翁波
- 作品数：40 被引量：99H指数：6
- 供职机构：湖南农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目湖南省自然科学基金湖南省教育科学“十一五”规划课题更多>>
- 相关领域：农业科学文化科学生物学经济管理更多>>
- miR-542-3p生物信息学分析及对未成熟猪睾丸支持细胞的影响
- 2024年
- 为了探讨miR-542-3p的生物信息学信息及其对未成熟猪睾丸支持细胞的影响,试验通过AliBaba 2.1和AnimalTFDB 3.0软件预测miR-542-3p转录因子结合位点(TFBS);并分析miR-542-3p在不同物种间的保守性;采用CCK-8试剂、ATP试剂盒、流式周期检测试剂盒和实时荧光定量PCR方法探究过表达miR-542-3p对未成熟猪睾丸支持细胞的影响;利用TargetScan、miRDB和miWalk 3种在线软件预测miR-542-3p靶基因后取交集,并对猪源靶基因进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析;最后利用Cytoscape 3.2.0软件构建TF-miR-542-3p-靶基因相互作用网络。结果表明:经预测miR-542-3p受GATA1、TBP、Sp1、Ap1、SRF等多个转录因子调控,且在多物种间具有高度的保守性;miR-542-3p可显著或极显著抑制未成熟猪睾丸支持细胞增殖活性(P<0.05或P<0.01),极显著降低细胞内ATP含量(P<0.01),显著或极显著抑制细胞增殖基因和周期基因的相对表达量(P<0.05或P<0.01),进而抑制细胞周期和细胞增殖;转染miR-542-3p mimic后G1期猪睾丸支持细胞比例显著升高(P<0.05),S期细胞比例极显著降低(P<0.01);共发现7个猪源miR-542-3p潜在靶基因,miR-542-3p调控的UBE2E1基因相对表达量极显著下降(P<0.01),KCMF1、ILK基因相对表达量显著下降(P<0.05),HIPK3基因相对表达量极显著升高(P<0.01),AP3D1、PLEKHM3基因相对表达量显著升高(P<0.05),各靶基因主要在激酶活性和结合上发挥作用;miR-542-3p靶基因主要参与MAPK、cAMP、TGF-β和cGMP-PKG等信号通路;构建的TF-miR-542-3p-靶基因相互作用网络包含5个转录因子和50个mRNA。说明miR-542-3p受多种转录因子调控,在多物种间高度保守,能够抑制未成熟猪睾丸支持细胞增殖,并通过调控下游靶基因的表达参与MAPK、cAMP和TGF-β等信号通路,从而调控未成熟猪睾丸支持细胞生长。
- 尹艳飞蒋芊芊冉茂良翁波
- 关键词：生物信息学睾丸支持细胞靶基因
- ssc-miR-152生物信息学及对未成熟猪睾丸支持细胞功能的分析
- 2023年
- 为研究ssc-miR-152生物信息学特征及对未成熟猪睾丸支持细胞功能的影响,本研究通过NCBI数据库确定ssc-miR-152在猪基因组中的位置,通过MethPrimer和EMBOSS在线软件分析ssc-miR-152上游序列CpG岛,使用Netural Network Promoter Predictio和Promoter-2.0预测其启动子区域,结合AliBaba 2.1和AnimalTFDB3.0软件预测其转录因子结合位点;Clustal W软件分析ssc-miR-152在物种间的保守性,采用CCK-8、流式细胞术和实时荧光定量PCR技术检测细胞增殖、周期及凋亡情况,运用miRanda、EIMMO、TargetScan和PITA在线软件预测ssc-miR-152的靶基因并取交集,并对预测的靶基因进行GO功能及KEGG通路分析,最后利用Cytoscape构建TF-miRNA-mRNA互作网络。结果表明:ssc-miR-152位于猪12号染色体反义链的24 292 249~24 292 328位置,其转录起始位点在上游序列200 bp处,启动子范围为393~4 619,并在该范围内存在1个CpG岛,且有RELA、SP1、SRF、IRF1和EGR1等多个转录因子调控ssc-miR-152的表达。同时发现ssc-miR-152具有高度保守性,在未成熟猪睾丸支持细胞中过表达ssc-miR-152后增强细胞增殖活性、加快细胞的周期进程、抑制细胞凋亡率。互作网络显示ssc-miR-152可调控下游NOG、S1PR1和FBN1等多个基因,参与TGF-β、PI3K/AKT和FoxO等信号通路。本研究说明,ssc-miR-152对未成熟猪睾丸支持细胞生长发育有重要作用,本研究为后续进一步探索未成熟猪睾丸支持细胞机理并对雄性精子发生机理提供理论科学依据。
- 尹艳飞彭芷云冉茂良陈斌翁波
- 关键词：生物信息学
- 沙子岭猪跨膜与卷曲螺旋域2(TMCO2)基因克隆、生物信息学及组织差异表达分析
- 2016年
- 利用RACE法克隆沙子岭猪TMCO2基因cDNA全长并进行生物信息学分析,应用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对TMCO2基因在沙子岭猪D30时期8个不同组织(睾丸、肌肉、肺、心脏、肾脏、肝脏、脾脏、脂肪)及睾丸组织8个不同发育阶段(E90、D1、D30、D60、D90、D120、D150、D180)进行差异表达分析。结果表明:TMCO2基因克隆所得片段长740 bp,其中ORF区为546 bp,编码181个氨基酸。qRT-PCR结果显示,沙子岭猪D30时期TMCO2 mRNA在睾丸组织中表达量最高,其次为脾脏组织,而在其他组织中表达量极低,其中睾丸组织与其他组织表达量差异均为显著(P<0.05);睾丸组织不同发育时期中,TMCO2 mRNA在D180时期表达量达到最高,在D1和D150时期表达量略有下降,其中D180与其他时期的差异均为极显著(P<0.01),E90、D1、D30、D60 4个生长发育期时期表达量差异不显著(P>0.05)。本试验首次克隆了沙子岭猪TMCO2基因cDNA全长并检测了其在猪不同组织及睾丸组织不同发育阶段表达量,为进一步研究TMCO2基因功能奠定基础。
- 彭馥芝翁波冉茂良董莲花陈斌
- 关键词：克隆
- 沙子岭猪GSG1基因克隆、生物信息学分析及组织表达被引量：1
- 2017年
- 采用RACE技术克隆猪GSG1(Germ Cell-specific gene 1)基因cDNA1全长并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR对GSG1基因在沙子岭猪睾丸组织8个不同发育阶段(E90、D1、D30、D60、D90、D120、D150和D180)和30日龄时9个不同组织(睾丸、肌肉、小肠、肺、心脏、肾脏、肝脏、脾脏和脂肪)的表达量。结果表明:GSG1基因cDNA全长为1 257 bp,含1个长993 bp的开放阅读框,编码330个氨基酸。实时荧光定量PCR结果显示,GSG1基因在睾丸组织中的表达量最高,显著高于其余8个组织(P<0.05),且其在肌肉、小肠、肺脏、心脏、肾脏和脂肪中的表达水平极低;GSG1基因在睾丸组织的E90、D1、D30和D60这4个发育时期的表达量较低,显著低于D90、D120、D150和D180这4个时期(P<0.01)。本试验首次克隆了猪GSG1基因cDNA全长并检测了其在不同组织和不同发育阶段睾丸组织的表达,为进一步研究其调控猪睾丸发育和精子生成的机制奠定了理论基础。
- 冉茂良翁波贺长青董莲花彭馥芝陈斌
- 关键词：CDNA克隆基因表达
- 应用型本科实施“订单式”人才培养模式刍议被引量：2
- 2011年
- ＂订单式＂人才培养模式在实现学校、学生与用人单位＂三赢＂的理论意义是不容置疑的,但在本科院校实践较少。本文就该模式在应用型本科院校实施的现实基础和构建要素进行了探讨,结合具体实践阐述了这一模式在湖南农业大学动物科学技术学院实施的状况。
- 翁波余婷婷李翀徐小雀
- 关键词：应用型本科
- 鱼类细胞工程遗传育种研究进展被引量：7
- 2004年
- 介绍了鱼类细胞工程育种的研究状况,主要包括雌核发育、三倍体诱导、核移植、细胞融合4种育种技术及其在生产上的应用。
- 陈光荣肖克宇翁波邓时铭
- 关键词：细胞工程遗传育种雌核发育三倍体诱导核移植细胞融合
- 沙子岭猪睾丸组织发育过程中差异表达基因的筛选及注释被引量：1
- 2023年
- 本研究采用RNA-seq技术对60(DS)、90(DN)、120(DT)、150(DF)日龄沙子岭猪睾丸组织进行转录测序,筛选差异表达基因并进行功能注释,从而为进一步研究猪睾丸组织发育和精子生成的分子调控机制奠定理论基础。结果表明,各文库获得的序列数量共计1 095 135 628条,164.26 GB,其中比对至猪参考基因组的序列比例为73.07%~75.64%,共有25 491条转录本,对应21 606个基因;DN VS. DS组的差异表达基因数量为1 606个,其中1 216个上调基因显著富集于40条GO项,390个下调基因显著富集于166条GO项;DT VS. DN组的差异表达基因数量为180个,其中97个下调基因显著富集于37条GO项;DF VS.DT组的差异表达基因数量为438个,其中243个下调基因显著富集于22条GO项。说明沙子岭猪睾丸组织发育过程中基因表达存在明显差异,尤其是60日龄至90日龄期间,这些差异表达基因可为进一步研究沙子岭猪睾丸组织发育和精子生成的分子机制提供参考依据。
- 卞桥冉茂良陈斌翁波
- 关键词：沙子岭猪睾丸组织基因功能注释
- miR-221/222基因家族进化分析及其在猪睾丸组织中的表达变化被引量：4
- 2017年
- 运用生物信息学方法在miRBase中搜索动物miR-221/222基因家族的序列,利用Ensembl数据库信息确定miR-221/222在基因组中的位置,采用MEGA 5.0构建miR-221/222系统进化树;并利用RT-qPCR技术定量检测猪睾丸组织中不同发育时期miR-221/222的表达变化。结果表明:在34种动物中共搜索到59条miR-221/222序列,所有的miR-221/222基因都存在于基因间隔区。进化分析表明,各物种miR-221/222基因家族可能以不同的方式和速度进化而来。RT-qPCR检测结果显示,miR-221/222在猪睾丸组织中不同发育时期表现出相同趋势的表达规律,即出生后其表达水平先升高,生长发育时期降低,随着性成熟又呈现升高趋势。研究结果为深入理解miR-221/222基因家族的作用机制奠定基础,也为后续研究提供参考。
- 彭馥芝冉茂良翁波董莲花陈斌
- 关键词：进化
- miR-362靶向抑制RMI1基因调控猪未成熟支持细胞增殖和凋亡
- 罗荟冉茂良翁波高虎唐湘薇谌瑶陈斌
- 金融危机对高校贫困生择业意向的影响及对策研究被引量：1
- 2009年
- 金融危机背景下,以问卷调查形式统计分析就业心态、就业标准、毕业去向选择等因素对高校贫困生择业意向的影响,并从外部就业环境构建和内在就业能力培养方面进行对策研究。
- 郑重谊翁波徐小雀余婷婷
- 关键词：金融危机高校贫困生择业意向
