郑友限
- 作品数：33 被引量：113H指数：6
- 供职机构：泉州市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：泉州市科技计划项目国家高技术研究发展计划国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 2014—2017年泉州地区急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒的病原特征被引量：5
- 2019年
- 目的分析泉州地区2014—2017年急性病毒性胃肠炎疫情的病原学特征.方法收集泉州地区2014—2017年15起急性病毒性胃肠炎暴发疫情期间的患者标本,采用实时荧光定量PCR方法检测诺如病毒GⅠ/GⅡ型、扎如病毒、星状病毒及轮状病毒,对检测结果进行统计学分析;诺如病毒检测阳性的标本,对其多聚酶和衣壳蛋白基因VP1区进行PCR扩增并测序,并用DNAstar和MEGA7.0软件进行序列分析.结果本研究共采集96份来源于15起急性病毒性胃肠炎暴发疫情的患者临床标本,共检出诺如病毒30份,阳性率为31.25%,其中GⅡ型23份、GⅠ型7份;随机选择10份阳性标本进行核酸序列分析,其中9份为GⅡ.P16/GⅡ.2亚型,1份GⅠ.6亚型.系统进化树分析表明该GⅡ.P16/GⅡ.2亚型诺如病毒新重组株与近期国内外暴发流行的GⅡ.P16/GⅡ.2亚型高度同源.结论引起泉州地区2014—2017年急性病毒性胃肠炎暴发疫情的主要病原为诺如病毒GⅡ.P16/GⅡ.2亚型和GⅠ.6亚型;其中GⅡ.P16/GⅡ.2亚型在泉州地区首次出现,为近期优势毒株.
- 郑友限陈志扬郑丹凤刘江艺吴小凤陈明春
- 关键词：诺如病毒病毒性胃肠炎进化分析
- 泉州市2009年甲型H1N1流感基因特性分析被引量：1
- 2011年
- 目的了解福建省泉州市2009年甲型H1N1流感病毒的HA和NA基因特征,探讨该病毒的遗传变异及分子特性。方法采集泉州市甲型H1N1流感患者咽拭子,采用实时荧光聚合酶链反应方法检测病毒核酸及MDCK细胞培养进行病毒分离、鉴定,提取其中2株代表性毒株病毒核糖核酸(RNA),采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA和NA基因,纯化产物进行核苷酸序列测定,用DNAstar megalign软件进行序列分析。结果 1020份咽拭子检出甲型H1N1流感病毒核酸阳性200份;季节性流感病毒核酸阳性70份,其中H3N2亚型53份,H1N1亚型14份,B型3份,并分离到29株甲型H1N1流感病毒株;HA基因核苷酸序列测定显示,该毒株与北美流行株高度同源,由HA基因核苷酸序列推导的氨基酸系列与疫苗株A/Brisbane/59/2007比较,有22个位于抗原决定簇的氨基酸位点发生变异,但受体结合特异性仍为人样受体,NA基因耐药性位点分析显示,对达菲药物依然敏感。结论 2009年泉州市甲型H1N1流感流行毒株与北美流行株高度同源,相对于疫苗代表株出现了HA蛋白抗原性漂移。
- 郑友限陈明春王耿龚彩婷陈杰毅林锦忠
- 关键词：甲型H1N1流感病毒实时荧光聚合酶链反应
- 泉州市儿童非流感急性呼吸道感染病例病毒病原谱分析被引量：2
- 2023年
- 目的了解泉州市儿童非流感急性呼吸道感染(ARI)病例病毒病原谱特征。方法以2021年2月至2022年1月于泉州市儿童医院就诊的非流感儿童ARI病例为研究对象,采用实时荧光定量聚合酶链式反应法(qPCR)检测7种常见呼吸道病毒,包括鼻病毒(HRV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、副流感病毒(HPIV)、腺病毒(HAdV)、人偏肺病毒(HMPV)、冠状病毒(HCoV)和人博卡病毒(HBoV),并对阳性标本基因分型,分析病毒病原谱分布特征。结果192例非流感ARI儿童病例病毒检出率45.3%(87例,至少检出1种病毒),7种病毒检出率由高到低:HRV(14.6%,28例)、RSV(14.1%,27例)、HPIV(13.5%,26例)、HAdV(4.7%,9例)、HCoV(1.6%,3例)、HBoV(1.0%,2例)和HMPV(0.5%,1例)。病毒总检出率以夏秋季较高(χ^(2)=10.99,P<0.05);不上学儿童病例检出率(51.8%)较上学高(36.6%,χ^(2)=4.40,P<0.05)。基因分型显示,27例RSV中,RSV-A占59.3%(16例)、RSV-B占33.3%(9例),分型阴性占7.4%(2例);26例HPIV中,HPIV-3检出占42.3%(11例)、HPIV-1占23.1%(6例)、HPIV-4占15.4%(4例)、HPIV-2占7.7%(2例),HPIV亚型间的双重感染占11.5%(3例);此外3例HCoV分型结果为2例OC43型、1例NL63型;1例HMPV分型为B型。87例阳性病例中单重感染占86.2%(75例),双重感染13.8%(12例),检出混合感染病毒有HCoV、HPIV、HRV、HAdV、RSV。结论泉州市非流感感染儿童ARI病例病毒病原谱分布广泛且各病毒分布存在差异,应加强该人群病毒多病原监测,逐步完善监测系统及预警机制。
- 陈晓玲江靖郑友限潘淑萍郑丹凤龚彩婷刘建忠
- 关键词：儿童病原谱
- 实验室信息管理系统在泉州市HIV检测中的有效应用
- 2021年
- 目的改变基层实验室送检信息格式混乱、各自为政的送检状态,简化HIV确证实验室工作流程,方便实验室信息结果统计分析及数据安全管理。方法某市疾病预防控制中心艾滋病确证实验室开发应用HIV确证实验室检测信息系统,以ISO/IEC 17025《检测和校准实验室能力认可准则》及《全国艾滋病检测技术规范》指导艾滋病实验室检测流程,进行规范化、信息化、精细化管理。结果该系统建立了2010年某中心成立初筛实验室以来完整的数据库,提供了艾滋病检测实验室样品接收、档案管理、流程控制、统计分析等一系列相关解决方案,优化检测工作流程,为该模式延伸到其它实验室提供参考。结论实验室信息管理的应用为HIV检测实验室工作提供了有力的支持和保障。
- 陈伟毅杨育红郑友限陈晓玲占凌云王增强
- 关键词：HIV检测实验室信息管理系统信息网络数据库
- 不同标本EV71和CoxA16检测对于手足口病重症患者的临床意义分析被引量：25
- 2009年
- 目的:了解泉州市2008年儿童手足口病重症病例不同标本中肠道病毒EV71和CoxA16的感染情况,为我市手足口病的治疗和防控提供依据。方法:采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)及实时荧光RT-PCR方法,对泉州市36例重症病例的咽拭子、疱疹液及脑脊液标本共104份(咽拭子35份,疱疹液32份,脑脊液36份)进行EV7I和CoxA16的检测,并对部分标本进行基因分型。结果:36例重症病例均只检出肠道病毒EV71,阳性率为100%,咽拭子、疱疹液、脑脊液的检出率分别为97.2%、100%、2.8%,基因分型为C4基因亚型,与国内其他省检出的基因型相同。结论:RT-PCR和实时荧光RT-PCR是手足口病快速、敏感、特异的检测方法。咽拭子和疱疹液的检出率无显著差异,所有重症病例均为C4基因亚型的EV7I感染,只有1例脑脊液检出EV7I,并且预后较差。
- 郑友限陈明春王耿杨秀惠
- 关键词：手足口病EV71COXA16重症病例
- 泉州市2013—2016年麻疹、风疹疑似病例实验室检测结果分析被引量：1
- 2017年
- 目的了解泉州市2013—2016年麻疹、风疹疑似病例实验室检测结果,为防治提供依据。方法对送检疑似病例的血清、咽拭子标本分别检测麻疹、风疹IgM抗体和病毒RNA核酸,分析咽拭子标本合格率、采样时间与病原检出率的关系及病例特征。结果 4年共检测标本1 133份,麻疹IgM抗体阳性率22.5%(2015年最高达36.7%),RNA核酸阳性率16.7%;风疹IgM抗体阳性率4.7%,RNA核酸阳性率2.5%,病毒核酸阳性率均比IgM抗体阳性率低。核酸标本内部质控检测合格率88%。麻疹、风疹出疹8d内血清IgM抗体检出率较高;麻疹出疹5d内、风疹出疹4d内病毒核酸检出率较高。发病特征:麻疹4~7月高发(66.3%),8月龄至2岁阳性率最高(36.4%),其次是30~39岁组(32.1%);风疹4~8月高发(56.6%),主要在8月龄至2岁组(10.2%)。晋江市送检标本数和实验室确诊病例数均最多。结论泉州市近几年麻疹、风疹发病主要为婴幼儿,应加强对幼托机构和学校的监测,加强临床医生标本采集培训,以提高实验室的检测水平。
- 吴小凤陈韵妍郑友限
- 关键词：麻疹风疹IGM抗体
- 泉州市流感疫情实验室检测及H3N2亚型基因特性分析被引量：1
- 2011年
- 目的 了解2009年泉州地区流感流行及病毒株的变异情况,探讨流感病毒基因的变异与流感流行的关系.方法 对泉州市198例流感患者的咽拭子采用MDCK细胞培养进行病毒分离,经血清学试验鉴定分型和实时荧光RT-PCR方法检测病毒核酸.对其中4株毒株提取病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒HA1基因,纯化产物进行核苷酸序列测定,用DNAstar megalign软件分析基因.结果 198份咽拭子中有98份为H3N2亚型流感病毒核酸阳性,分离到62株H3N2亚型流感病毒,HA1基因经核苷酸序列测定显示,其基因特性更接近于A/Ningbo/333/2008,核苷酸同源性为98.7%,与A/Xiamen/70/2004的同源性为96.8%,由HA1基因核苷酸序列推导的氨基酸系列与疫苗株A/Brisbane/10/2007相比,有7个氨基酸位点发生变异,其中有1个位点位于抗原决定簇A区（144）,有2个位点位于抗原决定簇B区（158、189）,种系发生树分析也证实HA1基因存在一定差异.结论引起2009年泉州市流感在部分集体单位流行的病毒为H3N2亚型,其基因特性和抗原性与疫苗株相比均发生了一定变异.
- 郑友限陈明春王耿龚彩婷陈杰毅林锦忠
- 关键词：碱基序列
- 福建省首例输入性基孔肯雅热病例的调查与实验室诊断(英文)被引量：7
- 2013年
- 目的通过实验室诊断及流行病学调查证实福建省首例输入性基孔肯雅热病例。方法调查病例的流行病学史及临床表现,采用病毒核酸检测、测序等方法进行实验室诊断。结果该病例临床表现符合基孔肯雅热特征,荧光PCR、RT-PCR和测序均证实为基孔肯雅病毒感染。流行病学调查表明,该病例的感染地点在东南亚一带,与扩增的部分病毒序列比对的结果一致。结论证实福建省首例输入性基孔肯雅热病例,在流行季节亟需加强对重点人群的监测。
- 黄萌叶雯婧李锋平郑友限张拥军洪思让郑奎城严延生欧剑鸣翁育伟
- 关键词：基孔肯雅病毒流行病学调查分子诊断
- 324份新冠病毒感染者咽拭子标本qRT-PCR检测结果分析被引量：3
- 2021年
- 目的探讨新型冠状病毒(新冠病毒)感染后病毒载量变化规律,比较感染者不同种类标本核酸检测结果一致性。方法以2020年1月21日至2020年3月18日泉州市报告的48例新冠病毒感染者为对象,依据实时荧光定量反转录多聚酶链反应(qRT-PCR)咽拭子核酸检测结果,分为未复阳组29例和复阳组19例,回顾性分析所采集的324份咽拭子标本、55份深咳痰标本及36份肛拭子标本的核酸检测结果。结果未复阳组和复阳组发病到核酸检测CT值达峰值时间间隔分别为(7.1±4.8) d、(6.4±4.8) d,差异无统计学意义;未复阳组在CT值达峰值后病毒载量下降,发病后(20.7±5.7) d连续两次核酸检测阴性;复阳组病毒载量在CT值达峰值后病载下降中反跳出现第二峰,发病后(29.9±6.1) d连续两次核酸检测阴性,时间间隔比未复阳组长(t=-3.84,P<0.01);不同种类标本(采集时间、对象相同)核酸检测结果比较显示,咽拭子标本与深咳痰标本检测结果Orf1ab基因一致性差、N基因一致性一般(Kappa值<0.00、Kappa值=0.30);咽拭子标本与肛拭子标本检测结果Orf1ab基因一致性较差、N基因一致性一般(Kappa值=0.15、0.29);深咳痰标本两种基因检出率均高于咽拭子标本(配对χ^(2)值=6.50、15.43,P<0.01)。结论新冠病毒感染者中未复阳组与复阳组病程中病毒载量变化峰型不同,且复阳组发病至连续两次核酸检测阴性时间间隔较长,原因有待探究;不同种类标本的核酸检测结果,以N基因结果一致性均略好,深咳痰、咽试子标本基因检出率前者高于后者。
- 陈晓玲郑友限刘建忠陈志扬郑丹凤龚彩婷吴小凤黄晓伟
- 关键词：KAPPA值
- 泉州地区2014-2017年活禽相关外环境禽流感病毒监测及遗传进化特征被引量：6
- 2018年
- 目的分析泉州地区2014—2017年活禽相关外环境中H5、H7、H9亚型禽流感病毒的分布情况和分子生物学特点,为本地区人感染禽流感的防控和预警提供参考依据。方法采集泉州地区活禽监测场所标本,采用实时荧光定量PCR方法检测甲型流感病毒以及H5、H7、H9亚型禽流感病毒,然后对检测结果进行统计学分析;并对4株代表性H7N9禽流感病毒毒株的HA和NA基因进行核苷酸序列测定和同源性分析,用DNAstar和MEGA7.0软件进行序列分析。结果外环境标本甲型流感病毒核酸阳性率为29.04%(377/1289),其中H5、H7、H9亚型的阳性率分别为3.80%、13.34%、12.02%。各监测年份中,H7N9阳性率均高于其它亚型,其中2017年最高(21.88%)。不同类型标本中,案板的H7N9阳性率最高(65.4%)、污水次之(59.3%)、禽类饮水最低(29.6%)。采集场所中,最高的是农贸市场(61.7%)和活禽交易市场(52.8%)。对4株H7N9病毒的HA和NA基因序列分析显示,外环境和人源病毒分别属于珠江三角洲和长江三角洲谱系。HA蛋白的裂解位点均为PKGR/G,没有发生高致病性突变;NA蛋白292位氨基酸都为R,没有出现奥司他韦耐药突变;PB2蛋白中,627位氨基酸从E突变为了K,526位和701位氨基酸没有出现突变。结论泉州地区活禽相关外环境存在H7N9禽流感病毒污染,特别是农贸市场和活禽交易市场是人感染H7N9亚型的高风险场所,需要加强监测。
- 郑友限刘建忠李锋平陈志扬陈明春吴小凤
- 关键词：禽流感病毒
