- 3种RNA提取方法在血清丙型肝炎病毒RNA定量检测中的性能评价被引量:6
- 2009年
- 目的比较3种方法对血清HCV RNA的提取性能,并对其作方法学评价,揭示RNA提取技术对HCVRNA定量的影响。方法使用QIAamp Viral RNA Mini Kit(Q法),NucliSens miniMag系统(M法)和匹基(PG)丙型肝炎病毒定量试剂盒自带RNA提取方法(P法)进行血清HCV RNA提取,实时荧光RT PCR定量检测,对77例临床血清标本进行了提取检测,同时设计了方法学评价实验,从准确度,重复性,线性和灵敏度方面评价3种方法。结果77例临床标本的M、Q和P法阳性率分别是85.7%、84.4%和36.3%;25例共同阳性标本中,M和Q法的CT值分别比P法平均低7.5和9.35,表现出高于P法的提取效率和RNA质量;M和Q法的标准变异指数(S.D.I.)绝对值均<2,P法S.D.I.绝对值>2;M法平均CV为40.0%,Q法为71.0%,P法>100.0%;M法表现最佳的线性(R>0.99),M、Q和P法的最低检测限分别为39.4、394和3943 IU/ml。结论从提取效率和收获RNA质量上M和Q法远远优于P法,进一步方法性能表明,M法为HCV RNA定量最佳提取方法,而P法因其提取效率低、收获RNA质量差以及重复性不好,不适合临床HCV RNA定量试验。
- 张磊陆小军应斌武庄杰丁柳代波王军刘显中林立宋兴勃
- 关键词:RNA提取HCVRNA定量CT值
- HCV-RNA载量水平与丙型肝炎肝脏组织损伤的关系
- 目的探讨丙型肝炎病毒(HCV)RNA复制水平与肝功能丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天门冬氨酸氨基转移酶(AST)之间的相互关系。方法收集1182例丙型肝炎病人血清标本,采用荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)检测HCV R...
- 丁柳周易宋兴勃刘显中陆小军应斌武
- 文献传递
- 门诊患者NG,CT,Uu3种病原体检出情况被引量:5
- 2010年
- 目的了解成都某医院门诊患者淋球菌、沙H艮衣原体、解脲脲支原体3种主要性传播疾病病原体的感染情况,为临床防治提供依据。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应技术(FQ—PCR)对2007—01/2008—12来医院检查泌尿生殖道感染的746名患者按常规取样进行NG,CT,Uu3种病原体检测。结果746例患者中以Uu感染率最高,为35.02%(166/474),NG为20.95%(31/148),CT为16.13%(20/124)。男女阳性检出率比较,NG病原体阳性率女性低于男性,Uu阳性率女性高于男性。21~40岁年龄段患者占82.03%,2007年总阳性率为35.62%,2008年为26.12%。结论淋球菌、沙眼衣原体、解脲脲支原体3种常见性传播疾病病原体均有检出,Uu检出率居第1位。2008年检出率较2007年有降低趋势。
- 周易李思阅宋兴勃王兰兰王军刘显中应斌武
- 关键词:性传播疾病淋球菌沙眼衣原体解脲脲支原体
- 淋病奈瑟氏菌核酸的不同提取方法的比较及评价
- 目的淋病是目前我国最常见的性传播疾病之一,随着实时PCR技术的广泛使用,淋球菌检测准确性、灵敏度得到了很大的提高,但实时PCR在应用中却仍存在诸如扩增假阴性等问题,使淋病奈瑟氏菌(NG)DNA提取已成为影响检验的重要因素...
- 王军应斌武庄杰叶远馨刘显中周易宋兴勃陆小军丁柳代波
- 淋球菌核酸的不同提取方法的比较及评价
- 目的运用3种不同的核酸提取方法,比较其对淋病奈瑟氏菌DNA提取效率的差异,为临床及科研提供最佳的提取方案。方法对已确诊的淋球菌培养基挑取20个小菌落制成悬液,作*10倍的浓度梯度稀释,选用Easy MAG全自动核酸提取仪...
- 庄杰刘显中陆小军叶远馨宋兴勃应斌武
- 文献传递
- 成都地区汉族人群9个STR基因座遗传多态性的研究
- 2008年
- 目的对成都汉族D3S1358、vWA、FGA、D8S1179、D21S11、D18S51、D5S818、D13S317及D7S820等9个STR基因座的遗传多态性进行群体遗传学研究。方法利用荧光标记复合扩增及毛细管电泳自动荧光检测的方法,对260名无关个体获得9个STR基因座等位基因的分布频率等群体遗传学数据。结果D3S1358、vWA、FGA、D8S1179、D21S11、D18S51、D5S818、D13S317及D7S820等9个基因座上分别检出等位基因6、9、12、9、17、15、9、8和9个。杂合度分别为:0.812、0.808、0.842、0.731、0.673、0.796、0.788、0.800和0.777;多态信息量为:0.830、0.800、0.850、0.750、0.680、0.750、0.770、0.840和0.760;个体识别率为:0.958、0.945、0.965、0.919、0.882、0.913、0.930、0.961和0.927;非父排除率为:0.621、0.613、0.680、0.4770、.388、0.592、0.578、0.599和0.577。9个STR基因座均符合Hardy-Weinberg平衡。结论这9个STR基因座多态性好,灵敏度高,可用于人类遗传分析及法医学中的亲子鉴定和个人识别。
- 丁柳应斌武宋兴勃范红王军代波陆小军庄杰刘显中
- 关键词:复合扩增群体遗传学
- 淋病奈瑟菌核酸的不同提取方法比较及评价被引量:2
- 2012年
- 目的比较评价磁珠法、柱子吸附法和煮沸裂解法3种不同的核酸提取方法对淋病奈瑟菌(淋球菌)DNA提取效率的差异。方法对已确诊的淋球菌培养基挑取20个小菌落制成悬液,做1︰1~1︰100 000稀释度稀释,分别使用磁珠法、柱子吸附法和煮沸裂解法进行DNA提取,用实时荧光定量PCR对其提取效率进行评价。结果在不同浓度淋球菌的DNA提取中,以磁珠法的敏感性和重复性最高,而柱子吸附法和煮沸裂解法次之,<1×105copies/mL以下的拷贝数,3种DNA提取方法之间重复性和敏感性差异明显,磁珠法的提取效率最高,柱子吸附法次之,煮沸裂解法最差;>1×105copies/mL的细菌拷贝数的样本,3种方法差异随浓度增高不断缩小。结论磁珠法提取淋球菌DNA的效率、敏感性和重复性最高,在实际临床科研工作中,各实验室可根据自身实际情况选择不同的DNA提取方法。
- 庄杰刘显中叶远馨周易宋兴勃陆小军王军丁柳代波应斌武
- 关键词:淋病奈瑟菌DNA提取实时荧光定量聚合酶链反应
- 非溶血性发热性输血反应与HLA抗体的相关性研究被引量:36
- 2006年
- 谭斌秦莉代波刘显中罗君
- 关键词:非溶血性发热性输血反应HLA抗体同种免疫器官移植输血疗效受血者
- 中国成都地区乙肝病毒(HBV)高复制人群HBV基因型分布研究
- 目的探讨成都地区乙肝病毒(HBV)高复制人群HBV基因型分布及其和肝脏炎症之间的关系。方法收集110例HBV DNA拷贝数大于1.00E+07,且e抗原(HBeAg)阳性者的血清标本进行基因分型、ALT检测、ELISA检...
- 丁柳刘显中陆小军应斌武
- 文献传递
- 淋球菌核酸的不同提取方法的比较及评价
- 庄杰刘显中陆小军叶远馨宋兴勃应斌武