李青芝
- 作品数:3 被引量:11H指数:2
- 供职机构:四川农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生更多>>
- 植物miRNAs在猪母体和胎儿间传递的研究
- miRNA是基因表达转录后水平的重要调控因子,其表达具有时空特异性,在细胞增殖、凋亡、生长、分化和代谢等过程中具有重要的功能。新的研究证实食物来源的植物miRNA可在人、大鼠、牛、羊等哺乳动物的血清中检测到,且植物miR...
- 李青芝
- 关键词:植物MIRNAQRT-PCR
- 文献传递
- 人乳汁中microRNA的稳定性研究被引量:1
- 2012年
- 为了研究人乳汁中的microRNAs(miRNAs)在体外储存状态下的稳定性。本研究采用模拟体外乳汁储存条件,对乳汁进行室温孵育24h,反复冻融6次,100℃孵育10min,以及模拟体内消化环境(RNA酶A/T137℃孵育1h)的处理条件,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测处理前后乳汁中9个内源性免疫相关和1个外源性人工合成miRNA的相对表达量变化差异。研究结果显示:处理前后乳汁中内源性miRNAs和外源性miRNA均显著性降解(p<0.01)。内源性miRNAs降解为初始量的25%~70%之间,而外源性miRNA则急剧降解至初始量的0.06%~0.96%。我们的实验表明人乳汁中内源性的miRNAs较外源性miRNAs在体外不同环境下具有更强的稳定性。
- 周琦王晓艳李青芝王滔蒋岸岸
- 关键词:MICRORNA稳定性
- 猪皮下与内脏脂肪组织mRNA转录组的构建与差异分析被引量:8
- 2013年
- 【目的】研究猪皮下脂肪和内脏脂肪的表型和代谢差异,找出差异转录本。【方法】选取长白母猪的皮下脂肪(背部皮下脂肪)和内脏脂肪(大网膜脂肪和肠系膜脂肪)进行表型测定及高通量转录组测序(RNA-Seq)。【结果】①背部皮下脂肪体积最大,大网膜次之,肠系膜的脂肪体积最小;与皮下脂肪相比,内脏脂肪中饱和脂肪酸含量更高(P<0.01)而不饱和脂肪酸的含量相对较低(P<0.05);②转录组测序共获得30 532 913~33 479 707个唯一比对到基因组的读段(reads),鉴定了22 015个转录本,覆盖猪已注解转录本的80.2%,同时还发现4 583~4 765个新的转录本、936~1 029个可变剪切、16 559个单核苷酸多态位点(SNPs)和1 481个插入/缺失位点(INDELs)。③皮下脂肪和内脏脂肪间差异表达的基因共有183个,基因注释(GO)和代谢通路(Pathway)分析发现它们在不饱和脂肪酸合成、羧酸代谢和炎症反应过程中有重要作用。【结论】提供了猪皮下脂肪和内脏脂肪的完善转录组信息,获得了影响脂肪酸代谢的潜在候选基因,为进一步揭示皮下脂肪和内脏脂肪的功能特征与差异提供了数据基础。
- 李青芝王滔李明洲蒋岸岸白林
- 关键词:皮下脂肪内脏脂肪脂肪酸组成RNA-SEQ