王三山
- 作品数:8 被引量:7H指数:1
- 供职机构:中国科学院上海有机化学研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 生物大分子空间结构数据库(PDB)简介被引量:1
- 1991年
- 随着分子生物学的迅速发展,生物大分子结构与功能关系的研究成为当代生物化学的热点之一。越来越多的研究者对于核酸、蛋白质及其它生物大分子的空间结构的兴趣与日俱增。仅仅对于生物大分子立体结构的笼统描述已经不能满足研究人员的需要,为了深入了解诸如酶与底物相互作用等问题的确切图象。
- 王三山
- 关键词:生物大分子空间结构数据库PDB
- 心钠素
- 1991年
- 心钠素首先于1983年从大鼠的心房组织中分离得到,但对它的研究可追溯到本世纪50年代。1956年Kisch,1964年,Jamieson先后在哺乳动物心房的心肌细胞中发现存在着一种特殊的分泌颗粒(Atrial specific Gran-
- 徐崇钧徐梅王三山鲁子贤
- 关键词:心钠素ANFANP分子结构
- 蛋白质工程的分子模建技术被引量:1
- 1991年
- 蛋白质工程是一门旨在设计和构建蛋白质的多学科交叉技术。它的目标是:(1)按照工业、农业和医药的特殊要求修饰现有的天然蛋白;(2)合成兼顾二个天然蛋白的性质的嵌合蛋白;(3)构造自然界没有的全新特异蛋白。这些工作的许多方面自然界都曾经做过,然而它是在漫长的生物演化过程中由随机突变的宏观选择造化万物的。近十年来,基因工程和计算机技术的飞速发展,加快了蛋白质工程的步伐。重组DNA方法和定位诱发突变技术,已经成为研究酶作用机制、蛋白质折叠—展开路径、
- 丁达夫冯祖康王三山
- 关键词:蛋白质工程
- 胞嘧啶甲基化对DNA精细结构的影响
- 1993年
- DNA中胞嘧啶甲基化及其在基因调控中的作用,是一个很有兴趣的生物学问题。本文以d(CGCGAATTCGCG)为对象用分子模建、能量优化、均方根偏离分析等方法,从理论上探讨了胞嘧啶甲基化对DNA精细结构起伏的影响,证实了甲基化作用主要引起5-甲基胞嘧啶所在局部位置的DNA精细结构发生变化,而糖链部分发生的变化远大于碱基部分发生的变化。
- 王三山陈志伟沈珍蓉刘次全
- 关键词:甲基化分子力学
- 蛋白质卷曲起始位点的搜索
- 1993年
- 基于本文对蛋白质卷曲起始位点的假设,提出了一个新参数——氨基酸的有序结构形成势。利用此参数及相应的程序来寻找蛋白质卷曲起始点——蛋白质中有序结构形成势最高的肽段。用BPTI的计算结果非常吻合地解释了BPTI的二硫键重组过程,对其余20个蛋白质的计算结果也进行了讨论。
- 徐梅张鹰王三山鲁子贤
- 关键词:BPTI
- 蛋白质分子主链结构的图形显示
- 1993年
- 本文介绍了1种用于产生蛋白质分子三维飘带模型的算法及程序。三维飘带模型是由1组平行的3次B样条曲线形成。B样条曲线的型值点由每个肽平面上的CA原子决定,飘带模型的法线与肽平面的法线平行。算法适用于所有蛋白质结构的显示。曲线的消隐、动画和光照等效果分别由深度缓冲、双缓冲及Depthcue技术来实现。以上算法及程序已在SGI4D/20图象工作站上实现。
- 祝晓清王三山
- 关键词:蛋白质B样条曲线
- 抗菌肽的一级结构和二级结构分析被引量:5
- 1993年
- 本文分析了已分离提纯的12个抗菌肽的一级结构特征,划分出作为12个抗菌肽基本成分的3类保守氨基酸,确认抗菌肽序列的前半部分对于活性有主要页献。根据Garnier定向信息法分析了12个抗菌肽的二级结构,结果证实了12个抗菌肽均有形成N端螺旋的倾向。这提示了用两亲性螺旋解释抗菌肽的抗菌机制,在此基础上设计了3个新的抗菌肽。理论计算表明:新肽的N端螺旋度增加,而C端螺旋保持完整,推测其抗菌活性应较已知的12个抗菌肽为高。
- 王三山徐梅甘人宝屈贤铭
- 关键词:抗菌肽分子设计