李鹏
- 作品数：11 被引量：13H指数：1
- 供职机构：四川大学生命科学学院更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生更多>>
- 种群基因组研究揭示中国狼高海拔适应性
- 中国狼曾经在中国广泛分布,现在分布区已大大缩减.对于中国狼的遗传结构和进化历史研究较少.为了更好的研究其遗传结构、进化历史和适应性进化等方面的问题,我们对8 个来自中国不同区域的野生中国狼个体(西藏、青海、内蒙古、新疆各...
- 张文平张志和范振鑫黄杰李鹏刘红侯蓉张修月Robert Wayne岳碧松
- 德国小蠊全基因组中微卫星分布规律被引量：13
- 2015年
- 【目的】分析德国小蠊Blattella germanica全基因组中微卫星的数量和分布规律,并对外显子中含有微卫星的基因进行功能注释。【方法】使用微卫星搜索软件查找德国小蠊基因组中微卫星的数量、重复次数以及所有微卫星的位置信息,编写Python脚本对微卫星进行定位,并通过Blast2Go和KASS程序对外显子中含有微卫星的基因进行功能注释。【结果】共找到1~6碱基重复类型的微卫星序列604 386个,总长度15 301 255 bp,约占全基因组序列(约2.04 Gb)的0.75%,分布频率为1/3.37 kb,微卫星序列的长度主要在12~60个碱基长度范围内。不同类型的微卫星中,三碱基(226 876)重复类型微卫星数量最多,占微卫星总数的37.54%;四碱基(150 355)重复类型次之,占微卫星总数的24.88%;其余依次是单碱基(141 167)、二碱基(60 877)、五碱基(21 570)和六碱基(3 541)重复类型,分别占微卫星总数的23.36%,10.07%,3.57%和0.59%。出现最多的重复拷贝类别有:ATT,AAT,A,T,AAAT,ATTT和AT,共411 789个微卫星,占微卫星总数的68.13%,这7种类别的微卫星数量均大于30 000个。共有2 372个微卫星在外显子上,它们分别位于1 481个基因上。GO功能注释结果表明,其中434条归类于细胞组分(cellular component),402条归类于分子功能(molecular function),660条归类于生物学过程(biological process)。KEGG通路分析结果表明,与新陈代谢相关的基因最多(380个),其次是与机体系统相关的(276个),与遗传信息进程相关的基因最少(92个)。【结论】本研究为进一步系统深入分析德国小蠊微卫星功能及微卫星分子标记筛选打下了基础。
- 王晨杜联明李鹏杨茗羽李午佼沈咏梅张修月岳碧松
- 关键词：德国小蠊微卫星生物信息学功能注释基因组外显子
- 藏酋猴血液转录组分析
- 藏酋猴(Macaca thibetana)属猴科Cercopithecidae、猕猴属Macaca,是中国特有种,为国家Ⅱ级保护动物。藏酋猴在体型、行为特征等方面较其它猕猴属物种有较大差异,目前它已作为模式动物在生物医学...
- 李鹏杜联明李午佼易勇岳碧松李静
- 关键词：藏酋猴血液转录组基因注释
- 文献传递
- 三种猕猴基因组中微卫星的分布规律及特征
- 微卫星是常用的分子标记,它广泛地分布在许多生物的基因组中.本研究利用生物信息学的方法,使用MSDBv2.4.3软件搜索和统计了恒河猴、食蟹猴以及豚尾猴三个猕猴属物种基因组中的1-6 bp重复类型的完整型微卫星.三个物种基...
- 刘三许侯伟孙天林李鹏范振鑫李静
- 关键词：恒河猴食蟹猴基因组微卫星
- 基于微卫星位点的米亚罗圈养林麝种群遗传结构评估
- 黄杰李玉芝李鹏岳浩李旭鑫张修月邹方东岳碧松
- 关键词：微卫星
- 藏酋猴血液转录组分析
- 藏酋猴(Macaca thibetana)属猴科Cercopithecidae、猕猴属Macaca,是中国特有种,为国家Ⅱ级保护动物。转录组数据可反映生物个体在特定空间和时间所有基因的表达水平,有助于深入了解其生命活动特...
- 李鹏杜联明李午佼易勇岳碧松李静
- 关键词：藏酋猴血液转录组免疫系统基因注释
- 猕猴属的分子系统进化:核标记vs线粒体标记
- 猕猴属属于猴科，是灵长类中辐射进化最成功的谱系之一.基于形态学特征和线粒体DNA 序列的分析尚未构建出猕猴属动物清晰、明确的系统进化关系.本研究以地中海猕猴(Macaca sylvanus)、豚尾猴(M.nemnestr...
- 蒋娟李鹏崔瑶瑶余建秋岳碧松李静
- 关键词：猕猴属系统进化线粒体核基因
- 棕背伯劳的研究进展
- 2011年
- 综述棕背伯劳的研究进展。主要介绍棕背伯劳色型分类存在的问题及色型多态现象产生的内在机制,同时综述了棕背伯劳的食性和繁殖行为。
- 王淋波高依敏李鹏刘武华黄杰刘梦瑶杨承忠
- 关键词：棕背伯劳食性繁殖行为
- 三种猕猴血液转录组比较分析
- 李鹏杜联明李午佼余建秋牛李丽易勇岳碧松李静
- 藏酋猴基因组测序及其与恒河猴和食蟹猴的比较基因组研究
- 在全基因组水平分析猕猴动物的遗传变异对于深入阐明这类广泛使用的模式动物的遗传学背景从而对其开展保护和应用具有重要意义.迄今猕猴动物全基因组的分析仅集中于恒河猴和食蟹猴.藏酋猴作为我国特有的猕猴属动物，也是猕猴属中体型最大...
- 范振鑫赵广杜联明易勇张修月李鹏王红星岳碧松李静
- 关键词：藏酋猴基因组SNPS种群历史
