杜明凤
- 作品数:27 被引量:245H指数:8
- 供职机构:贵州大学林学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技支撑计划贵州省科技厅重大专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>
- 基于马尾松干旱转录组的抗旱功能SSR位点分析被引量:7
- 2018年
- [目的]了解马尾松干旱胁迫转录组序列的功能分布和SSR位点分布特征,并探索与干旱关联的SSR位点。[方法]对马尾松幼苗进行持续干旱胁迫,选取干旱10、15、25 d及正常供水对照的马尾松针叶样品,通过总RNA提取、Illumina测序、raw reads去冗、Trinity拼接获得unigenes。利用Blast比对,对Unigene序列进行GO、KOG、KEGG功能注释及分类;利用Misa软件进行SSR位点批量搜寻,primer 3. 0软件进行规模化SSR引物设计;利用GOSeq(1. 10. 0)、KOBAS(v2. 0. 12)软件对差异表达的含SSR位点Unigene进行GO、KEGG显著性富集分析。[结果]马尾松转录组194 821个Unigene中,101 806个Unigene获得注释,包含64 943个GO功能注释、35 880个KOG功能注释及30 882个KEGG注释。搜寻到6 728个SSR位点,分布于6 367个Unigene中,SSR出现频率为3. 45%;重复类型以单、三、二核苷酸为主,分别占总SSR的35. 82%、33. 03%和25. 22%;重复基序以A/T、AT/AT、AG/CT、AGC/CTG、AAG/CTT为主;基序长度以10 20 bp的短序列SSR为主;基序重复次数以5~10次重复占优势;批量设计13 338对SSR引物。422个含SSR位点Unigene具有差异表达; KEGG富集分析发现,有11个含SSR位点的差异Unigene参与了光合作用、植物激素信号传导及类胡萝卜素合成等3个与干旱响应相关的代谢途径。[结论]从较高质量的马尾松转录组中获得101 806个具有注释的Unigene;从6 367个Unigene中挖掘出6 728个SSR位点; 422个含SSR位点的差异表达Unigene中筛选出11个与干旱关联的SSR功能位点,为抗旱功能基因定位及马尾松抗旱分子机制研究奠定基础。
- 杜明凤丁贵杰
- 关键词:马尾松转录组基因注释SSR基因差异表达
- 马尾松人工林地力维护研究进展被引量:20
- 2014年
- 针对地力衰退与维护这一林业研究热点,文中从林分生产力、土壤理化性质、土壤养分、土壤微生物、土壤酶活性、自毒作用6个方面阐述了马尾松人工林的地力现状。众多研究表明,马尾松人工林尚未出现地力衰退,其产生地力衰退的原因主要是不合理的营林措施。同时从轮作、混交林、发展林下植被、林地施肥、生态系统管理等方面介绍了马尾松人工林地力维护进展,并对马尾松人工林地力维护研究趋势进行了展望。
- 李明军杜明凤聂朝俊
- 关键词:马尾松地力衰退人工林
- 不同种源马尾松ISSR遗传结构及影响因素分析被引量:4
- 2016年
- 应用ISSR分子标记技术,对来自广西、贵州3个种源的马尾松开展遗传多样性、遗传结构及遗传距离等研究。结果表明:从100条引物中筛选出12条引物,共扩增出92个条带,86条具有多态性。 POPGENE分析显示:马尾松群体水平上的Nei’ s基因多样性指数的变化范围为0.1824~0.2065,Shannon遗传多样性指数的变化范围为0.2818~0.3178,3个群体的多态性水平差异不大;物种水平上的多态性百分率为93.48%, Nei’ s基因多样性指数为0.2842,Shannon信息指数为0.4381;表明马尾松在物种水平上具有较高水平的遗传多样性。遗传结构分析显示:马尾松的基因分化系数( Gst)为0.3153,表明遗传变异主要来源于群体内;基因流Nm为1.0853,表明不同群体间存在一定的基因流动。 AMOVA分析显示:马尾松的遗传分化指数( Fst)为0.246( P=0.001),表明群体间已出现明显的遗传分化。 UPGMA聚类和Mantel检测结果显示:每个群体内的个体均能很好地首先聚集为一个分支,群体间的遗传距离与地理距离之间存在显著相关性( r=0.972, P=0.001)。这说明马尾松在裸子植物界中具有较高水平的遗传多样性,遗传变异主要分布于群体内,群体间已出现了明显的遗传分化,这种分化并非由遗传漂变引起,可能与地理生境的差异有关。
- 杜明凤丁贵杰
- 关键词:马尾松ISSR
- 海拔及土壤环境对贵州中龄期杉木蓄积量的影响被引量:5
- 2015年
- 为杉木林资源的保护、利用及苗木培育提供科学依据,利用第8次国家森林资源连续清查贵州省第6次复查(2010年)数据资料,采用一元材积表法对128个中龄期杉木人工林固定样地蓄积量进行计算,通过T检验、多重比较、通径分析及回归分析等,研究海拔及土壤环境对中龄期杉木蓄积量的影响。结果表明:中心区杉木蓄积量与海拔呈线性负相关,海拔对其产生的影响>腐殖质层,土壤厚度、枯枝落叶层无明显影响;一般区杉木蓄积量与枯枝落叶层呈线性负相关,枯枝落叶层对其产生的影响>土壤厚度,海拔、腐殖质层无明显影响;而全省杉木区的影响因子依次为海拔>土壤厚度>腐殖质层,枯枝落叶层无明显影响。
- 李明军杜明凤喻理飞
- 关键词:森林资源海拔土壤环境
- 淫羊藿属植物杂交F_1代植株形态和种间系统演化研究被引量:3
- 2013年
- 淫羊藿属植物多数种类在形态分类性状上存在连续过渡的形态变异现象,导致种间的鉴别困难。本研究对粗毛淫羊藿、巫山淫羊藿、天平淫羊藿,3个物种合计29个居群之间的种间杂交F1代植株及其亲本形态学进行了比较研究。结果表明:AC×MY、AC×WU、WU×MY 3种组合杂交F1代的叶片形状表现为双亲过渡形态,控制淫羊藿花瓣距短于内萼片的基因可能是部分显性,E.acuminatum的花瓣和内萼片颜色属于显性遗传。所得结果为淫羊藿属植物分类学、种间系统关系及其起源与进化研究提供了新的资料和线索。
- 杜明凤陈庆富
- 关键词:F1代形态学
- 不同家系马尾松对持续干旱的响应及抗旱性被引量:21
- 2017年
- 【目的】了解持续干旱对不同家系马尾松幼苗生长和生理特征的影响,初步揭示马尾松的抗旱机制及抗旱遗传效应,比较不同家系的抗旱能力,为马尾松抗旱优良家系选育提供理论依据。【方法】以3个来自广西和贵州的2年生马尾松家系(GX01、GX02和GZ01)幼苗为试验材料,采用随机区组设计,温室土培盆栽模拟干旱环境,研究持续干旱胁迫对马尾松幼苗生长、渗透调节和抗氧化系统的影响。【结果】随干旱胁迫程度的加重,3个家系马尾松的SOD活性均呈先升后降趋势,各家系在胁迫0~10天存在显著差异(P<0.05);POD活性亦呈先升后降趋势,但家系间差异不显著(P>0.05);MDA含量变化中GX01呈先升后降趋势,GX02和GZ01呈先降后升趋势,各家系在胁迫5~20天以及第30天存在显著差异(P<0.05);脯氨酸含量变化中GZ01呈持续上升趋势,GX02和GX01呈先升后降又再升高的趋势,各家系在胁迫20~30天存在显著差异(P<0.05)。连续干旱限制马尾松苗期的生长,3个家系马尾松的苗高和地径的生长以及干物质积累均受到抑制,家系间的苗高生长、地径生长、干物质积累等均存在显著差异(P<0.05);连续干旱导致GX01和GX02的根冠比显著高于对照,GZ01亦高于对照,但差异不显著。隶属函数分析得出3个马尾松家系幼苗抗旱性GX01>GX02>GZ01;灰色关联分析发现,根冠比、苗高与抗旱性关联度最大,其次为MDA和脯氨酸含量,可作为评价抗旱性的主要指标。【结论】马尾松幼苗在轻度干旱胁迫下通过增加保护酶活性抵御干旱;在中、重度干旱胁迫下通过增加渗透调节物质抵御干旱逆境伤害;极重度干旱胁迫下,保护酶活性显著下降,MDA含量显著上升,膜质过氧化伤害严重。干旱胁迫下,马尾松幼苗通过增加地下部分生长、减少地上部分生长以适应干旱逆境。马尾松抗旱性受遗传因素控制,不同家系间抗旱性的差异可能与其不同地理环�
- 杜明凤丁贵杰赵熙州
- 关键词:马尾松干旱胁迫生理响应抗旱性
- 贵州和四川头花蓼居群的RAPD多态性研究被引量:7
- 2009年
- 运用随机扩增多态DNA(RAPD)方法研究了来自贵州、四川10个头花蓼(Polygonum capitatum)居群的遗传多样性。结果表明:由6个引物扩增得到74条带。其中,有11条RAPD谱带是所有材料共有的。各居群间相似系数介于0.622~0.892之间。UPGMA法聚类分析表明,供试材料可分为2类,类Ⅰ包含四川都江堰和贵州施秉居群,具有独特的一条带S53-650,并缺少其它居群共同具有的两条带S53-400和S67-790。类Ⅱ有四川马尔康和贵州的其它7个居群,它们彼此间遗传变异较小。
- 杜明凤陈庆富
- 关键词:头花蓼RAPD遗传多态性
- 中国喀斯特高原山地区抗冻耐旱型植被退化现状及恢复对策被引量:6
- 2017年
- 文中提出抗冻耐旱型植被退化特征为次生林比例大、林分结构缺失及缺陷、种间竞争激烈且优势树种功能未充分发挥、树种选育缺乏适应性评价,恢复策略包括恢复生态经济型植被、调整林分树种组成与密度、修复水平与垂直层次的结构缺陷、合理划分功能区以实行分区保护和改变农村能源结构。喀斯特高原山地区抗冻耐旱型植被恢复的基础研究工作尚处于起步阶段。为提高抗冻耐旱型植被的适应与恢复能力,未来需要加强植被适应性修复、树种选择与配置以及水肥管理与土壤培肥改良3个科学问题与关键技术的研究。
- 喻阳华余杨杨苏茂杜明凤
- 关键词:石漠化
- 淫羊藿植物种内杂交和自交亲和性研究被引量:4
- 2012年
- 对原产贵州、四川的15个种、38个居群淫羊藿属植物进行种内杂交、自交结实率统计分析研究。结果显示,该属所有的种类自交结实率普遍较低,最低为0%,最高为22.2%,与种内杂交结实率存在着明显的差异。说明大多数淫羊藿种内自交不亲和,是异花授粉植物,有性繁殖方式可能以风媒授粉为主。
- 杜明凤陈庆富
- 关键词:淫羊藿种内杂交自交亲和性
- 淫羊藿属植物遗传多样性的研究
- 淫羊藿为小檗科(Berberidaceae)淫羊藿属(Epimedium)植物,目前记载有55种,80%为中国特有种、贵州、四川、湖北等为淫羊藿属植物的变异中心。对主要来自于四川、贵州的17种淫羊藿植物进行了较系统的RA...
- 杜明凤陈庆富
- 关键词:RAPD技术