周杨
- 作品数：20 被引量：257H指数：10
- 供职机构：中国疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项北京市科技新星计划北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 我国结核病耐药状况:2018年全国结核病耐药监测数据分析被引量：19
- 2022年
- 目的:分析我国2018年结核病耐药流行状况,为结核病治疗和防控政策的制定提供参考。方法:沿用2007—2008年全国结核病耐药性基线调查抽取的70个调查点作为监测点,以2018年新诊断的涂阳肺结核患者为研究对象,采用统一的信息表收集研究对象的社会人口学特征、病史和治疗用药史等信息;同时,在监测点采集可疑肺结核患者的痰标本并进行涂片和培养,阳性分离菌株送至省、市级疾病预防控制中心或结核病防治机构进行菌种鉴定和药物敏感性试验(简称“药敏试验”)。考虑复杂抽样设计和抽样权重,采用SAS 9.4 survey procedures相关程序计算加权耐药率,以logistic回归评估耐药率的变化。结果:3820例新涂阳和643例复治涂阳患者纳入本研究。新涂阳患者、复治涂阳患者的利福平耐药率分别为5.08%(95%CI:4.39%~5.77%)和23.31%(95%CI:20.14%~26.48%);新涂阳患者、复治涂阳患者的耐多药率分别为3.52%(95%CI:2.94%~4.11%)和18.01%(95%CI:15.36%~20.67%)。与基线调查相比,新涂阳患者[OR(95%CI)值为0.71(0.58~0.87);P<0.001]和复治涂阳患者[OR(95%CI)值为0.53(0.41~0.68);P<0.001]的利福平耐药率较基线显著下降;新涂阳患者[OR(95%CI)值为0.53(0.42~0.67);P<0.001]和复治涂阳患者[OR(95%CI)值为0.47(0.36~0.61);P<0.001]的耐多药率较基线也显著下降。估计2018年登记的病原学阳性肺结核患者中,新涂阳患者、复治涂阳患者利福平耐药例数分别为12662例(95%CI:10942~14382)和8156例(95%CI:7047~9265)。结论:2018年新涂阳和复治涂阳肺结核患者利福平耐药率、耐多药率较基线调查时均显著降低。但由于人口众多,我国耐药结核病总体负担仍然较重。建议采取综合措施以减少耐药结核病的产生和传播,进而降低我国耐药结核病总体负担。
- 王胜芬周杨欧喜超夏辉赵冰宋媛媛郑扬杜昕赵雁林
- 关键词：抗药性
- 结核分枝杆菌新型间隔区寡核甘酸分型技术临床应用价值研究被引量：4
- 2019年
- 目的评价基于多色荧光探针熔解曲线技术的结核分枝杆菌新型间隔区寡核苷酸分型技术(McSpoligotyping)的临床应用价值。方法在2013-2014年间,分别从河南省五个片区的10个市或县收集肺结核患者痰标本中分离培养的结核分枝杆菌502株,采用McSpoligotyping和传统的间隔区寡核苷酸分型技术(Spoligotyping)进行分型;比较两者的结果,对两种分型结果不一致的菌株进行基因测序。结果 502株结核分枝杆菌中McSpoligotyping和Spoligotyping检测结果一致的有485株(96.60%),不一致的有17株(3.39%);不一致菌株经基因测序,McSpoligotyping分型有15株(88.24%)与测序结果一致,Spoligotyping分型有2株(11.76%)与测序结果一致。结论 McSpoligotyping作为新型的基因分型方法,较传统Spoligotyping技术更为简便、快速,可以替代传统的Spoligotyping检测技术用于结核病的分子流行病学研究。
- 李辉王少华石洁马晓光朱岩昆郑丹薇周杨许晔李庆阁赵雁林
- 关键词：结核分枝杆菌细菌分型技术DNA寡核苷酸探针
- 结核分枝杆菌北京基因型菌株的流行特征及其与耐药的关系——2007年全国结核病耐药基线调查资料分析被引量：10
- 2015年
- 目的探讨结核分枝杆菌北京基因型菌株的流行特征及其与耐药的关系。方法2007年我国开展全国结核病耐药基线调查，调查覆盖除香港、澳门和台湾地区外的全国31省（自治区、直辖市），含70个调查点。本研究对来自基线调查的3861例涂阳结核病患者的分离菌株进行分析，采用比例法进行药物敏感性试验，以间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）方法对结核病患者的分离株进行基因分型。采用EpiInfo3．5．1建立数据库，SAS9．1软件进行统计学分析，以卡方检验分析不同变量之间的关系，以P〈0．05为有统计学意义。结果北京基因型菌株在我国广泛流行，占总分离菌株的63．97％（2470／3861）。感染北京基因型菌株与年龄（〈30岁和≥60岁：OR=0．9604，95％CI=0．7995～1．1536；30～岁和≥60岁：OR=1．0620，95％CI=0．9071～1．2434，x^2=0．3885，Ptrend=0．6977）、性别（OR=1．1526，95％CI=0．9973～1．3321，x^2=3．7024，P=0．0543）无关；北京基因型菌株与抗结核药物INH（OR=0．9020，95％CI=0．766～1．0619，x^2=1．5356，P=0．2153）、RFP（OR=1．0017，95％CI=0．8166～1．2288，x^2=0．0003，P=0．9868）、Sm（OR=0．9406，95％CI=0．8139～1．08711，x^2=0．6869，P=0．4072）、EMB（OR=0．9222，95％Ci=0．7205～1．1804，X^2=0．4140，P=0．5199）、Ofx（OR=0．9624，95％CI=0．6923~1．3378，x^2=0．0520，P=0．8196）和Km（OR=1．1666，95％CI=0．7624～1．7852，x^2=0．5049，P-0．4774）任何耐药均无关联；与单耐INH（OR=0．9955，95％CI=0．7206~1．3753，x^2=0．0007，P=0．9783）、RFP（OR=0．9615，95％CI=0．4880～1．8944，x^2=0．0129，P=0．9096）、EMB（O=0．5533，95％CI=0．2023～1．5136，x^2=1．3675，P=0．2422）、0fx（OR=0．8445，95％CI=0．3965～1．7984，x^2=0．1926，P=0．6608）、Km（OR=1．7779，95％CI=0．4440~7．1203，x^2=0．6791，P=0．4099）也均无关联；与耐�
- 王胜芬周杨逄宇赵雁林
- 关键词：结核分枝杆菌基因型抗药性
- 结核性脑膜炎临床分离株基因型和耐药表型的特征分析被引量：11
- 2013年
- 目的了解导致结核性脑膜炎(TBM)的致病菌在基因型和耐药表型方面的特征。方法利用间隔区寡核苷酸分型法(Spoligotyping)和数目可变串联重复序列(VNTR)分型法对25株TBM临床分离菌株进行基因分型;采用MGIT(mycobacteria growth indicator tube)960液体和比例法固体药敏试验分别对所选15种药物:异烟肼(INH)、利福平(RFP)、乙胺丁醇(EMB)、吡嗪酰胺(PZA)、链霉素(S)、卡那霉素(Km)、阿米卡星(Am)、卷曲霉素(Cm)、莫西沙星(Mfx)、氧氟沙星(Ofx)、左氧氟沙星(Lfx)、对氨基水杨酸(PAS)、乙硫异烟胺(Eto)、丙硫异烟胺(Pto)、环丝氨酸(Cs)进行药敏实验。结果Spoligotyping分型法确定了在25株TBM临床分离株中有20株为北京基因型,占80.0%(20/25),2株为T1基因型,另外3株分别为T2型、LAM6型及未知型;VNTR有2株成一簇,基因型一样;25株TBM分离株中耐多药结核性脑膜炎(MDR-TBM)占12.0%(3/25),广泛耐药结核性脑膜炎(XDR-TBM)占4.0%(1/25),耐氟喹诺酮类的菌株占8.0%(2/25),都属于北京基因型;任意耐药的菌株占48.0%(12/25),其中83.3%(10/12)为北京基因型;全敏感者占52.0%(13/25),其中76.9%(10/13)为北京基因型。结论北京基因型在耐药TBM中所占比例很高,尤其是MDR-TBM,较其他基因型更易引起脑脊液生化的改变;耐氟喹诺酮类的菌株所占比例最少,提示临床上氟喹诺酮类药物对治疗TBM会有很好的疗效。
- 王婷赵雁林刘家云逄宇周杨赵冰赵钢
- 关键词：结核脑膜分枝杆菌结核基因型
- 结核分枝杆菌环介导恒温扩增（LAMP）快速检测方法的评价
- 2011年
- 目的对国内建立的结核分枝杆菌DNA环介导恒温扩增（loop—mediated isothermal amplification，LAMP）快速检测方法进行了介绍和评价。方法实验菌株来源于北京市结核病胸部肿瘤研究所。以结核分枝杆菌作为研究对象，设计了4条LAMP引物特异地识别结核分枝杆菌中gyrB基因的6个特殊区域。所有的菌株样本提取DNA作为模板，加入LAMP反应管后，65℃恒温反应60min即可。其结果可以通过肉眼观察到的颜色变化来判断。结果实验共验证了79株临床和标准菌株。对于菌株的培养物，LAMP实验的灵敏度为100％，特异度为92％。结论结核分枝杆菌LAMP快速检测方法是一种快速、可靠的结核分枝杆菌诊断方法。
- 戴广明曹以诚杜正平陈洵黄曙海逄宇周杨黄海荣赵雁林
- 关键词：核酸扩增技术
- 我国耐药结核病的危险因素——2007年全国结核病耐药基线调查资料分析被引量：84
- 2013年
- 目的探索新登记、复治患者发生耐药、耐多药结核病的危险因素。方法2007年4—12月中国进行了全国结核病耐药基线调查,调查覆盖全国31个省、自治区和直辖市,以省分层,采用多阶段整群抽样方法从全国结核病防治系统中随机抽取70个调查点,调查期间每个调查点纳入新登记涂阳新患者51例和复治患者17例。临床医师采用信息表收集患者的相关信息,通过当面询问患者填写治疗史信息,如有可能查阅患者医疗记录进行确认,治疗信息的准确性经另一位临床医师再次询问患者进行复核。采用比例法进行药敏试验,检测药物包括异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇、卡那霉素和氧氟沙星。结果多因素分析结果表明,对于新登记、治疗时间少于1个月(OR=1.6,95%CI=1.1～2.1)发生耐药结核病的风险较高;而女性(OR=1.4,95%CI=1.0～2.1)和进行过结核病药物治疗(OR=2.4,95%CI=1.5～3.7)是发生耐多药结核病的危险因素。对于复治患者,女性(OR=1.7,95%CI=1.1～2.7)、既往有过2次及以上治疗且最近1次在结核病专科医院治疗(OR=4.0,95%CI=1.2～14.0)发生耐药结核病的风险较高;而女性(OR=2.3,95%CI=1.5～3.6)、生活在实施DOTS较晚(2000年以后)的地区(OR=1.7,95%CI=1.2～2.4)、既往有过2次及以上治疗且最近1次在结核病专科医院外的其他医疗机构治疗(OR=3.3,95%CI=2.1～5.2)、既往有过2次及以上治疗且最近1次在结核病专科医院治疗(OR=13.0,95%CI=3.9～46.0)是产生耐多药结核病的危险因素。结论进行过结核病治疗的新登记产生耐药、耐多药结核病的风险较高;患者为女性、既往有过2次及以上的结核病治疗史是复治患者产生耐药、耐多药结核病的危险因素。
- 王胜芬赵冰宋媛媛周杨欧喜超李强夏辉逄宇端木宏谨傅瑜赵雁林
- 关键词：性别因素抽样研究
- 基因芯片诊断耐多药结核病的临床多中心研究被引量：24
- 2011年
- 目的评估基因芯片法检测耐多药结核临床分离株的临床意义。方法采取分层抽样的方法分别从北京胸科医院、同济大学附属上海市肺科医院和广州市胸科医院保存的临床菌株库的耐药组和敏感组中，随机抽取利福平耐药株800株，异烟肼耐药株797株，耐多药株791株，利福平／异烟肼双敏感380株。用基因芯片法检测包括rpoB基因的511（T→C）、513（A→C，C→A）、516（G→T，A→T，A→G）、526（C→T，C→G，A→T，A→G）、531（C→T，C→G）、533（T→C）位点、katG的315（G→C，G→A）位点和inhA的-15（C→T）位点的耐药突变。以绝对浓度法药敏结果为金标准，计算基因芯片法的符合率、敏感度和特异度。同时对基因芯片法的核酸扩增产物进行测序，以验证基因芯片对核酸序列检测的准确性。结果以绝对浓度法药敏结果作为标准，基因芯片法检测利福平、异烟肼耐药和耐多药的符合率分别是93．7％（1108／1183）、83．8％（994／1186）、82．4％（975／1183）。检测利福平耐药的敏感度为92．0％（733／797），特异度为97．2％（375／386）；检测异烟肼的敏感度为77．4％（617／797），特异度为96．9％（377／389）；检测耐多药的敏感度为74．6％（588／788），特异度为98．0％（387／395）。在利福平基因芯片检测为突变的菌株中，突变频率最高的位点是531（TCG），突变率为64．5％（480／744）；在katG／inhA突变菌株中，基因芯片检测为katG315（AGC）单突变的为77．4％（487／629）；且与测序结果基本一致，仅有5例菌株中不完全相符。其中1株异烟肼耐药菌基因芯片法检测为katG315（G→C）突变，而测序结果为野生型，其余4株为基因芯片法未包含的突变类型。结论基因芯片法可快速可靠地检测结核临床分离株利福平和异烟肼的耐药性，有望在临床诊断中广泛应用。
- 周杨欧喜超乐军谭耀驹王胜芬逄宇李强姜广路赵冰赵雁林
- 关键词：寡核苷酸序列分析多中心研究
- 结核分枝杆菌环介导恒温扩增(LAMP)快速检测方法的评价被引量：15
- 2011年
- 目的对国内建立的结核分枝杆菌DNA环介导恒温扩增(loop-mediated isothermal am-plification,LAMP)快速检测方法进行了介绍和评价。方法实验菌株来源于北京结核病胸部肿瘤研究所。以结核分枝杆菌作为研究对象,设计了4条LAMP引物特异地识别结核分枝杆菌中gyrB基因的6个特殊区域。所有的菌株样本提取DNA作为模板,加入LAMP反应管后,65℃恒温反应60min即可。其结果可以通过肉眼观察到的颜色变化来判断。结果实验共验证了79株临床和标准菌株。对于菌株的培养物,LAMP实验的灵敏度为100%,特异度为92%。结论结核分枝杆菌LAMP快速检测方法是一种快速、可靠的结核分枝杆菌诊断方法。
- 戴广明曹以诚杜正平陈洵黄曙海逄宇周杨黄海荣赵雁林
- 关键词：核酸扩增技术
- 对氨基水杨酸异烟肼及异烟肼体外抗结核分枝杆菌活性分析被引量：17
- 2014年
- 我国是耐药结核病大国,每年新发耐多药结核病例数居全球第2位[1].异烟肼是治疗结核病首选的化学药物,对有效控制结核病起着重要作用,但目前异烟肼耐药率在所有抗结核药物中最高,在复治结核病患者中更高[2-3].对氨基水杨酸异烟肼（pasiniazide,Pa）是由异烟肼和对氨基水杨酸钠（PAS）采用特殊方法化学合成的抗结核药物,对异烟肼耐药菌株有一定效果,且不良反应较少[4-5],部分临床医生将其作为复治、耐药结核病及耐多药结核病患者治疗方案中代替异烟肼的重要药物之一,但缺乏有效的基础研究依据支撑.
- 申晓娜赵雁林肖和平周杨
- 关键词：对氨基水杨酸异烟肼抗结核分枝杆菌耐药结核病对氨基水杨酸钠耐多药结核结核病患者
- 复杂网络上疾病传播溯源算法综述被引量：16
- 2018年
- 流感、肺结核等呼吸道传染病严重威胁人类的健康,因此当疫情爆发时,快速、准确地推断疾病起源,对于疾病防控具有重要的理论意义和应用价值.和社交网络上的谣言传播以及计算机网络上的病毒传播不同,呼吸道疾病依赖于人际物理接触,而且具有更为复杂的疾病传播模型.在该篇综述里,作者首先介绍了人际接触网络、疾病传播模型和疾病传播溯源问题的形式化定义,以及溯源问题在传播时间、快照覆盖程度、传播源数量和传播源候选节点这四个层面上的推广,给出了溯源算法的评价指标(准确率和错误距离)和基于贝叶斯极大似然估计的设计脉络;然后分别分析了现有的溯源算法,包括基于传染源中心性的算法、基于置信传播的算法、基于蒙特卡洛的算法以及基于最小描述长度的算法.在这四类算法中,基于传染源中心性的算法最多,使用了包括传播中心性、Jordan中心性、动态年龄和无偏中介中心性共4种中心性指标,并且基于传播中心性和Jordan中心性的算法被推广到更为一般的情形,如多个传播源、快照信息不完全等.作者分别在四种理想网络和两种真实人际接触网络下,实现并比较了常用溯源算法的性能.评估结果(包括准确率、错误距离、运行时间)表明:(1)溯源算法普遍对网络结构较为敏感;(2)多数算法对疾病传播参数具有鲁棒性;(3)相对于其他算法而言,动态消息传递算法尽管耗时几乎最长,但具有最高的准确度;(4)在耗时较短的算法中,无偏中介中心性具有相对较小的误差距离.根据实验结果,根据不同的使用场景推荐了不同的算法:(1)当运行时间不重要时,推荐动态消息传递算法;(2)相反,当希望快速溯源时,应该考虑基于无偏中介中心性的算法,当网络是随机树时,Jordan中心估计算法更优;(3)反向贪心算法和动态年龄算法分别在随机网络和无标度网络上兼�
- 黄春林刘兴武邓明华周杨周杨
- 关键词：复杂网络极大似然
