王非
- 作品数:2 被引量:6H指数:2
- 供职机构:中国科学院上海药物研究所更多>>
- 发文基金:重庆市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 组氨酸激酶(YycG)在筛选肺炎链球菌抑制剂中的应用被引量:4
- 2009年
- 为了获得具有体外活性的肺炎链球菌组氨酸激酶YycG并利用其筛选寻找新的抑制剂。原核表达组氨酸激酶YycG的激酶功能域,经SDS-PAGE,Western blot鉴定及镍层析柱纯化后,采用激酶试剂盒检测其激酶活性;利用对其激酶活性的抑制作用从105种候选化合物中筛选有效的抑制剂,并通过实验验证抑制剂的抗菌作用。原核表达得到约35kDa的目的蛋白激酶域片段YycG′,其纯度达95%,并具有体外水解ATP的激酶活性;利用其活性筛选得到数种不同抑制效果的小分子化合物,且体外验证具有较好的抑菌效果。通过肺炎链球菌组氨酸激酶YycG活性筛选找到的小分子抑制剂可为进一步研发与该菌相关的药物或消毒剂提供基础。
- 李南王非牛司强王虹李有强尹楠林张雪梅朱维良尹一兵胥文春
- 关键词:组氨酸激酶蛋白纯化酶活性体外筛选
- 肺炎链球菌双组份系统中的组氨酸激酶(YycG)的同源模建与分析被引量:4
- 2009年
- 对肺炎链球菌双组份系统中的组氨酸激酶YycG进行同源模建,并分析其与底物ADP的相互作用,为寻找特异性的激酶抑制剂提供了理论依据。采用同源模建的方法构建YycG蛋白的三维结构,并用ProCheck、Profile_3D软件对此结构模型的合理性进行验证;用Autodock4.0软件将结构模型与ADP进行自动对接,分析二者之间的相互作用。序列比对结果显示肺炎链球菌YycG蛋白与Thermotoga maritima X-ray晶体结构序列的同一性达33%;YycG模建后的结构与模板能很好的叠合;在活性口袋处的保守的氨基酸残基Asn145、Asn149、Lys152以及口袋内部的疏水残基在结合、水解底物ADP的过程中发挥重要作用。组氨酸激酶YycG的模建合理,该结构模型可作为设计抗菌药的研究起点。
- 李南王非胥文春王虹罗小民朱维良尹一兵张雪梅
- 关键词:肺炎链球菌组氨酸激酶同源模建分子对接