柴惠
- 作品数：36 被引量：97H指数：6
- 供职机构：浙江中医药大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：浙江省教育厅科研计划浙江省自然科学基金浙江省医药卫生科学研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生文化科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 生物基因与蛋白质序列比对算法的图形硬件加速研究
- 2012年
- [目的]探索准确、高效、低成本、通用性并存的生物序列比对方法。[方法]将点阵图算法、启发式算法等各种序列比对算法中准确性最高的动态规划算法予以在计算机中实现,并通过流模型将其映射到图形硬件上以实现算法加速,通过数据库比对搜索实例进行比对时间和每秒百万次格点更新(MCUPS)性能值评测。[结果]与目前最快的启发式算法相比,该加速算法比对平均加速为18倍,最高加速可达28倍。[结论]该加速算法在保证比对准确性的同时,能较大地提高比对速度。
- 冯梦蝶张林柴惠
- 关键词：生物分子动态规划算法图形硬件
- 蒜氨酸与大蒜素抑制肿瘤坏死因子α诱导的炎症反应对比被引量：2
- 2012年
- 目的比较蒜氨酸与大蒜素对肿瘤坏死因子α诱导的炎症反应的抑制作用,并进一步探讨蒜氨酸能否取代大蒜素的抗动脉粥样硬化作用。方法将细胞分成10组:对照组、肿瘤坏死因子α组(1μg/L)、蒜氨酸组、大蒜素组、肿瘤坏死因子α(1μg/L)+蒜氨酸(5 mg/L、10 mg/L、30 mg/L)组、肿瘤坏死因子α(1μg/L)+大蒜素(5mg/L、10 mg/L、30 mg/L)组,分别培养16 h。提取各组细胞mRNA,用实时定量PCR测定细胞间黏附分子1的表达水平;用虎红染色法检测人单核细胞与人脐静脉内皮细胞的黏附性;用划线法和MTT法分别检测大蒜素和蒜氨酸对平滑肌细胞迁移和增殖作用的影响。结果蒜氨酸和大蒜素预处理都能有效抑制肿瘤坏死因子α诱导的细胞间黏附分子1表达量的增高,并减弱由其导致的单核细胞对人脐静脉内皮细胞的黏附性增加,同时能抑制由肿瘤坏死因子α诱导的平滑肌细胞迁移和增殖作用。结论蒜氨酸与大蒜素对肿瘤坏死因子α介导的炎症反应及动脉粥样硬化均有一定的抑制作用,并且效果相近,因此蒜氨酸一定程度上可以取代大蒜素。
- 柴惠马建龙江婷婷余军伟凌超叶文晶沃兴德
- 关键词：蒜氨酸大蒜素肿瘤坏死因子Α细胞间黏附分子1人脐静脉内皮细胞
- 丹酚酸A抑制TLR4/JNK MAPK改善棕榈酸诱导的心肌细胞损伤被引量：1
- 2021年
- 目的:研究丹酚酸A对脂毒性诱导的H9C2心肌细胞损伤的改善作用并初步探究其分子机制。方法:采用棕榈酸体外诱导建立H9C2心肌细胞脂毒性模型并给予丹酚酸A进行干预,采用乳酸脱氢酶法检测细胞损伤,采用细胞增殖-毒性检测试剂盒检测细胞存活率,采用罗丹明123染色观察心肌细胞线粒体膜电位变化,采用蛋白免疫印迹技术研究丹酚酸A改善作用的分子机制。结果:浓度为400μmol/L的棕榈酸可显著导致H9C2心肌细胞脂毒性损伤(P<0.05)。不同浓度(10、20、40、80μmol/L)丹酚酸A暴露对心肌细胞无毒性作用(P>0.05)。丹酚酸A干预显著改善脂毒性诱导的心肌细胞损伤及细胞线粒体膜电位降低(P<0.05)。激活Toll样受体4(Toll-like receptors,TLR4)可显著增强脂毒性诱导的心肌细胞损伤(P<0.05),而抑制TLR4显著减轻棕榈酸诱导的细胞脂毒性(P<0.05)。此外,丹酚酸A显著抑制棕榈酸诱导的TLR4及其下游c-Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinase,JNK MAPK)(P<0.05)。结论:丹酚酸A改善脂毒性诱导的心肌细胞损伤,该保护作用可能与其抑制TLR4/JNK MAPK信号通路有关。
- 徐甜甜吴相尧皮爱文柴惠张斌王邦才窦晓兵窦晓兵
- 关键词：丹酚酸A棕榈酸TOLL样受体4脂毒性心肌细胞
- 人参皂甙抑制肿瘤坏死因子α介导的内皮细胞炎症反应被引量：6
- 2009年
- 目的探讨人参皂甙Rb1能否抑制人脐静脉内皮细胞中肿瘤坏死因子α引起的细胞炎症反应的发生。方法将细胞分成四组:对照组(不经任何药物处理)、肿瘤坏死因子α组、人参皂甙Rb1组和肿瘤坏死因子α加人参皂甙Rb1组,分别培养16 h。提取各组细胞mRNA,用实时荧光定量PCR和流式细胞仪测定血管细胞黏附分子1的表达水平;用标记上Calce in-AM的人单核细胞检测人脐静脉内皮细胞单分子层的黏附性;用超氧化物阴离子荧光探针DHE在流式细胞仪上测定超氧阴离子产物,并用荧光探针JC-1检测线粒体膜电位变化。结果人参皂甙Rb1预处理能有效阻止肿瘤坏死因子α诱导的血管细胞黏附分子1 mRNA增高,并减弱由其导致的单核细胞对人脐静脉内皮细胞的黏附性增加。人参皂甙Rb1还能减少肿瘤坏死因子α诱导的超氧阴离子产物增加,并抑制由其引起的线粒体膜电位衰减。结论人参皂甙Rb1对炎症及心血管疾病有潜在的治疗作用。
- 柴惠袁小凤沃立科张林黄燕芬
- 关键词：人参皂甙肿瘤坏死因子Α血管细胞黏附分子1人脐静脉内皮细胞
- 姜黄素脂质纳米粒对人脐静脉内皮细胞细胞因子表达的影响被引量：1
- 2018年
- 目的通过检测姜黄素脂质纳米粒对人脐静脉内皮细胞（HUVEC）分泌一氧化氮（NO）与细胞间粘附分子（ICAM-1）表达水平的影响，探讨新剂型对于动脉粥样硬化疾病的抑制作用。方法制备姜黄素脂质纳米粒，培养HUVEC细胞，随机分正常组、模型组、脂质纳米粒空载药组，三组剂量呈梯度的姜黄素脂质纳米粒药物组。10μg／LTNF—α刺激后，加入5-60mg／L姜黄素纳米制剂，用MTT增殖实验检测姜黄素脂质纳米粒对HUVEC细胞增殖作用的影响；采用实时荧光定量PCR测定一氧化氮合酶（eNOS）与ICAM—1的基因表达水平；通过ELISA法观察ICAM-1的含量；用硝酸还原酶法检测No表达量。结果MTT法检测显示5~30mg／L姜黄素脂质纳米粒对细胞活力无明显影响，当药物浓度为60mg／L时，活细胞数量有所减少。与正常组比较，模型组eNOS表达量降低（P〈0．01），姜黄素脂质纳米粒预处理的HUVEC细胞可显著上调eNOS基因表达（P〈0．01），促进N0分泌量增多（P〈O．01）；TNF-α引起的血管细胞粘附分子ICAM-1中mRNA的表达上升（P〈0．01）；姜黄素脂质纳米粒预处理的HUVEC细胞ICAM-1mRNA表达量与血清中的ICAM-1蛋白含量比较较模型组有明显下降（P〈0．01）。结论姜黄素脂质纳米粒剂型制备成功，结果显示该剂型可以上调内皮细胞eNOS的表达、促进No的分泌、抑制TNF-α引起的子ICAM-1表达上升，从而发挥内皮细胞保护作用以及抗动脉粥样硬化作用。
- 刘佳闫昭芫郑思彤甘力柴惠
- 基于图形硬件加速的生物序列比对算法研究被引量：1
- 2011年
- 生物序列比对是生物信息学的基础,是当今功能基因组学研究中最常用、最重要的研究方法之一。本文对各类序列比对算法优缺点进行分析,对图形硬件的优势进行挖掘。在此基础上,将各类序列比对算法中准确性最高的动态规划算法予以实现,并将其映射到图形硬件上,以实现算法加速。通过实例进行性能评测,结果表明该加速算法在保证比对准确性的同时,能较大地提高比对速度。
- 张林柴惠沃立科袁小凤黄燕芬
- 关键词：动态规划算法图形硬件
- 中药对中医不同证型动物血和肝线粒体蛋白质组影响的研究
- 卢德赵唐利华李毅杨贞柴惠沃兴德沃立科
- 祖国医学是一个伟大的宝库，在数千年中华民族繁衍和保健中起到了重要作用。祖国医学的精华在于视人体为一个整体，由此建立了阴阳五行、辩证施治的学术思想。为了能推进中医基本理论的研究，证明中医不同证型的物质基础和中药作用的分子机...
- 关键词：
- 关键词：中医基本理论蛋白质组学中药治疗
- 基于SOBER故障定位模型的关联谓词赋值偏好改进方法
- 2009年
- 针对基于统计理论的故障定位模型SOBER,研究软件故障的自动定位技术.通过程序研究及大量实例分析,探明SOBER模型的局限性——因为谓词关联性问题而导致故障定位准确度不高,并提出一种新的关联谓词赋值偏好方法,并进行了实证研究.实验结果表明,该方法较好地解决了谓词干扰问题,从而提高了基于SOBER模型的故障定位准确率.
- 张林蔡铭柴惠
- “以学生为中心”教学与教学评价的理论与实践探索——以医学生物信息学为平台被引量：6
- 2014年
- 随着主体教育的深入和素质教育的推行,"以学生为中心"的教育思想得到了教育界的高度重视。文章从理论角度,深度剖析了"以学生为中心"教学和教学评价的特点及重要性;并以医学生物信息学为平台,对其进行了实践探索。结果显示,"以学生为中心"教学和教学评价能较好地培养学生解决问题、自我评价、信息处理等高级技能,提升创新能力。
- 张林柴惠
- 关键词：教学评价
- 《普通生物学》教学改革的探索和实践被引量：5
- 2009年
- 随着教学改革的进行,为了在短学时内有效地完成《普通生物学》课的教学任务,对教学内容进行了相应地缩减,并将教学内容制作成电子课件,充分利用多媒体进行教学,将"讲授法""讨论法""自学指导法""实验法""启发式教学""比较式教学"等教学方法进行优化组合,加强教学质量和效果,充分提高了学生的学习积极性.
- 袁小凤柴惠张林
- 关键词：普通生物学教学内容教学方法
