庞朝阳
- 作品数:18 被引量:36H指数:4
- 供职机构:四川师范大学计算机科学学院更多>>
- 发文基金:国防科技技术预先研究基金中国航空科学基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域:理学电子电信自动化与计算机技术生物学更多>>
- 电子传递链对阿尔兹海默病的影响分析
- 2024年
- 阿尔兹海默病(Alzheimer’s disease,AD)是一种神经退行性疾病.临床上以记忆障碍、视空间技能损害、执行功能障碍以及人格行为改变等全面性痴呆表现为特征.AD致病源现今不明确,其中有毒物质损害使得脑内区域性能量代谢减退是AD发生的病因特征之一,而电子传递链(ETC)在能量代谢中扮演着重要角色.通过差异分析(LIMMA)及加权基因共表达网络(WGCNA)构建获得聚类基因,并对聚类后基因进行生理分析(GO)、通路分析(KEGG)后锁定ETC,以及对其进行表达量分析及相关系数矩阵的构建,并结合临床指标(MMSE)解释说明,最终验证了ETC的异常对阿尔兹海默病存在影响的事实.
- 宋向虎李雪卉庞朝阳魏彦玉
- 关键词:电子传递链
- 一种简单、快速的码书训练算法被引量:2
- 2001年
- 以LBG算法为代表的传统的码书训练算法基本上都用量化失真序列收敛作算法停止条件。本文提出了一种简单、快速的新算法。它的基本思想是,不必计算量化失真,直接用区域序列中各区域的元素个数所成序列收敛作停止条件。该算法与经典的LBG算法相比,结构更简单、速度更快、更容易理解和控制。我们用典型的测试图像Lena、Barbara做实验。实验结果表明,该算法与著名的LBG算法的PSNR相差小于0.1dB,但它的运行速度比LBG快2倍以上。
- 庞朝阳孙世新
- 关键词:向量量化LBG算法图像编码
- 分区域收敛的快速码书训练算法被引量:3
- 2002年
- 该文提出分区域收敛的快速码书训练算法LC,它与LBC算法相比,结构简单、速度快,用典型的测试图像Lena和Barbara做实验,表明LC算法峰值信噪比只比LBG算法少2%左右,但运行速度东LBG的4.61-13.6倍。在比特率为0.375 bpp条件下,LC算法与LBG算法的重建图像质量无明显差别。
- 庞朝阳孙世新潘晔龚海莹
- 关键词:向量量化LBG算法峰值信噪比
- T检验识别阿尔茨海默病候选致病基因及基因生物分析
- 2019年
- 医学研究表明阿尔茨海默病(AD)的致病机制与基因有关,过高或过低的基因表达水平异常都会让人体失去平衡,产生病变.利用T检验法对基因芯片公共数据库GEO中的4种AD样本的基因芯片数据进行分析,提取出具有重要意义的显著差异表达基因,再通过这些差异基因的生物信息学分析其在AD发病机制中的作用,为AD致病机制的探询、预防、早期诊断与治疗等提供有益的途径和方法.通过该算法的筛选、结合AD发病机制的假说及基因生物学分析,最终识别出30个AD候选致病基因,其中有5个已经被确定为与AD有关,10个被AD致病基因筛选算法识别.
- 朱贵琼庞朝阳庞朝阳苟仕蓉
- 关键词:ADT检验致病基因基因表达数据
- 向量量化与图像压缩—理论分析、算法设计、应用、实现
- 由于向量量化(Vector Quantization,简称VQ)的压缩比高、失真小,因此它被认为是很有希望的编码方法.码书、搜索器、索引器是向量量化的三个组成部分,向量量化系统由VQ编码器和解码器构成,而解码器只是实现查...
- 庞朝阳
- 关键词:向量量化码书快速搜索算法信噪比运行时间
- 基于阿尔茨海默病的基因表达数据改进的一维聚类方法被引量:1
- 2015年
- 随着基因芯片技术的发展,基因表达数据的聚类分析方法应用到阿尔茨海默疾病的研究中.为了准确快速地挖掘基因表达数据,当数据呈现出线性相关的特征时,简捷的一维聚类方法能够被应用,但是它需要事先确定出分类个数K.主观的参数选取难以将大量的基因表达数据进行准确地聚类,使得聚类效果缺乏一定的客观性.因此,提出了基于拟合的思想将曲率最大点作为分类判据的无监督一维聚类方法,并且应用阿尔茨海默病的基因表达数据给出了分类判据.
- 黄静付如意彭志红胡本琼庞朝阳
- 关键词:阿尔茨海默病
- 一个计算集合交集的简单量子算法(英文)
- 2013年
- 集合的求交集运算是数学中的基本运算.当集合元素为高维向量时候,求交运算的计算效率就十分低下.应用了一般性Grover迭代去设计算法,提出了一个简单求交运算的量子算法,它的运算效率明显比经典的电子计算算法高.
- 胡本琼章洁雷宇刘波李均利丁从宝刘帅卿庞朝阳
- 关键词:交集量子算法
- 一种不需要计算量化失真的快速码书训练算法被引量:1
- 2002年
- 该文利用LBG算法迭代过程中质心序列收敛特性,提出了一种快速算法。它的基本思想是,直接去掉LBG算法中量化失真计算,用质心序列收敛作停止条件。我们用典型的测试图像Lena做实验,实验结果表明,该算法与著名的LBG算法的PSNR相差小于0.1dB,但它的运行时间至少比LBG的运行时间少一半。
- 庞朝阳孙世新
- 关键词:向量量化LBG算法图像
- 应用阿兹海默症基因表达数据对比2种层次聚类方法被引量:1
- 2015年
- 随着基因芯片技术的发展,双聚类分析方法首先被应用到高维基因表达数据的研究中.由于多数高维数据的稀疏性,应用主成分分析方法将高维数据转化到低维数据空间,从而在低维空间中应用聚类分析方法.不同的聚类分析方法会得到不同的聚类效果,并且同一种聚类方法处理不同的高维数据也会得到不同的聚类效果.因此,首先评估了阿尔茨海默基因表达数据的特征集的聚类趋势,接下来给出了改进地δ阈值层次聚类算法的算法描述.由于已有工作分别给出了不同的δ阈值的计算规则,于是比较了它们δ阈值下的层次聚类算法,并且给出了相应的聚类评价.
- 付如意黄静胡本琼庞朝阳
- 关键词:层次聚类阈值基因表达数据
- 基于PCA的模糊C均值聚类算法识别AD候选致病基因
- 2016年
- 研究表明阿尔茨海默病(AD)的致病机理可能与基因有关.利用计算方法对AD基因表达数据进行挖掘,以获得AD候选致病基因,寻找治愈AD方法.结合生物信息理论应用基于主成分分析(PCA)方法的模糊C均值算法处理基因表达数据:观察到AD基因表达数据具有线性相关性后,先用PCA对数据降维,再利用一维分类方法对降维后的数据聚类,然后将结果提供给模糊C均值算法作为其初始聚类数目和聚类中心.通过算法,最终识别出9个AD候选致病基因.
- 杨华兰庞朝阳董体智胡本琼
- 关键词:基因表达数据模糊C均值算法