李昕
- 作品数:11 被引量:23H指数:3
- 供职机构:西北农林科技大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家杰出青年科学基金云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目更多>>
- 相关领域:生物学经济管理更多>>
- 马家沟流域商品型生态农业系统耦合及优化研究
- 马家沟流域作为黄土高原丘陵沟壑区典型流域,与同一区域的其他流域相似,为了水土保持的目的,经历了一个长期的生态恢复的时期。在这一时期里,当地的农业经济的发展由于自然状况和生态保护强烈需求的客观原因,一直处于发展缓慢的状态。...
- 李昕
- 文献传递
- 核苷酸水平上对自然选择作用的检验及人CDYL基因中两个新外显子起源与进化的研究
- 非编码区序列在基因表达调控中起着重要作用,但其在进化过程中是否受到选择作用一直较难检测。最近有一些研究使用平均的核苷酸替换速率与中性序列的核苷酸替换速率的比值(ω)作为检测非编码区选择作用的指标。ω<1,ω=1或者ω>1...
- 李昕
- 关键词:外显子正选择进化过程进化生物学选择性剪切最大似然法
- 文献传递
- 年轻新基因起源和遗传进化的机制研究
- 王文杨爽周琦蔡晶李昕
- 不同物种具有不同基因数目,新基因不断产生是生物进化中的一个普遍事件,因此新基因如何起源和进化不仅是进化生物学中的重要问题,也是生命科学中的一个基本问题。但遗憾的是,对该问题长期以来知之甚少。近10年来,王文研究团队通过实...
- 关键词:
- 关键词:基因起源遗传进化进化生物学
- 温州市农产品区域公用品牌建设的研究
- 目前中国经济进入到了高质量发展时期,农业农村经济逐渐向数量和质量并重、兼顾绿色生态的方向发展。随着城镇化进程加快和人们生活水平不断提高,消费市场逐渐呈现出多元化、个性化、品质化的特征,消费者对农产品的产地、品质、品种等提...
- 李昕
- 关键词:农产品区域公用品牌
- 新基因的起源与进化被引量:13
- 2004年
- 随着基因组数据的大量积累,人们愈加认识到各种有机体中基因数目的巨大差异.这些差异的存在表明,新基因如何产生不仅是一个重要的进化生物学问题,也是生命科学中面临的一个基本问题.对新基因起源机制的探索,可以追溯到大半个世纪以前,然而直到上世纪90年代第一个年轻基因——精卫基因(jingwei)的发现,才使以实证方法研究新基因起源的分子机制成为可能.此后的10多年中又陆续发现一些新的年轻基因的例子,对这些基因起源与进化的研究极大地丰富了人们在这一领域的认识.但目前有限的例子难以从整体的水平对基因组中新基因产生的速率以及新基因的产生对原基因组的影响等问题作出解答.我们正致力于在基因组的水平寻找更多年轻基因的实例,以期总结新基因起源与进化的一般规律.
- 李昕杨爽彭立新陈宏王文
- 关键词:进化正选择基因重复逆转座基因水平转移
- 家蚕等鳞翅目昆虫茧丝进化机制及基因资源挖掘
- 王文相辉李昕陈垒董扬张国捷任彦栋刘晖
- 蚕丝业是中国重要的传统产业。云南省蚕桑种植面积居全国第三,蚕桑产业发展迅猛,产业升级任务迫切。该项目着眼于利用进化基因组学手段及基因组编辑平台,从遗传学和表观遗传学视角解析家蚕等鳞翅目绢丝昆虫的茧丝进化机制,挖掘优良基因...
- 关键词:
- 关键词:家蚕昆虫表观遗传学
- 新外显子的起源与功能及短同源序列介导转录滑动产生嵌合RNA的研究
- 新外显子的起源是一种重要的增加转录组和蛋白质组多样性的分子机制。对于新外显子及其父本基因的进化和功能特征方面还有很多重要的问题有待于解决。本研究首先在全基因组水平上鉴定在人和小鼠中产生的新外显子,随后对这些外显子及其父本...
- 李昕
- 关键词:快速进化
- 哺乳动物中不同表达丰度外显子的进化特征
- 2010年
- 通过比较基因组学方法,利用哺乳动物基因组数据对不同表达丰度外显子的进化特征进行了研究.以非编码区和假基因为对照,对外显子进行序列相似度、phastCons和Ka/Ks分析,结果显示,高表达外显子十分保守而低表达和低表达的外显子也在物种间表现出保守的进化特征.低表达丰度的外显子构成了物种转录组中大多数的转录本种类,结果显示它们的进化都受到功能限制,暗示它们可能在生物进化过程中为增加生物复杂度做出贡献.
- 李洁方林李昕张晓妍叶葭胡卫红郑冰蓉俞海菁肖春杰
- 关键词:外显子进化
- 重复元件介导的重组是新嵌合基因形成的一个重要机制被引量:3
- 2009年
- 先前的研究提示重复元件在产生新的嵌合基因中具有机制性的作用,这与经典的外显子洗牌模型是一致的,它依赖于非同源重组。而近期一些关于染色体异常的研究结果显示,异位的同源重组可能对于产生新基因也非常重要。本项研究通过对8种果蝇的年轻基因进行筛选和分析,从中识别出了17个重复片段,它们是在最近1200万年中通过异位重组形成的。它们中的大多数已具有功能,并进化出多样的表达类型和嵌合结构。这些结果证实,重复元件介导的非等位同源重组在产生新嵌合基因中起到重要作用。
- 杨爽J.Roman Arguello李昕丁昀周琦陈英张越赵若苹Frdric Brunet彭立新龙漫远王文
- 关键词:嵌合基因新基因
- 一种在核苷酸水平检测自然选择的新方法被引量:2
- 2005年
- 非编码区序列在基因表达调控中起着重要作用,但其在进化过程中是否受到选择作用一直较难检测。最近有一些研究使用平均的核苷酸替换速率与中性序列的核苷酸替换速率的比值(ω)作为检测非编码区总体受选择作用的指标;但是对于非编码区而言,了解具体哪些核苷酸受到选择作用更具有意义。我们借鉴Nielsen&Yang(1998)检测单个氨基酸位点是否受选择作用的思路,在最大似然法的模型下,提出一种在核苷酸位点水平上对自然选择作用检测的方法。本方法能够检测在进化过程中对功能分化有重要贡献的核苷酸位点,包括编码和非编码区。将此方法应用于熟知的受到正选择作用的蛋白编码基因序列(HIV-1包装蛋白基因编码区),均能够检测到那些已知的受到正选择的核苷酸(密码子)位点,说明此方法可以有效地在核苷酸位点水平检测选择作用;又将此方法应用于非编码区(CTGF基因5′UTR),也得到了良好的结果。
- 李昕陈宏王文
- 关键词:自然选择非编码区最大似然法