周晓君
- 作品数:9 被引量:18H指数:2
- 供职机构:中国海洋大学更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学理学农业科学更多>>
- 条斑紫菜功能基因构成的基因芯片
- 本发明是一种条斑紫菜功能基因构成的基因芯片,是在适合的载体面上点制组合有如附表所示的471个序列点,诸序列点所对应代表的EST在国际基因序列库(GeneBank)中的接收号及其对应的矩阵号:1——4;列号:1——11;行...
- 茅云翔周晓君隋正红徐民俊
- 文献传递
- 条斑紫菜锰超氧化物歧化酶及其制备方法
- 本发明是一种条斑紫菜锰超氧化物歧化酶及其制备方法。该酶含有224个氨基酸残基,预测分子量为24469.09Da,在其N-端的24个氨基酸残基中疏水氨基酸占大部分,该肽段的作用为将该酶转运至线粒体;在该酶的氨基酸序列中第2...
- 茅云翔隋正红王荣周晓君王孟强
- 文献传递
- 条斑紫菜cDNA微阵列制备及其在世代差异基因表达检测中的应用被引量:4
- 2006年
- 为了高通量研究不同世代条斑紫菜的基因表达情况,选择了467个包含诸多功能基因的条斑紫菜基因克隆,经PCR扩增纯化后,点样于多聚赖氨酸包被的基片上制备了条斑紫菜功能基因cDNA微阵列。采用Cy3-dCTP和Cy5-dCTP荧光分别标记条斑紫菜配子体和孢子体cRNA,与阵列进行杂交后,获得了信号清晰、重复性良好的扫描图像。经对标准化处理后的467个基因的数据进行分析发现:在配子体中表达量上调的基因有55个,其中有21个基因与已知功能基因或推测功能基因相匹配;在孢子体中表达量上调的基因有86个,其中与已知功能或假定功能基因相匹配的基因有24个。实验证明,优化的cDNA微阵列制备技术用于条斑紫菜基因表达分析有较高的效率和可靠的实用性能。
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- 关键词:条斑紫菜CDNA微阵列生物信息学基因表达谱
- 条斑紫菜Delta5脂肪酸去饱和酶基因部分序列的克隆和分析
- 构建cDNA文库及表达序列标签分析(ESTs),克隆了条斑紫菜丝状孢子体△5脂肪酸去饱和酶基因(DesC),进行了核苷酸序列测定和相关分析,由此得出了相应的氨基酸序列,并与其他物种的同源序列进行了同源性分析.结果表明:所...
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- 关键词:氨基酸序列
- 条斑紫菜超氧化物歧化酶全长基因序列分析
- 本实验室已有的条斑紫菜(Porphyrayezoensis)cDNA文库的EST分析结果,选择与紫菜抗逆性相关的超氧化物歧化酶(Superoxidedismutase,SOD)基因.对该克隆的插入片断进行测序,得一段10...
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- 关键词:条斑紫菜核苷酸序列
- 条斑紫菜功能基因构成的基因芯片
- 本发明是一种条斑紫菜功能基因构成的基因芯片,是在适合的载体面上点制组合有如附表所示的471个序列点,诸序列点所对应代表的EST在国际基因序列库(GeneBank)中的接收号及其对应的矩阵号:1—4;列号:1—11;行号:...
- 茅云翔周晓君隋正红徐民俊
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- 条斑紫菜cDNA微阵列制备与应用及锰超氧化物歧化酶基因克隆与序列分析
- 紫菜是一种重要的海洋红藻,目前全世界报道的紫菜约有134种。条斑紫菜/(P. yezoensis Ueda/)是太平洋西部特有的物种,主要分布于中国、日本和朝鲜半岛,为目前最具经济价值的栽培海藻之一。条斑紫菜是潮间带藻类...
- 周晓君
- 关键词:条斑紫菜CDNA微阵列差异表达基因
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- 条斑紫菜锰超氧化物歧化酶基因克隆与序列分析被引量:15
- 2006年
- 为研究紫菜抗逆抗病的分子机制,以本实验室建立的条斑紫菜表达序列标签(EST)和全长cDNA富集文库,结合PCR技术,克隆了条斑紫菜编码锰超氧化物歧化酶(Mn-SOD)的cDNA及基因组DNA全长序列,并进行了序列特性相关分析.研究结果表明:该基因cDNA序列全长为958个核苷酸,包含一个完整Mn-SOD基因的ORF,编码224个氨基酸和终止密码子;该基因在基因组中序列长度为1416bp,包含4个外显子和3个内含子,这既不同于高等植物的6个外显子和5个内含子,也不同于人的5个外显子和4个内含子;该基因编码区密码子的平均GC含量为60.9%,第三位密码子的GC含量高达84.9%;序列中包含4个与Mn^2+的结合位点及一个保守的金属结合结构域,预测分子量为24469.09Da,等电点为5.99;条斑紫菜Mn-SOD与人的相关蛋白具有类似的空间结构,都有6个跨膜α螺旋结构域;由cDNA序列推导的氨基酸序列与莱茵衣藻相似性为57.7%,系统发生分析表明条斑紫菜Mn-SOD与绿藻莱茵衣藻和硅藻海链藻的亲缘关系较近.这是该基因在红藻门中的首次报道.
- 王荣刘涛周晓君庄筠昀茅云翔
- 关键词:条斑紫菜
- 条斑紫菜锰超氧化物歧化酶及其制备方法
- 本发明是一种条斑紫菜锰超氧化物歧化酶及其制备方法。该酶含有224个氨基酸残基,预测分子量为24469.09Da,在其N-端的24个氨基酸残基中疏水氨基酸占大部分,该肽段的作用为将该酶转运至线粒体;在该酶的氨基酸序列中第2...
- 茅云翔隋正红王荣周晓君王孟强
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