杨俊
- 作品数:9 被引量:22H指数:3
- 供职机构:上海交通大学医学院附属仁济医院更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 一种新纸片药敏试验方案对铜绿假单胞菌β-内酰胺类耐药表型的分析
- 目的随着三代头孢菌素、碳青霉烯类等药物在临床的广泛使用,铜绿假单胞菌对β-内酰胺类抗菌药的耐药性逐步增强,2005年G.Vedel通过多年的研究建立了一套通过K-B法药敏试验结果分析解读铜绿假单胞菌的耐药表型的方案.从而...
- 杨海慧赵贝棣卫颖珏杨俊应春妹于嘉屏
- 关键词:铜绿假单胞菌
- 文献传递
- 医院感染光滑念珠菌耐药性及流行病学分析被引量:4
- 2012年
- 目的分析仁济医院光滑念珠菌的基因分型以及不同基因型光滑念珠菌的药物敏感性结果,以了解仁济医院光滑念珠菌的耐药性和流行情况,并探讨两者间是否存在相关性。方法运用多位点序列分型(MLST)技术,对34株光滑念珠菌的6个管家基因进行测序分析,利用Clustalx软件与MLST数据库进行序列比对,确定其等位基因谱型及菌株序列型(ST)。利用Clustalx软件绘制进化树,同时通过eBURST程序将菌株分为各个克隆系,以比较不同基因型之间亲缘关系的远近。采用ATB FUNGUS半自动真菌鉴定和药物敏感性分析系统进行药物敏感性试验,结合基因分型结果,运用Ridit分析方法探究两者的联系。结果 34株光滑念珠菌经MLST分型,得到6个ST,其中ST-7 27株,占总数的79.4%(27/34);ST-10 3株,占总数的8.8%(3/34),其余4型(ST-3、ST-15、ST-43、ST-55)各1株。34株光滑念珠菌对氟胞嘧啶、两性霉素B 100.0%敏感,对伏立康唑和氟康唑的敏感率分别为97.1%和91.2%,伊曲康唑抑菌效果差,敏感率仅11.8%。以ST-7为标准组,氟康唑、伏立康唑及伊曲康唑药物组中ST-10组及其他ST组均包含标准组的平均Ridit值。结论 ST-7为仁济医院光滑念珠菌中优势菌株;光滑念珠菌的耐药谱与基因型相关性差。
- 郑冰姚冬婷应春妹汪雅萍张灏旻杨俊
- 关键词:光滑念珠菌多位点序列分型药物敏感性分析
- 上海市浦东部分地区尿路感染常见病原菌的耐药性分析被引量:7
- 2011年
- 目的分析2004—2010年上海市浦东部分地区尿路感染患者最常见的病原菌大肠埃希菌和粪肠球菌的耐药性,为临床合理用药提供依据。方法收集2004年10月—2010年9月上海市浦东部分社区医院住院患者、上海交通大学医学院附属仁济医院东部住院及门诊患者临床分离的尿路感染病原菌,用纸片扩散(K-B)法检测并分析其耐药性,采用WHONET 5.3软件和SPSS 13.0统计学软件进行分析。结果从尿路感染患者中段尿标本中分离出4 415株细菌,大肠埃希菌1 968株(45.6%),粪肠球菌736株(16.7%)。耐药率比较:浦东地区社区医院住院患者>仁济医院住院患者>仁济医院门诊患者。大肠埃希菌对氨苄西林和环丙沙星耐药率逐年下降,对头孢噻肟和头孢他啶耐药率及超广谱β内酰胺酶(ESBLs)检出率逐年下降,对庆大霉素、氨苄西林/舒巴坦、哌拉西林、头孢哌酮/舒巴坦、哌拉西林/他唑巴坦和头孢吡肟耐药率先升后降;粪肠球菌对左氧氟沙星耐药率逐年上升,对呋喃妥因耐药率先升后降。结论尿路感染最常见病原菌是大肠埃希菌和粪肠球菌;临床经验用药不同可导致耐药性差异;合理有效使用抗生素能改善耐药性产生。
- 杨俊汪雅萍应春妹郑冰张灏旻
- 关键词:尿路感染病原菌耐药性大肠埃希菌粪肠球菌
- 纸片药敏试验对铜绿假单胞菌β-内酰胺类耐药表型的分析被引量:1
- 2008年
- 目的用纸片药敏试验分析仁济医院临床分离的铜绿假单胞菌对β-内酰胺类抗菌药物的耐药表型。方法根据Vedel建立的方法,采用8种药敏纸片的药敏试验结果对147株铜绿假单胞菌的β-内酰胺类抗菌药物耐药表型进行分析。结果147株铜绿假单胞菌有13种不同β-内酰胺类抗菌药物的耐药表型,仁济医院西部外科、风湿和肾脏等病区有3种以上的不同耐药表型存在。结论铜绿假单胞菌耐药机制复杂,Vedel所建立的表型分析方法可方便有效的分析铜绿假单胞菌临床分离株的β-内酰胺类抗菌药物耐药表型。
- 杨海慧赵贝棣卫颖珏杨俊应春妹于嘉屏
- 关键词:铜绿假单胞菌耐药表型
- 两种前处理方法对血培养直接药敏的影响被引量:3
- 2021年
- 目的比较两种血培养直接药敏方法与常规药敏方法结果的一致性,评估两种前处理方法对血培养直接药敏的影响。方法选取上海某三级教学医院2017年9月至2018年5月共241例血培养阳性样本,用分离胶管离心后分别使用直接检测法和TSB肉汤增菌法两种前处理方法获得细菌,并配置菌悬液,选择相应药敏卡进行药敏试验,得到的药敏结果与转种后获得菌落的常规药敏结果进行比较。结果革兰阴性菌分离胶离心后直接检测法和增菌法与标准方法类别一致性分别为98.53%和98.74%(2753/2794、2759/2794),非常重大错误(VME)分别为0.21%和0.18%(6/2794、5/2794),重大错误(ME)分别为0.17%和0.21%(5/2794、6/2794),微小错误(MIE)分别为1.47%和1.25%(30/2840、24/2840)。革兰阳性球菌(除链球菌)分离胶离心后直接检测法和增菌法与标准方法类别一致性为98.46%和99.13%(2048/2080、2061/2080),VME分别为0.34%和0.10%(7/2080、2/2080),ME分别为0.14%和0.19%(3/2080、4/2080),MIE分别为1.06%和0.63%(22/2080、13/2080)。链球菌两种前处理方法与标准法类别一致性为100.00%(140/140)。经过统计学分析,两种前处理方法直接体外药敏试验结果与标准法结果差异无统计学意义(P>0.05)。结论两种前处理直接药敏结果与标准法总符合率均为>98.00%,分离胶离心直接检测法操作简单无需繁琐的增菌过程,可以作为微生物实验室血培养替代直接药敏实验传统纸片法的一种方便又可靠的前处理方法。
- 张灏旻吴晶杨俊李敏
- 关键词:药敏实验符合率
- 快速筛查革兰阴性杆菌β内酰胺酶被引量:1
- 2012年
- 目的应用Cica-Beta-Test试剂盒快速筛查革兰阴性杆菌β内酰胺酶:超广谱β内酰胺酶(ESBILs)、金属β内酰胺酶(MBLs)和染色体介导头孢菌素酶(AmpC酶),为临床抗感染治疗提供耐药依据。方法收集2010年1月至2011年3月上海交通大学医学院附属仁济医院临床分离革兰阴性杆菌共110株,其中头孢噻肟和(或)头孢他啶不敏感大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和奇异变形杆菌各20株,多重耐药鲍曼不动杆菌20株和阴沟肠杆菌30株。其中大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和奇异变形杆菌用美国CLSI推荐方法确证产ESBLs;对鲍曼不动杆菌用聚合酶链反应(PCR)法检测其MBLs和AmpC酶耐药基因;对阴沟肠杆菌用表型筛选法(三维试验法)检测其AmpC酶;对所有菌株应用Cica-Beta-Test试剂盒快速筛查ESBLs、MBLs和AmpC酶。根据检测结果对试剂盒进行评估。结果应用Cica-Beta-Test试剂盒检测110株临床分离菌未发现假阳性,确诊试验总符合率为92.0%(92/100),其中与PCR法比较检测MBLs和AmpC酶结果符合率为100%;与CLSI推荐ESBLs双纸片确诊试验比较,符合率为86.7%(52/60)。30株阴沟肠杆菌用AmpC酶表型筛选法比较符合率为86.7%(26/30)。结论 Cica-Beta-Test试剂盒可对各种革兰阴性杆菌产生的β内酰胺酶进行筛查及初步分型,简便、快速,灵敏度高,准确率高,尤其能对CLSI未推荐方法的耐药革兰阴性杆菌进行β内酰胺酶快速筛查意义更大。
- 汪雅萍杨俊应春妹杜坤张灏旻郑冰
- 关键词:快速筛查革兰阴性杆菌Β内酰胺酶
- 质粒介导aac(6')-Ib基因检测与喹诺酮类耐药被引量:5
- 2013年
- 目的了解大肠埃希菌临床株对喹诺酮类抗菌药物耐药情况并分析质粒介导aac(6')-Ib基因存在与喹诺酮类药物耐药性的关系。方法采用纸片扩散法(K-B)对临床中段尿分离所得121株大肠埃希菌进行耐药性检测,聚合酶链反应(PCR)法检测大肠埃希菌aac(6')-Ib基因,对aac(6')-Ib基因阳性菌株扩增片段进行DNA测序并确定基因型。结果大肠埃希菌临床株对萘啶酸、环丙沙星、诺氟沙星、左氧氟沙星4种喹诺酮类抗菌药物耐药率均高于75%。aac(6')-Ib基因检出率为14.0%(17/121),经DNA测序确定aac(6')-Ib基因变异体(cr)有14株,突变率为82.4%(14/17);aac(6')-Ib基因阳性株对氨苄西林-舒巴坦、哌拉西林-他唑巴坦、头孢唑啉、头孢克洛、头孢呋辛、阿米卡星、环丙沙星、诺氟沙星、左氧氟沙星耐药率高于阴性株且差异有统计学意义(P<0.05)。结论仁济医院临床分离大肠埃希菌对喹诺酮类抗菌药物耐药情况严重;质粒介导aac(6')-Ib基因的存在可使大肠埃希菌对喹诺酮类抗菌药物耐药性提高;质粒介导aac(6')-Ib基因还可能引起细菌对β-内酰胺酶抑制剂药物和头孢菌素类药物敏感性下降。
- 赵倩汪雅萍应春妹郑冰张灏旻杨俊
- 关键词:质粒介导突变株喹诺酮类抗菌药物
- MALDI-TOF质谱技术在化脓性链球菌鉴定和分型中的应用
- 2018年
- 目的 以基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术用于化脓性链球菌的快速鉴定,并利用主成分聚类分析构建树状图区分不同emm分型的化脓性链球菌菌株,探索MALDI-TOF MS方法对化脓性链球菌菌株鉴定和分型的可行性。方法 复苏临床分离到的49株化脓性链球菌,使用MALDI-TOF MS采集蛋白质质量图谱,用biotyper软件进行菌种鉴定,利用主成分(PCA)聚类分析构建树状图(Dendrogram)对菌株分型,同时应用PCR扩增emm基因,测序确定化脓性链球菌的emm基因型别,将主成分聚类分析结果与化脓性链球菌emm分型结果比对。结果 MALDI-TOF MS方法鉴定结果均为化脓性链球菌,与传统方法鉴定结果均符合。emm基因测序结果显示49株化脓性链球菌中emm1为13株,emm12型为36株。通过对各菌株蛋白质质量图谱进行主成分聚类分析,在相对距离为1.1的情况下,分为A组(13株emm1型)和B组(36株emm12型),与测序结果一致。通过ClinproTools软件对A组和B组化脓性链球菌质谱图分析,有5个离子峰作为其分型的主要依据,分别是在5 545.89、6 912.47、6 898.61、5 518.51和2 978.02(m/z)离子质荷比处。结论 实验室可使用已知分型的菌株使用MALDI-TOF MS采集蛋白质质量图谱并构建相应分型质谱图库,将待测菌株图谱与图库进行主成分聚类分析,通过构建树状图,可快速对化脓性链球菌emm进行分型。
- 邱军岭秦娟秀杨俊张灏旻
- 关键词:化脓性链球菌MALDI-TOFMS
- REP-PCR技术在光滑假丝酵母菌基因分型中的应用价值被引量:1
- 2012年
- 目的评估重复序列PCR(REP-PCR)技术在光滑假丝酵母菌基因分型中的作用。方法收集深部真菌感染患者体内分离的光滑假丝酵母菌34株,以API 20C AUX酵母菌鉴定板条鉴定菌种及生化表型。采用REP-PCR对34株光滑假丝酵母菌进行基因分型:提取真菌基因组DNA,以Care-2重复元件设计引物,PCR扩增产物电泳后运用NTSYS软件进行聚类分析,聚类树状图相似系数(SI)≥97%且无明显条带差异定为同一基因型,SI≥97%且仅相差一条条带定为亚型。比较REP-PCR分型与多位点序列分型(MLST)的辨别力指数(DP),分析具有不同生化表型光滑假丝酵母菌的REP-PCR基因分型情况。结果 REP-PCR基因分型结果显示:34株光滑假丝酵母菌分为17个基因型,其中A型8株,B型6株,C、D型各3株,E型2株,F~Q型各1株,未发现亚型。REP-PCR和MLST基因分型的DP(95%CI)分别为0.911(0.770~0.980)和0.369(0.220~0.560),两者比较差异有统计学意义(χ2=21.68,P<0.01)。34株光滑假丝酵母菌有两种生化表型,生化表型代码分别为2000040(32株)和6000040(2株),生化表型代码为60000402的2株经REP-PCR分型结果分别为D型和K型(SI=0.43)。结论 REP-PCR对光滑假丝酵母菌基因分型的辨别力较强且操作简便,适用于临床实验室对光滑假丝酵母菌的流行病学研究。
- 张炜郑冰应春妹汪雅萍张灏旻杨俊
- 关键词:光滑假丝酵母菌