刘晶
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：复旦大学基础医学院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生文化科学更多>>
- 人星状病毒临床分离株感染CaCo-2细胞的转录组分析被引量：1
- 2016年
- 人星状病毒（human astrovirus,HAstV）是引起婴幼儿病毒性腹泻的重要病原之一,但其致病机制及与宿主相互作用的数据非常有限。本研究旨在了解HAstV感染细胞后对宿主基因在转录水平上的影响。首先,利用临床分离HAstV毒株感染CaCo-2细胞,用实时定量反转录-聚合酶链反应（reverse transcriptasepolymerase chain reaction,RT-PCR）检测细胞培养上清液中的病毒总RNA,结果显示接种后9~24h病毒总RNA拷贝数明显增加。然后,利用转录组测序全面比较感染与未感染HAstV的CaCo-2细胞转录本,筛选两者间的差异表达基因;并应用KEGG信号通路富集性方法分析差异表达基因相关的信号通路。结果显示,差异基因富集在两条信号通路上（P〈0.05）,分别为轴突导向通路和Ras信号通路。本研究首次利用深度测序技术分析了HAstV感染对宿主基因在转录水平上的影响,为进一步研究HAstV致病机制等提供了方向。
- 吴立梦滕峥刘晶张曦崔晓娴林庆能吴寰宇袁政安谢幼华
- 关键词：转录组测序转录组
- 乙型肝炎病毒小表面抗原各拓扑区段对其表达和分泌的影响
- 2016年
- 乙型肝炎病毒小表面抗原(small hepatitis B virus surface antigen,SHB)在细胞内质网上表达,沿着细胞分泌途径分泌到胞外。为系统分析SHB拓扑结构对SHB表达和分泌的影响,首先通过生物信息学预测临床病毒株HBV C8和8种基因型(A^H)代表株的SHB拓扑结构,发现这些SHB均为四次跨膜蛋白,拥有基本相同的拓扑结构。相对内质网膜而言,SHB的拓扑结构拥有3个内质网腔内区段(Inside1~Inside3)、4个跨膜螺旋区(Tmhelix1~Tmhelix4)和2个内质网膜外区段(Outside1和Outside2)。6种基因型(基因型A、B、C、D、E和G)代表株与病毒株C8的SHB拓扑结构预测结果完全相同,而基因型F和H的SHB有4个区段与C8等不完全一致。通过对C8的SHB拓扑结构各区段进行缺失突变研究,发现Inside1区段不是SHB表达和分泌所必需的;Outside1、Tmhelix2和Inside2区段是SHB表达和分泌所必需的;Tmhelix1和Outside2不是SHB表达所必需的,但为SHB分泌所必需;Tmhelix3和Tmhelix4对SHB表达有重要影响,也是SHB分泌所必需的。进一步对Outside1和Outside2进行小片段(6个氨基酸)的缺失突变研究,发现小片段缺失基本不显著影响SHB的表达,但Outside1的氨基酸55~78及Outside2是SHB分泌所必需的。本研究首次系统性分析了SHB的拓扑结构各区段对SHB表达和分泌的影响,为深入探索SHB结构与功能的关系提供了线索。
- 沈忠良饶玉良王葳马张妹刘晶潘少坤谢幼华
- 关键词：缺失突变分泌
- 细菌学综合性实验在《医学微生物学》教学中的应用效果分析被引量：1
- 2015年
- 通过综合性实验"人体肠道杆菌的分离与鉴定",让医学本科生接受包括传统的细菌学分离鉴定技术和现代分子生物学16SrRNA核苷酸序列分析技术在内的系统培训,更新了知识体系,增加了学生的动手机会,激发了学生的学习热情,培养了学生独立分析问题和解决问题的能力,为培养高素质应用型医学人才打下基础。
- 张俊琪谢幼华王葳刘晶袁正宏瞿涤
- 关键词：医学微生物学教学改革
