徐永忠
- 作品数：11 被引量：26H指数：4
- 供职机构：复旦大学生命科学学院遗传学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 结核杆菌诱导人巨噬细胞肿瘤坏死因子受体相关信号传导元件的表达谱被引量：4
- 2003年
- 目的 调查人巨噬细胞肿瘤坏死因子受体 (TNFR)相关信号传导元件在结核分枝杆菌入侵前后的转录水平和变化幅度。方法 利用含有 12 80 0个基因和 192 0 0个基因全长序列或部分序列的基因芯片研究结核分枝杆菌无毒株和有毒株入侵导致的人巨噬细胞U937全基因组在转录水平的表达谱变化的基础上 ,然后 ,在Northern验证的基础上 ,通过生物信息学分析TNFR相关信号传导元件的表达。结果 结核分枝杆菌无毒株入侵导致的人巨噬细胞U937中与TNFR有关的表达变化不如有毒株的明显 ,TNFR被抑制 ,与TNFR相关的下游基因的表达没有检测到。有毒株导致的变化比较明显 ,MAP激酶 ,NF kappaB ,caspase ,p5 3途径等下游元件的表达分别提高 2～ 3倍 ,内源TNF表达上升 2～ 4倍 ,TNF的转换酶disintegrin金属蛋白酶表达上升 2倍。 结论 TNFR相关的信号传导途径元件参与了宿主对细菌的免疫反应 ,这些基因在转录水平被调控。结核分枝杆菌有毒株比无毒株激发的基因表达变化大。造成这种差异的原因有待进一步分析。
- 谢建平李瑶乐军徐永忠梁莉于善谦王洪海
- 关键词：结核杆菌巨噬细胞肿瘤坏死因子受体信号传导生物信息学
- 利用DNA表达谱芯片初步研究结核分枝杆菌入侵诱导的人巨噬细胞全局性基因表达
- 结核病仍是威胁我国人民健康的严重传染病.其致病菌结核分枝杆菌是典型的胞内致病菌,主要在人巨噬细胞等宿主免疫系统的细胞内存活和繁殖.结核分枝杆菌感染的后果和巨噬细胞初期的应答反应有关.研究细菌和巨噬细胞间初期的相互作用可以...
- 谢建平乐军徐永忠黄达蔷李瑶梁莉陈永青王洪海
- 文献传递
- 结核分枝杆菌感染对人巨噬细胞离子通道及其调控元件转录表达的影响被引量：3
- 2003年
- 为研究人巨噬细胞的离子通道及其调控元件是否参与了抗结核分枝杆菌感染免疫 ,利用表达谱芯片技术研究细菌感染后宿主巨噬细胞基因的表达情况。在全局表达谱分析的基础上 ,重点分析了离子通道及其调控元件的表达 ,并比较无毒株和临床分离有毒株在诱导离子通道及其调控元件表达方面的差异。结果表明 ,细菌感染影响离子通道及其调控元件基因的表达 ,涉及的离子通道包括钾通道、钠通道、氯通道、钙通道 ,差异表达的调控元件包括G蛋白、G蛋白偶联受体、蛋白质激酶和磷酸化酶 ;临床株感染影响的离子通道及其调控元件较无毒株广泛和丰富。这些观察结果提示 ,离子通道及其调控元件参与了宿主细胞对感染细菌的免疫应答 ,有关离子通道及其调控元件在抗结核免疫中的作用有待进一步研究。
- 谢建平李瑶乐军徐永忠梁莉胡昌华于善谦王洪海
- 关键词：离子通道结核分枝杆菌巨噬细胞表达谱芯片
- 结核分枝杆菌入侵诱导的人巨噬细胞全局性基因表达变化被引量：7
- 2003年
- 利用含有12800个基因全长或部分序列的基因芯片研究结核分枝杆菌无毒株入侵导致的人巨噬细胞U937全基因组在转录水平的表达谱变化。结果表明其中473个基因(3.7％)差异表达,表达上调的基因25个(5.3％),上调超过3倍的包括丝氨酸/苏氨酸蛋白质激酶,可溶性结合半乳糖苷的凝集素,蛋白质酪氨酸磷酸酶delta,DDR受体酪氨酸激酶等的编码基因,其余基因(94.7％)表达下调。表达下调的基因中,表达仅为原来1/3以下的25个,其中syndecan结合蛋白的表达下调12.5倍.芯片研究结果与结核分枝杆菌一般抑制宿主细胞免疫应答的趋势相符。这473个基因中的376个基因在GenBank中有记录,另外97个是新基因。生物信息学分析提示差异表达基因编码产物与细胞内信号传导、细胞因子反应、细胞骨架重建、细胞凋亡、铁代谢、电子传递、线粒体功能和离子通道等有关。这些差异表达基因中,有17个是文献报道过的,而且都印证了本文的结果。RT-PCR和Northern杂交实验确证了表达谱芯片研究结果。通过DNA芯片研究全局表达谱变化,揭示了细菌入侵早期导致的巨噬细胞表达变化,为深入研究结核分枝杆菌-宿主相互作用提供了基础数据和探索方向。
- 谢建平李瑶乐军徐永忠黄达蔷梁莉陈永青于善谦王洪海
- 关键词：人巨噬细胞结核分枝杆菌结核病基因芯片
- 寡核苷酸表达谱揭示异烟肼耐药对结核分支杆菌致病性的影响被引量：5
- 2004年
- 目的研究结核分支杆菌异烟肼耐药菌株与H37Rv异烟肼敏感菌株感染巨噬细胞后差异表达的基因。方法利用高密度cDNA芯片检测巨噬细胞U937感染结核分支杆菌异烟肼耐药菌株与H37Rv后的基因表达谱的差异。结果两者诱导巨噬细胞的差异表达基因有53条,异烟肼耐药菌株比敏感菌株诱导多种趋化因子和细胞免疫增强的细胞因子表达上调和免疫抑制细胞因子IL10等表达下调。结论异烟肼耐药对细菌毒力有明显的影响,异烟肼耐药菌株的致病力下降,异烟肼耐药菌株容易被宿主免疫系统清除;结果为耐多药结核病控制提供依据;骨桥接素和巨噬细胞趋化因子等,在抗异烟肼耐药结核分支杆菌感染免疫中的作用值得深入研究。
- 乐军李瑶谢建平徐永忠梁莉王洪海
- 关键词：结核分支杆菌异烟肼表达谱
- 结核分支杆菌与巨噬细胞相互作用的分子机理研究
- 为了更好的了解结核杆菌-巨噬细胞的相互作用机理,我们综合利用cDNA芯片技术、蛋白质组学技术、选择性捕获转录技术（selective capture of transcribed sequences,SCOTS）等研究了...
- 徐永忠
- 关键词：结核分支杆菌巨噬细胞结核病基因表达
- 文献传递
- 寡核苷酸表达谱芯片揭示的抗结核分枝杆菌感染免疫特征被引量：2
- 2003年
- 目的 研究临床分离的结核分枝杆菌菌株感染人巨噬细胞所引起的表达变化 ,寻找与其它细菌在诱导细胞表达方面的共性和特性。方法 用 192 0 0个基因的寡核苷酸芯片比较临床分离细菌感染U937前后细胞基因的表达变化 ,以生物信息学统计分析其它细菌引起宿主细胞的基因表达变化。结果 结核分枝杆菌感染导致 1395个基因 (7.2 6 % )差异表达 ,特别显著的是细胞因子、锌指蛋白、转录因子和凋亡有关因子。与沙门菌、铜绿假单孢菌、金黄色葡萄球菌、单孢李斯特菌、百日咳菌等细菌感染引起的免疫反应具有相似之处。结论 结核分枝杆菌感染与其它细菌感染引起的免疫反应在转录水平具有共性 ,也富有特性。锌指蛋白和fibronectin受体等因子在抗结核分枝杆菌感染免疫中的作用值得深入研究。
- 乐军李瑶谢建平徐永忠梁莉于善谦王洪海
- 关键词：寡核苷酸表达谱芯片结核分枝杆菌免疫特征
- 结核分枝杆菌感染诱导的人巨噬细胞细胞因子及其调控基因的差异表达谱被引量：5
- 2003年
- 研究人巨噬细胞细胞因子在抗结核分枝杆菌感染免疫中的作用。利用表达谱芯片技术研究细菌感染后 ,宿主巨噬细胞基因表达情况 ,在全局表达谱分析基础上 ,重点分析细胞因子及相关基因的表达 ,并比较无毒株和临床分离有毒株在诱导细胞因子及其调控基因表达方面的差异。结果显示细菌感染影响较多细胞因子及其调控基因的表达 ,如IFN、TNF、TGF、IL系列及其受体、NF kappaB和TLR受体等 ;首次报道IL 1 9参与了抗结核分枝杆菌感染免疫。被临床株感染影响的细胞因子较无毒株广泛和丰富。细胞因子及相关基因参与了宿主细胞对感染细菌的免疫应答 ,有关细胞因子及相关基因在抗结核免疫中的作用有待进一步研究。
- 谢建平李瑶乐军徐永忠王洪海梁莉于善谦胡昌华
- 关键词：结核分枝杆菌人巨噬细胞细胞因子表达谱芯片
- 寡核苷酸芯片研究结核分枝杆菌临床株和无毒株诱导的巨噬细胞U937凋亡相关基因的差异表达被引量：1
- 2004年
- 结核病仍然是人类健康的主要威胁 ,结核分枝杆菌诱导的巨噬细胞凋亡是宿主防御反应之一 ,研究凋亡相关基因的差异表达有助于认识结核分枝杆菌致病机理和发现新的药物靶标。利用包括 192 0 0个基因或基因片段的DNA芯片研究巨噬细胞株U93 7对临床和实验室菌株感染的差异表达 ,Northernblotting和RT PCR验证了芯片研究结果。MtbH3 7Rv感染下调bcl 2 ,vitaminD受体、干扰素调控因子 3、细胞色素氧化酶C表达 ,幅度分别为 2 ,3 ,3 ,2 5 倍 ,临床菌株感染上调SOD2、SOD3、丝氨酸蛋白酶、toll like受体 2、signaltransducerandactivator (STAT1)、hy poxia induciblefactor 2 2等表达 ,幅度分别为 2 9 ,2 5 ,2 5 ,2 2 ,2 4 ,5 9 倍。结果提示 ,临床菌株感染更多促进凋亡 ,限制宿主的杀灭机理。
- 胡昌华谢建平李瑶乐军徐永忠王洪海
- 关键词：凋亡MYCOBACTERIUMTUBERCULOSIS巨噬细胞
- 结核分支杆菌诱导宿主细胞肌动蛋白重排和表达改变
- 2003年
- 目的 研究结核分支杆菌感染对宿主细胞肌动蛋白的影响。方法 应用共聚焦显微镜及Westernblot技术观察被结核分支杆菌H37Ra、H37Rv 感染的巨噬细胞在感染后 6h、12h和 2 4h纤丝状肌动蛋白 (F 肌动蛋白 )的形态分布及肌动蛋白表达变化。同时用未感染及H37Rv 死菌处理的巨噬细胞作对照。结果 结核分支杆菌H37Ra、H37Rv 感染巨噬细胞后诱导宿主细胞F 肌动蛋白聚集并抑制肌动蛋白的表达 ,有毒株H37Rv 较无毒株H37Ra 能更早地产生这种效应 ,而用H37Rv 死菌处理的巨噬细胞肌动蛋白不受影响。结论 结核分支杆菌在感染宿主细胞的过程中 ,可能通过分泌某些蛋白或因子影响细胞的肌动蛋白 。
- 徐永忠白海涛胡忠义陈建平淳于俐娟韦毅王洪海
- 关键词：结核分支杆菌宿主细胞肌动蛋白重排
