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周梅
作品数:
1
被引量:7
H指数:1
供职机构:
中国科学院研究生院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
理学
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合作作者
徐筱杰
北京大学化学与分子工程学院
计明娟
中国科学院研究生院
成元华
北京工业大学环境与能源工程学院
章威
北京大学化学与分子工程学院
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章威
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计明娟
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周梅
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徐筱杰
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2005
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酪氨酸蛋白磷酸酯酶1B抑制剂的分子对接和三维定量构效关系研究
被引量:7
2005年
用一种柔性分子对接方法(FlexX)将12个2-草酰胺苯甲酸类抑制剂和酪氨酸蛋白磷酸酯酶(PTP1B)活性口袋进行分子对接,对接程序预测的抑制剂和酶之间的相互作用能与抑制活性之间有很好的相关性(非线性相关系数R^2达0.859),这说明对接结果可以比较准确地预测抑制剂和PTP1B之间的结合模式.然后,将33个同类抑制剂的骨架叠合在分子对接预测的结合构象上,用比较分子力场分析方法(CoMFA)对其进行三维定量活性构效关系研究,得到的CoMFA模型具有很好的统计相关性(交互验证回归系数q^2为0.650),并可以准确地预测测试集6个化合物的活性(平均标准偏差为0.177).同时,由CoMFA模型得出的抑制剂改造信息与用FlexX预测的结合模式是一致的,进一步证明我们预测的结合模式是正确的.为研究这类抑制剂和PTP1B的结合模式及对抑制剂进行结构改造提供了信息.
周梅
章威
成元华
计明娟
徐筱杰
关键词:
分子对接
三维定量构效关系
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