杨斌
- 作品数:3 被引量:17H指数:3
- 供职机构:新疆农业大学科学技术学院更多>>
- 发文基金:国家科技基础条件平台建设计划更多>>
- 相关领域:农业科学文化科学更多>>
- 鸡堆型艾美耳球虫新基因的克隆与生物信息学分析被引量:3
- 2014年
- 试验旨在对堆型艾美耳球虫(Eimeria acervulina)孢子化卵囊新基因EST序列进行克隆与生物信息学分析。通过RACE技术扩增从E.acervulina cDNA表达文库中筛选获得的EST序列,得到EST全长cDNA序列,利用多种生物信息学分析软件对其编码蛋白进行分析和预测。结果表明,该EST序列为E.acervulina孢子化卵囊阶段新基因,GenBank登录号为EU590120;该基因含1个492 bp的开放阅读框,编码163个氨基酸,理论分子质量为17.049 ku,等电点为6.69,酸性氨基酸8个,碱性氨基酸8个,分子式为C761H1223N199O219S12总平均亲水性(GRAVY)为0.731;该蛋白有信号肽,为分泌性蛋白;具有4个跨膜结构,在105~115、28~32和132~138位之间有很强的疏水性;具有1个蛋白激酶C磷酸化位点、1个N-糖基化位点、2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、4个N端豆蔻酰基化位点。因此根据生物信息学全面预测和分析,发现该基因所编码的蛋白具有较多的生物学功能位点和潜在的抗原表位区域。
- 阎晓菲黄兵韩红玉杨斌岳城赵其平姜连连董辉
- 关键词:球虫堆型艾美耳球虫新基因克隆生物信息学
- 《生物技术综合实验》教学体系改革及效果评价被引量:10
- 2013年
- 为了培养学生的实践能力和创新意识,根据生物技术专业特点,对《生物技术综合实验》课程在教学内容和教学方法上,提出了改革措施。结合自身学科发展特点,优化课程体系、增删教学内容、完善实验考核方式,收到了较好的教学效果,提高了学生的动手操作能力。实践证明该门课程的改革符合独立学院培养学生的目标。
- 阎晓菲童婷代培红杨斌陈琴谢文华张新玲
- 关键词:教学内容教学方法教学效果
- 超声波提取牛奶中细菌DNA方法的优化被引量:4
- 2014年
- 本试验通过采集乌鲁木齐燕儿窝种牛场2003年5月份所有泌乳奶牛的牛奶样品,使用不同超声波功率(0、100、120、140、160W)处理后,采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)、十二烷基磺酸钠(SDS)法提取牛奶中细菌DNA,并通过DNA浓度、纯度和细菌通用引物扩增16SrDNA的V6-V8区判定DNA的质量,筛选出提取牛奶中细菌DNA的最佳方法。结果表明,未使用超声波处理样品,直接采用CTAB、SDS法提取出的DNA无法扩增出细菌16SrDNA V6-V8区,而使用不同超声波功率(100、120、140、160W)处理后能扩增出细菌16SrDNA V6-V8区,其中超声波功率140W处理样品10min并结合CTAB法提取牛奶中细菌DNA的浓度最高,为203.35μg/mL。因此,超声波功率140W处理样品并结合CTAB法提取牛奶中细菌DNA的方法最优,能满足从分子水平上进一步研究乳房炎相关细菌的要求。
- 阎晓菲林善童婷王金泉黄可欣董轩岳美婷叶东东杨斌
- 关键词:乳房炎细菌超声波DNA提取PCR