影数目,并使用邻居桶聚集提炼的策略大大减少了提炼桶的数目.本文进一步使用背景分布均衡与非均衡的合成(l,d)序列两套数据集对算法性能进行测试和分析,实验结果表明:UPNT在成功率和运行时间上的综合性能优于Random Projection、Aggregation和Uniform Projection等投影算法,具有更强的适用性.
- 王建新杨德陈建二
- 生物信息学中弱信号基序查找算法研究
- 在生物序列中查找基序是生物信息学中一个重要的计算问题，人们针对这一计算问题提出了多种模型和算法。由于真实生物序列数据的复杂性，其中有许多是比强信号基序更难提取的弱信号基序。
本文作者重点研究了适合于模拟弱信号基...
- 杨德
- 关键词：生物信息学生物序列
- 文献传递
