朱晗
- 作品数：3 被引量：7H指数：2
- 供职机构：河南大学医学院更多>>
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- 相关领域：医药卫生更多>>
- SELDI-TOF/MS分析原发性肝癌TACE治疗前后血清蛋白质差异表达谱被引量：3
- 2014年
- 目的分析原发性肝癌患者经导管肝动脉化疗栓塞（TACE）治疗后血清蛋白质4a．es~图谱的变化。方法应用SELDI—TOF／MS技术和IMAC30蛋白质芯片采集50例肝癌患者TACE治疗前后肝癌患者的血清蛋白质质谱，Biomarkerwizard软件分析差异表达蛋白质峰，应用支持向量机（supportvectormachine，SVM）建立TACE治疗前后分类模型，KOC评价各差异蛋白质峰和SVM分类模型的分类效率。结果在0～20000m／z质荷比范围内，共采集到199个蛋白质峰，BiomarkerWizard软件鉴定出13个差异表达蛋白质峰（P〈0．05），包括TACE治疗24h后7个高表达蛋白质峰和6个低表达蛋白质峰。2883、11535和11687等3个蛋白质峰区分TACE治疗前后HCC的敏感性和特异性分别为80％、76％、62％和80％、60％、62％，AUC为0．8；SVM分类模型区分TACE治疗前后HCC的敏感性和特异性均为100％。结论应用SELDI—TOF／MS技术可分析TACE治疗后血清差异表达蛋白质谱，SVM分类模型能有效区分TACE治疗前后HCC。
- 齐义军马瑾张天王明晁玮霞朱晗刘瑞敏马远方Philip Johnson
- 关键词：原发性肝癌SELDI-TOF蛋白质芯片经导管肝动脉化疗栓塞
- 肝细胞癌中差异表达N-连接糖蛋白的分析鉴定被引量：3
- 2014年
- 目的分析鉴定与肝细胞癌(HCC)发生发展相关的差异表达的N-连接糖蛋白。方法应用刀豆蛋白凝集素(ConA)、晶状体凝集素(LCH)和雪花凝集素(GNA)组成的亲合层析柱富集10对HCC和癌旁非癌组织中N-连接糖蛋白、二维电泳(2DE)比较分析差异表达的蛋白质点、串联质谱鉴定差异表达蛋白,Western blotting验证人羧酸酯酶1(hCE1)、触珠蛋白(HP)及组织蛋白酶D(CD)的差异表达;体外侵袭实验检测CD表达沉默后对HCC的侵袭力影响。结果质谱、生物信息学等技术鉴定了28个与HCC相关的差异表达蛋白(HCC中高表达和低表达的蛋白均为14个),Western blotting验证hCE1、HP在HCC中明显低表达,组织蛋白酶D前体(pCD)在HCC中高表达;而ConA亲和层析柱富集的ConA-CD在HCC中显著高表达。CD-siRNA介导的CD表达沉默能够显著降低肝癌细胞系SNU449、SNU473的体外侵袭能力。结论 HP、hCE1蛋白表达变化和CD N-糖链变异可能参与了HCC发生发展过程。
- 马瑾齐义军刘瑞敏王明张天朱晗马远方
- 关键词：糖蛋白组织蛋白酶D触珠蛋白二维电泳质谱
- 支持向量机预测食管鳞癌患者术后生存期被引量：1
- 2015年
- 目的应用支持向量机(support vector machine,SVM)建立食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)术后生存期预测模型并评估该模型判断ESCC生存期的效能。方法随访168例接受根治性手术治疗的ESCC患者,分析ESCC临床病理特征和14-3-3σ、热休克蛋白gp96、巨噬细胞移动抑制因子(migration inhibitory factor,MIF)等3个蛋白的表达规律与ESCC生存期的相关性;应用Matlab软件进行SVM运算,对训练组128例ESCC患者建立最优预后分类模型ESCC-SVM,并用测试组40例患者验证分类效率,ROC曲线分析ESCC-SVM及其他预后相关因子对高低死亡风险ESCC的识别能力。结果 ESCC-SVM由性别、T分期、组织学分级、淋巴结转移、TNM分期、14-3-3σ和gp96等7个最优属性组成,该模型区分训练组和测试组ESCC五年整体生存率的最大AUC分别为0.96、0.86、准确率分别为97.7%、90.0%,明显优于目前临床应用的TNM分期(准确率分别为62.5%、67.5%)及其他各临床病理属性。Cox多因素比例风险回归模型分析发现年龄、T分期、gp96和ESCC-SVM是影响ESCC术后生存期的独立因素。ESCC-SVM与性别、T分期、组织学分级、淋巴结转移、TNM分期和14-3-3σ均显著相关。结论本研究建立的ESCC-SVM为预后评估、临床治疗方案选择及个体化治疗提供了理论依据。
- 张天晁玮霞赵云岗王明王广超贺红梅刘瑞敏魏书堂韩大正朱晗马瑾谷娟马远方齐义军
- 关键词：食管鳞状细胞癌支持向量机热休克蛋白GP96巨噬细胞移动抑制因子
