束永俊
- 作品数：47 被引量：105H指数：6
- 供职机构：哈尔滨师范大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金黑龙江省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 基于基因重测序信息的大豆基因靶向CAPS标记开发被引量：7
- 2009年
- 为了开发大豆基因靶向的功能分子标记,本研究采用生物信息学方法分析了大豆基因重测序数据,筛选出酶切位点突变的SNP位点,设计PCR引物163对,选用东北地区主栽品种绥农14的DNA为模板进行PCR扩增,其中139对引物获得大小为400～1200bp的特异片段。以大豆绥农14、合丰25、Acher、Evans、Peking、PI209332、固新野生大豆、科丰1号和南农1138-2的DNA为模板,采用筛选的139对引物进行PCR扩增,对扩增产物进行酶切分析,发现73对引物的PCR产物具有酶切多态性,开发出CAPS标记73个。通过功能注释分析发现,这73个CAPS标记靶向的基因主要参与细胞内亚细胞定位过程、蛋白质的结合与催化以及代谢过程等,与大豆重要农艺性状的形成相关,可以用于大豆品种的鉴定和分子系统进化的研究。
- 束永俊李勇柏锡才华纪巍朱延明
- 关键词：大豆单核苷酸多态性
- 一种山羊草属杀配子染色体2C特异SCAR标记
- 本发明公开了一种山羊草属杀配子染色体2C特异SCAR标记。本发明提供了一种检测植物杀配子染色体2C的试剂盒，所述引物对中的一条引物为序列表中的序列3所示的核苷酸，所述引物对中的另一条引物为序列表中的序列4所示的核苷酸。杀...
- 郭长虹徐国辉束永俊丛雯雯郭东林
- 文献传递
- 基于组学数据构建基因调控网络
- 2010年
- 在生命体内,基因以及其它分子间相互作用形成复杂调控网络,生命过程都是以调控网络的形式存在,如从代谢通路网络到转录调控网络,从信号转导网络到蛋白质相互作用网络等等。因此,网络现象是生命现象的复杂本质和主要特征。本文系统地介绍了基于表达谱数据构建基因调控网络的布尔网络模型,线性模型,微分方程模型和贝叶斯网络模型,并对各种网络构建模型进行了深入的分析和总结。同时,文章从基因组序列信息、蛋白质相互作用信息和生物医学文献信息等方面讨论了基因调控网络方面构建的研究,这对从系统生物学水平揭示生命复杂机制具有重要的参考价值。
- 束永俊李勇朱延明
- 关键词：基因调控网络基因表达谱贝叶斯网络
- 一种实验室用大豆种子发芽和水培装置
- 本实用新型公开了一种实验室用大豆种子发芽和水培装置，涉及生命科学与农学领域，具体涉及一种用于大豆种子发芽和水培的实验室用装置。它包括透明育种盒、育种板、透明育种盒盖、水循环器，透明育种盒内部设有支撑的固定栓，在育种板上设...
- 束永俊郭长虹于典思
- 文献传递
- 一种产ACC脱氨酶的粘质沙雷氏菌LJL-11及其应用
- 本发明公开了一种产ACC脱氨酶的粘质沙雷氏菌LJL-11及其应用其分类命名为粘质沙雷氏菌LJL-11（Serratia marcescens），保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心（CGMCC），保藏号为CG...
- 郭长虹刘佳莉郇菲菲束永俊陶楠
- 大豆CAPS标记快速开发方法的建立与优化被引量：9
- 2009年
- 采用生物信息学方法,分析大豆SNP位点序列信息,选择合适的内切酶,进行混样PCR和酶切预筛选,建立了大豆CAPS标记的快速开发方法—gspCAPS(Genome Sequence Pool,CAPS)。设计合成了61对引物,在9个大豆品种中对gspCAPS方法进行了评测。结果表明,该方法显著提高CAPS标记开发的效率,传统CAPS方法效率为40.98%(25/61),该方法效率高达86.21%(25/29),并且标记开发的正确性没有降低,维持在100%。本研究所建立的gspCAPS方法效率高、周期短、成本低,对高效开发CAPS标记具有重大的指导意义和广阔的应用前景。
- 束永俊李勇朱振雷朱延明
- 关键词：大豆CAPS生物信息学
- 一种长穗偃麦草E组染色体特异ISSR-SCAR标记
- 本发明公开了一种长穗偃麦草E组染色体特异ISSR-SCAR标记。本发明提供了一种检测长穗偃麦草E组染色体的试剂盒，包括如下引物对：所述引物对中的一条引物为序列表中的序列3所示的核苷酸，所述引物对中的另一条引物为序列表中的...
- 郭长虹徐国辉束永俊司亮王晓萍
- 文献传递
- 一种基于EST数据库和UniGene数据库的基因挖掘方法
- 一种基于EST数据库和UniGene数据库的基因挖掘方法，它涉及应用生物信息学领域。它克服了现有的基因挖掘方法中无法正确挖掘与性状相关的诱导基因的问题。本发明的方法利用EST数据库中的EST序列将UniGene数据库中的...
- 朱延明李勇束永俊柏锡才华纪巍季佐军
- 文献传递
- 酒色青霉SGFA3及其应用
- 本发明公开了酒色青霉SGFA3及其应用。本发明所提供的酒色青霉(Penicillium vinaceum)SGFA3，其保藏号为CGMCC No.4540。本发明所提供的酒色青霉(Penicillium vinaceum...
- 郭长虹于典司董蕊宋鸽束永俊姚琳
- 文献传递
- MADS-box基因家族在蒺藜苜蓿的全基因组分析被引量：4
- 2014年
- MADS-box基因家族是植物体内的重要转录因子,它们广泛地调控着植物生长、发育和生殖等过程。本研究以蒺藜苜蓿基因组数据为材料,采用结构域搜索方法,鉴定了138个MADS-box基因。通过序列比对系统进化分析,将它们分成两大类:Ⅰ型(92个)和Ⅱ型(46个)。同时,通过染色体定位分析发现,134个MADS-box基因定位在染色体上,还有4个MADS-box基因定位在尚未完成最终拼接的超长片段上。蒺藜苜蓿的MADS-box基因家族成员之间存在大量的基因重复,特别是Ⅰ型MADS-box基因,通过基因复制,MADS-box基因家族在染色体上形成多个密集的MADS-box基因簇。对蒺藜苜蓿的RNA-seq表达谱数据分析,发现MADS-box基因在心皮组织、花器官等组织中表达量较高,这表明蒺藜苜蓿的MADS-box基因家族广泛地参与苜蓿组织分化、发育以及生殖等过程的调控,这将为进一步揭示MADS-box类转录因子在蒺藜苜蓿中作用机制提供了重要的参考。
- 张军宋丽莉郭东林郭长虹束永俊
- 关键词：蒺藜苜蓿MADS-BOX系统进化分析基因复制
