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罗焜: 作品数：32 被引量：964H指数：14; 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金卫生行业科研专项长江学者和创新团队发展计划更多>>; 相关领域：医药卫生生物学农业科学化学工程更多>>

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基于ITS2条形码的五加皮基原植物及其易混品的鉴定被引量：6: 2012年; 目的:对五加皮基原植物及其易混品进行分子鉴别,为临床用药提供科学依据。方法:从GenBank数据库下载五加皮基原植物及其易混品的ITS2序列,经CodonCode Aligner,MEGA4.0等软件进行序列拼接和分析,构建NJ(邻接)、ME(最小进化)树,并应用Koetschan等建立的ITS2数据库及其网站预测ITS2二级结构辅助分析。结果:基于ITS2序列的两种系统聚类树都易于将五加皮基原植物细柱五加与其易混品鉴别开;比较与细柱五加亲缘关系较近的同属易混品二级结构可以看出,细柱五加在螺旋区茎环的数目、大小、位置以及螺旋臂由中心环伸出时的转角等方面,与其易混品间具有较明显区别。结论:ITS2序列可以将五加皮基原植物及其易混品区分开,在药用植物基原鉴定方面具有重要应用价值。; 曾旭李秋实王钤谢丽芳张亚兰罗焜刘志华; 关键词：五加皮 DNA条形码 ITS2 分子鉴定

基于COI条形码序列的《中国药典》动物药材鉴定研究被引量：35: 2013年; 药用动物是我国中药资源的重要组成部分,线粒体COI基因被公认为动物界中标准的DNA条形码基因,但利用此技术系统研究药用动物或动物药材鉴定的报道不多。本研究选取药典中45个动物药材,涉及基原物种51种,分析样品COI序列的种内种间变异情况,barcoding gap,鉴定效率等,考察COI序列鉴定动物药材的有效性和准确性。结果表明,种间变异最小值远大于种内变异最大值,barcoding gap图显示种间变异和种内变异重合较少,鉴定效率较高,除节肢动物门外,在物种水平和属水平上,鉴定效率均为100%,所构建的动物药材及其混伪品的NJ树能很好地区分正品来源与其混伪品。因此COI序列作为DNA条形码适用于药典中动物药材的鉴定。本研究为COI条形码准确鉴定药典中动物药材提供了分子依据,扩充了DNA条形码数据库中药用动物序列,并建立了利用此技术鉴定动物药材的具体技术流程。; 张辉姚辉崔丽娜杜鹤林喆高晓晨郎雪宋经元罗焜石林春陈士林; 关键词：动物药材药典 COI序列

重楼属药用植物DNA条形码鉴定研究被引量：158: 2010年; 为评价DNA条形码候选序列对重楼属药用植物的鉴定作用,探讨重楼属药用植物鉴定新方法,本研究对重楼属11个物种17份样品的psbA-trnH、rpoB、rpoC1、rbcL、matK和核ITS2序列进行PCR扩增和测序,比较各序列扩增和测序效率、种内和种间变异,进行barcoding gap分析,采用BLAST1和Nearest Distance方法评价不同序列的鉴定能力。结果显示,ITS2序列在所研究的重楼属药用植物中的扩增和测序效率均为100%,其种内种间变异、barcoding gap与其他DNA条形码候选序列相比具有明显的优势,ITS2序列在重楼属中的鉴定成功率达到100%,而生物条形码协会(CBOL)植物工作组推荐的matK和rbcL序列的鉴定成功率分别为52.9%和5.9%,二者联合鉴定能力没有提高,对于ITS2序列扩大至29个物种67份样品依然具有100%的鉴定成功率。实验结果表明,ITS2序列能够准确鉴定重楼属药用植物,可以作为潜在的药用植物通用条形码序列。; 朱英杰陈士林姚辉谭睿宋经元罗焜鲁静; 关键词：重楼属 DNA条形码 ITS2 药用植物

蛇床及其近缘物种的ITS2分子鉴定被引量：7: 2012年; 目的:对传统中药蛇床子基原植物及其近缘物种的ITS2条形码序列进行分析,探讨药用植物蛇床子的分子鉴定方法。方法:采用PCR技术扩增蛇床ITS2基因片段,进行双向测序,运用CodonCodeAligner拼接后,用MEGA5.0软件进行相关数据分析,构建NJ树。应用Schultz等建立的ITS2数据库及其网站预测ITS2二级结构。结果:蛇床与其近缘物种ITS2序列间存在明显差异,基于ITS2序列的NJ树及其ITS2二级结构均可以将蛇床及其近缘物种区分开。结论:ITS2可有效地鉴别蛇床及其近缘物种。; 殷秀梅罗焜刘美子罗红梅; 关键词：近缘物种 DNA条形码 ITS2

多基原药材秦艽ITS2条形码鉴定研究: DNA条形码技术的快速发展将促进我国中药材的质量控制和标准化建设,是国际生物分类和鉴定研究中引人注目的新方向,但目前为止该技术相关报道多采用中药材基原植物叶片进行鉴定研究,直接应用于中药材鉴定较少,业内广泛关注的采用DN...; 罗焜马培姚辉辛天怡胡燕郑司浩黄林芳刘军宋经元; 关键词：ITS2 物种鉴定稳定性; 文献传递

忍冬科药用植物DNA条形码通用序列的筛选被引量：32: 2010年; 目的:从4条DNA片段(psbA-trnH,matK,rbcL,和ITS2)中筛选可用于忍冬科药用植物鉴定的DNA条形码通用序列。方法:通过比较各序列的PCR扩增成功率、测序效率、种内和种间变异、barcoding gap和鉴定成功率等指标评价不同序列在忍冬科植物中的鉴定能力。结果:对忍冬科13个属,33个物种,58个样本进行分析,ITS2序列在属水平上的鉴定成功率为100.0%,物种水平上的鉴定成功率为96.6%。结论:ITS2序列可以作为忍冬科植物的DNA条形码候选序列,同时推荐psbA-trnH序列作为ITS2序列的补充序列。; 刘震陈科力罗焜潘宏林陈士林; 关键词：DNA条形码忍冬科 ITS2 PSBA-TRNH MATK RBCL

旋覆花属8种药用植物ITS2序列分析被引量：3: 2014年; 目的对旋覆花属8种药用植物进行ITS2序列分析，为其分子鉴定提供依据。方法对4种旋覆花属药用植物的8个样本ITS2序列进行PCR扩增和测序，同时从GenBank下载13个样本。用MEGA5．0计算其种间、种内的K2P距离，及各序列变异位点并进行聚类分析。结果旋覆花属8种药用植物ITS2的长度为210-212bp，变异位点为60个；旋覆花药材2种不同来源药用植物有3个变异位点，与其他同属6种植物有13-43个变异位点；构建的系统发育树显示旋覆花药材的不同基原样本各聚为一支，能很好与其他6种植物区分；旋覆花Inula japonica、欧亚旋覆花I.britannica、总状土木香I.racemosa、土木香I.helenium4个物种的遗传距离值远小于其与羊耳菊I.cappa、赤茎羊耳菊I.rubricaulis、显脉旋覆花I.nervosa、泽兰羊耳菊I.eupatoerioides4个物种的遗传距离值。结论ITS2序列能够为旋覆花属8种药用植物的鉴定和Flora of China对羊耳菊、赤茎羊耳菊、显脉旋覆花、泽兰羊耳菊分类修订提供一定的分子证据。; 刘义梅喻珊罗焜姚辉陈科力; 关键词：旋覆花属变异位点分子鉴定羊耳菊

生物资源的DNA条形码技术被引量：63: 2013年; DNA条形码是近年提出的一种分子鉴定新技术,该技术有利于发现新种和保护生物多样性,可有效监控珍稀濒危物种进、出口贸易,可实现有害生物及入侵种的快速查验,对我国生物资源保护具有重大意义。对DNA条形码技术在生物物种鉴定与分类、珍稀濒危和贵重生物资源保护、海关贸易监控、生物多样性保护及中药鉴定领域的重要实践应用进行了综述,认为DNA条形码技术在生物分类学、生物物种监管及中药流通管理等领域具有广阔的应用前景。; 陈士林庞晓慧罗焜姚辉韩建萍宋经元; 关键词：生物资源 DNA条形码生物多样性中药

基于rbcL+matK复合序列的植物DNA条形码的研究: 目的根据天南星科实验数据和GenBank数据库获得数据的生物信息学分析对国际植物条形码工作组（CBOL）提出的植物界条形码序列——rbcL+matK进行验证。方法选取rbcL+matK序列,针对天南星科98属223种49...; 罗焜宋经元姚辉陈士林; 关键词：维管植物天南星科 MATK RBCL; 文献传递

ITS2序列鉴定筋骨草及其近缘种被引量：17: 2008年; 本研究对筋骨草ITS2区段测序,探讨该片段用于中药筋骨草、白苞筋骨草、白毛夏枯草和夏枯草种间分子鉴别和系统学研究中的意义,我们对核基因ITS2区段进行PCR扩增并测序,获得了该区间的完整序列,所得序列用软件MEGA4.0进行相关分析。测得筋骨草、白苞筋骨草、夏枯草和白毛夏枯草的ITS2片段长度分别为312bp,304bp,303bp,304bp。四个物种ITS2片段序列的遗传距离(Kimura2)为0.010～0.175,各个筋骨草种内的不同产地该序列无差异。用MP法根据ITS2序列的遗传距离建立系统发生树,聚类结果和形态分类相符。根据ITS2序列特征,能有效区分筋骨草和其他易混中药材。ITS2具有做为鉴定的条形码序列的潜力。应用该序列可以有效鉴定筋骨草及其近缘种。; 韩建萍石林春陈士林钱俊罗焜陈科力; 关键词：筋骨草

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