魏雷雷 作品数:52 被引量:196 H指数:7 供职机构: 吉林省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 国家科技重大专项 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 农业科学 更多>>
吉林省2001~2016年成人麻疹病毒核蛋白基因特征分析 被引量:7 2017年 目的分析吉林省2001~2016年成人麻疹病毒核蛋白(nucleoprotein,N)的基因特征。方法选取吉林省2001~2016年26株成人麻疹病毒代表株,分离病毒、提取核酸、通过RT-PCR扩增得到麻疹病毒N蛋白基因片段,测序后,运用生物信息学软件进行序列比对分析。结果吉林省2001~2016年成人麻疹发病构成比呈逐年升高趋势;26株成人麻疹病毒株均为H1基因型H1a基因亚型,与中国疫苗株S191和H1a代表株相比,其N蛋白核苷酸和氨基酸序列同源性均呈波动下降趋势;氨基酸突变位点数量显著增多,第47、77、82、117、122、136、147位点熵值较高,可变性较大。结论吉林省2001~2016年成人麻疹病毒N蛋白的核苷酸和氨基酸序列同源性逐年降低,基因突变位点数量显著增加,成人麻疹发病构成比逐年攀升,需持续监测成人麻疹N蛋白变异情况,并结合血清学和流行病学制定免疫策略,控制成人麻疹发病。 单元春 王爽 吴东林 周剑惠 田鑫 杨尧 程涛 魏雷雷关键词:麻疹病毒 核蛋白 基因特征 吉林省2018—2021年柯萨奇病毒A组16型病毒基因特征分析 被引量:1 2023年 目的探讨2018年、2019年和2021年流行于吉林省的柯萨奇病毒A组16型肠道病毒流行特征、种系进化及基因变异特征。方法收集2018年、2019年和2021年吉林省手足口病例临床标本,通过病毒分离筛选出60株CVA16的阳性毒株,并对其VP1编码区全基因组核苷酸序列进行测定和分析。结果60株CVA16分离株中有15株为B1a基因亚型,45株为B1b基因亚型;CVA16分离株氨基酸序列的14、23、164、235、251及266位点发生了氨基酸突变。结论CVA16为吉林省手足口病的主要病原体之一,15株CVA16分离株为B1a基因亚型,45株CVA16分离株为B1b基因亚型,与2008年青海株相比共发生了6处氨基酸位点突变。 魏雷雷 沈博 赵庆龙 杨显达 郭琪 王艺儒 刘思含关键词:手足口病 VP1编码区 吉林省2001~2014年麻疹病毒血凝素蛋白基因亲缘关系分析 被引量:5 2017年 目的分析吉林省2001~2014年间麻疹病毒血凝素(hemagglutinin,H)蛋白基因的亲缘关系。方法选取35株吉林省麻疹病毒株作为代表株,采用RT-PCR法获得麻疹病毒H蛋白核酸分段扩增产物,将测得的序列用DNASTAR软件进行拼接,并用Mega 4.0和Bioedit软件对序列进行亲缘关系和同源性分析。结果 35株麻疹病毒代表株均属于H1基因型H1a基因亚型,且明显处于两个小分支上。35株麻疹病毒株H蛋白基因同源性变化为:株间核苷酸同源性为98.2%~99.8%,株间氨基酸同源性为95.2%~99.8%;与H1a中国代表株(China93-4/H1a)相比,核苷酸同源性为98.8%~99.6%,氨基酸同源性为96.7%~98.8%;与中国疫苗株(Shanghai-191)相比,核苷酸同源性为94.5%~95.2%,氨基酸同源性为84.7%~86.7%。结论吉林省2001~2014年间,麻疹病毒H蛋白与中国代表株(China93-4/H1a)的亲缘关系呈逐年渐远的态势发展,与中国H1a代表株和中国疫苗株相比,核苷酸和氨基酸同源性均呈逐年下降的趋势,提示应对吉林省麻疹病毒H蛋白进行持续监测和分析。 单元春 王爽 周剑惠 吴东林 杨尧 田鑫 魏雷雷 程涛 曹凤瑞关键词:麻疹病毒 血凝素蛋白 基因 亲缘关系 我国2015-2016年哨点监测手足口病病原学和并发症分析 被引量:39 2019年 目的分析2015-2016年我国手足口病哨点监测系统的手足口病特征,探讨建立手足口病哨点监测的可行性、优势及不足。方法数据来源于11个国家级哨点监测点2015年11月至2016年10月手足口病监测数据,描述手足口病的病原特征、代表性和重症病例并发症情况,采用多因素logistic回归分析手足口病哨点监测样本阳性率的相关影响因素。采用SPSS 20.0软件进行统计学分析。结果共有4 783例手足口病病例样本,其中轻症病例3 390例,重症病例1 390例,死亡3例。肠道病毒(EV)阳性率为81.43%(3 895/4 783),轻症病例优势血清型为其他EV(52.68%,1 482/2 813),重症病例优势血清型为EV71(65.31%,706/1 081)。哨点监测显示的优势血清型与同时期现有监测血清型基本一致。其他EV所致病例中低年龄组儿童所占比例高于EV71和柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)(χ^2=130.17,P<0.001)。多因素logistic回归结果显示,样本阳性率高与男性、高发月份病例、儿童医院病例、样本为粪便、及时采样有关。不同类型样本阳性率均呈现随发病-采样间隔时间的延长而下降的趋势(粪便趋势χ^2=14.47,P<0.001;咽拭子趋势χ^2=31.99,P<0.001;肛拭子趋势χ^2=24.26,P<0.001)。无菌性脑膜炎、非脑干脑炎、脑干脑炎为重症病例最常见的3种并发症,EV71和其他EV所致重症病例并发症差异无统计学意义。结论哨点监测发现性别、发病月份、接诊医院类别、标本类型、采样及时性是影响手足口病样本阳性率的5个独立影响因素。哨点监测可以收集这些影响因素以提升监测质量。设立手足口病国家级哨点监测在我国是可行的。 张钟 郑亚明 郑亚明 姜黎黎 嵇红 陈国平 罗平 潘静静 魏雷雷 魏雷雷 霍达 缪梓萍 邹晓妮 陈建华 廖巧红关键词:手足口病 哨点监测 病原学 阳性率 并发症 吉林省2013年麻疹病毒核蛋白基因推导的氨基酸位点变异分析 被引量:1 2014年 目的 研究吉林省2013年麻疹病毒核蛋白(Nucleoprotein,NP)氨基酸位点的变异.方法 对吉林省2013年麻疹病例咽拭子标本用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增NP基因片段,将麻疹病毒RT-PCR阳性产物进行测序,分析其NP基因推导的氨基酸序列变异情况.结果 吉林省2013年麻疹病毒均为H1a基因亚型.以吉林省2001年麻疹病毒NP基因推导的氨基酸序列为基准,2013年50份麻疹病毒RT-PCR阳性标本中有部分标本在4个氨基酸位点出现变异;在其中3个出现变异的氨基酸位点422位点(G→S)、457位点(S→G)、497位点(R→K)上,2001-2008年33株麻疹病毒中仅有个别毒株出现该3个位点的变异,而2009年、2010年、2013年在该3个位点发生如上变异的麻疹毒株所占比例分别为100%、76.9%以及32.0% ~32.6%;在第430位点,仅2013年有44.0%的麻疹病毒阳性标本出现P→S的变异.结论 吉林省2013年麻疹病毒呈现NP的氨基酸位点变异多样化,提示要关注NP的氨基酸变异趋势. 田鑫 周剑惠 单元春 王爽 曹凤瑞 程涛 魏雷雷 吕淑梅 李大强 付思美 林琳 黄飚关键词:麻疹病毒 核蛋白类 吉林省2009-2011年柯萨奇病毒A组16型基因亲缘关系研究 被引量:5 2014年 目的 分析致吉林省2009-2011年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus group A type 16,CA16)分离株的基因亲缘关系.方法 对吉林省2009-2011年分离获得的54株CA16分离株的VP1编码区基因进行逆转录-聚合酶链反应扩增以及基因序列测定,使用MEGA 4.0软件进行基因亲缘关系分析.结果 吉林省2009-2011年54株CA16分离株有28株属于B1a基因亚型,26株属于B1b基因亚型;2009-2011年每年B1a基因亚型所占比例分别为86.7%、47.1%、31.8%,B1b基因亚型所占比例分别为13.3%、52.9%、68.2%.28株B1a基因亚型CA16形成了一个优势传播链和一个小传播链,26株B1b基因亚型CA16形成了一个优势传播链和两个小传播链.结论 B1a基因亚型所占比例呈现逐年下降趋势,B1b基因亚型所占比例呈现逐年增加趋势.吉林省2009-2011年呈现两个基因亚型各有一个优势传播链为主、各有1~2个小传播链为辅的共流行传播模式. 周剑惠 王爽 屈昊 魏雷雷 张勇 曹凤瑞 程涛 田鑫 单元春 李大强 吕淑梅 林琳 付思美 范明关键词:柯萨奇病毒感染 基因 吉林省2009年-2016年肠道病毒71型VP1编码区基因特征分析 被引量:1 2018年 目的为了解吉林省2009年-2016年肠道病毒71型(EV71)流行株的基因特征。方法对吉林省2009年-2016年手足口病来源的EV71流行株进行VP1编码区逆转录PCR反应(RT-PCR)扩增,并对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用Mega 6.0和Bioedit 7.01软件对扩增序列进行基因亲缘关系和氨基酸位点变异分析。结果吉林省2009年-2016年的97株EV71流行株与C4a基因亚型参考株位于同一簇支上,均为C4a基因亚型;97株EV71流行株在VP1编码区共有25处氨基酸位点变异,其中流行株突变数量较多的位点为22氨基酸位点和289氨基酸位点。结论吉林省2009年-2016年的97株EV71流行株均为C4a基因亚型,而且发生了多位点的氨基酸变异。 黄飚 魏雷雷 杨尧 周剑惠 吴东林 王爽关键词:手足口病 肠道病毒71型 吉林省2009-2010年引起手足口病流行的肠道病毒71型基因特性的研究 被引量:12 2012年 目的分析引起吉林省2009--2010年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)流行的肠道病毒71型的基因进化特征。方法选择31株2009-2010年分离于吉林省8个地市(州)HFMD病例的EV71代表株,对VP1编码区基因进行逆转录.聚合酶链反应扩增、扩增产物的序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件对VP1基因进行同源性、基因亲缘关系分析。结果吉林省2009-2010年的31株EV71分离株均属于C4a基因亚型,3l株EV7t株在VP1区的核苷酸的同源性在94.5%~100%之间,分属于5个分支,其中25株病毒(分离于8个地市)形成一个大的分支,属于绝对优势传播链,其余6株形成4个小分支。结论2009-2010年在吉林省内有多个EV71C4a基因型的传播链同时存在,其中分支1为绝对优势传播链,在8个地市持续传播,引起HFMD的暴发流行。 周剑惠 王爽 魏雷雷 吴静 齐忠 刘红 苟伟民 陈创 檀晓娟 张勇 张燕 许文波关键词:手足口病 肠道病毒属 疾病传播 吉林省2009-2012年肠道病毒71型VP1编码区氨基酸位点的变异分析 被引量:4 2013年 目的分析2009--2012年引起吉林省手足口病(handfootandmouthdisease,HFMD)流行的肠道病毒71型(EV—A71)的VP1区氨基酸位点的特征性变异位点。方法对2009--2012年分离于吉林省HFMD病例的70株EV—A71分离株的VPl编码区进行逆转录.聚合酶链反应,然后对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件分析VPl区氨基酸位点的变异特征以及基因亲缘关系。结果2009--2012年在吉林省分离到的70株EV—A71均属于C4a基因亚型,其中69株与2008年安徽阜阳的分离株亲缘关系最近,并且这69株病毒在VPl编码区第22位氨基酸位点均由谷氨酰胺转变为组氨酸(Q—H),与2008年安徽阜阳株一致。结论引起2009-2012年吉林省HFMD流行的EV-A71可能:来源于安徽阜阳流行株延续传播。 周剑惠 张勇 王爽 魏雷雷 田丽敏 陈超 吴静 曹凤瑞 常新 单元春 田鑫 程涛 林琳 付思美 吕淑梅 范明关键词:手足口病 肠道病毒属 122对母婴风疹病毒抗体水平检测及意义 被引量:1 2012年 目的了解孕产妇及其新生儿血液中风疹病毒抗体水平,评估孕产妇及其新生儿对风疹病毒的易感性,为预防和控制先天性风疹综合征提供科学依据。方法随机采集2011年吉林大学第二医院妇产科住院部分孕产妇及其配对新生儿血液,应用酶联免疫吸附法(ELISA)检测血清中风疹病毒特异性抗体。运用统计学软件SPSS对可能影响孕产妇及其新生儿风疹抗体水平的因素进行分析。结果 122名孕产妇风疹抗体免疫球蛋白G(IgG)阳性率为77.8%,新生儿风疹抗体IgG阳性率为82.6%。一对母婴风疹IgG抗体均>2 500 IU/ml,其母亲的风疹抗体免疫球蛋白M(IgM)阳性。母体内风疹病毒IgG抗体阳性率随年龄增加而下降。母传抗体增高的平均倍数为1.5倍,降低的倍数为2.0倍。结论及时监测孕产妇及其新生儿风疹IgG及IgM抗体,提高育龄妇女风疹免疫力,是减少先天性风疹综合征发病的有效手段。 王爽 李金翠 魏雷雷 宋杰 周剑惠 王吉 陈超 常新 田鑫 付思美关键词:母传抗体 婴儿