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瓯江彩鲤酪氨酸酶基因的克隆与序列分析及河鲈的群体结构研究: 一、瓯江彩鲤酪氨酸酶基因的克隆与序列分析　　瓯江彩鲤(Cyprinuscarpiovar.color)是分布在我国瓯江流域的一种鲤科鱼类，因其色彩艳丽，体形优美，深受人们喜爱。瓯江彩鲤有五种基本体色：“全红”、“大花...; 杨新鑫; 关键词：瓯江彩鲤酪氨酸酶基因微卫星; 文献传递

鲤多亲本杂交F2群体的遗传连锁图谱构建与QTL研究: 本文以5尾荷包红鲤(♀)×5尾兴国红鲤(♂)的43尾F2个体鱼为材料,利用14对AFLP引物进行基因组扫描,共产生2797条扩增片段,有605条片段在两亲本间呈现多态,平均每个引物中有43个为多态性标记,多态性...; 王军王成辉刘豪马玉清杨新鑫; 关键词：F2群体 AFLP标记 SSR标记 QTL

遗传鉴别野生群体中瓯江彩鲤选育系的逃逸个体: 人工选育生物体的逃逸或人为放流会对野生群体的生物多样性和遗传同一性造成威胁.本文选用17个微卫星位点，运用贝叶斯(Bayesian)遗传鉴别方法从野生群体中鉴别瓯江彩鲤(C.carpio var.color)选育系的逃逸...; 马玉清王成辉王军杨新鑫毕祥

瓯江彩鲤酪氨酸酶(TYR)基因的选择压力分析被引量：1: 2016年; 酪氨酸酶是生物体黑色素合成的关键限速酶,黑色斑纹是瓯江彩鲤（Cyprinus carpio var.color）体色的主要特点之一。以瓯江彩鲤的5种体色选育系F5为材料,探讨酪氨酸酶基因5个外显子及其在不同体色间的变异特性和承受选择压力的敏感性。结果发现：酪氨酸酶基因外显子1和外显子5的核苷酸变异率最高,选择性位点最多,易承受到选择压力;5个外显子的非同义替换率（d_N）与同义替换率（d_S）的比值（ω值）均小于1（0.10-0.67）,表明它们均受到净化选择压力;不同体色瓯江彩鲤的酪氨酸酶基因也均受到净化选择压力（ω=0.12～0.23）。应用PAML软件中的M2a和M8两种模型检测显示：无黑斑体色瓯江彩鲤所受正向选择压力位点数高于有黑斑体色,但不存在显著差异（P〉0.05）;酪氨酸酶基因中的部分氨基酸位点较易受正向选择压力。研究结果表明：瓯江彩鲤酪氨酸酶基因较保守,主要受净化选择作用,当前的人工选育未对酪氨酸酶基因造成显著的选择压力。; 古珍珍杨新鑫胡建尊项松平王剑王军徐志彬王成辉; 关键词：瓯江彩鲤酪氨酸酶基因

选择压力对鲤遗传变异的驱动效应研究: 本文应用线粒体DNA控制区序列分析(826bp)分析和微卫星DNA标记分析(10个位点)相结合，对长江流域鲤的四个养殖群体(兴国红鲤、荷包红鲤、玻璃红鲤、建鲤)和两个野生群体(长江湖北石首江段和江苏太湖)的遗传变异情况进...; 许丽花王成辉王军董在杰杨新鑫马玉清; 关键词：线粒体DNA 微卫星标记

中国和匈牙利白斑狗鱼群体遗传变异的微卫星标记分析被引量：1: 2011年; 本研究应用18个微卫星分子标记,对白斑狗鱼(Esox lucius L.)3个中国新疆群体(乌伦古湖、吉力湖和6号湖)和1个匈牙利巴拉顿湖群体的遗传结构进行了分析。结果表明,3个中国白斑狗鱼群体的平均等位基因丰富度(AR)、平均观测杂合度(HO)和平均期望杂合度(HE)均显著低于匈牙利巴拉顿湖群体(P<0.05),而匈牙利群体的平均近交系数(FIS)高于中国群体;经SMM和TPM模型检测,匈牙利白斑狗鱼群体存在显著的遗传瓶颈信号(P<0.001);AMOVA和群体两两比较的FST值表明,中国与匈牙利白斑狗鱼的遗传分化十分显著(P<0.01);NJ树、主成分分析(PCA)进一步证实中国白斑狗鱼与匈牙利白斑狗鱼群体间存在显著的遗传差异和分化。此外,贝叶斯遗传聚类结果表明,中国新疆6号湖白斑狗鱼群体极可能来源于乌伦古湖,而非吉力湖。; 王军吴惠仙杨新鑫马玉清钱龙李思发王成辉; 关键词：白斑狗鱼微卫星

鲤正、反交F_2群体的AFLP遗传图谱构建及其QTL定位被引量：4: 2010年; 以高代选育的荷包红鲤和兴国红鲤的正、反交F2群体为材料,利用AFLP标记构建了鲤正、反交群体的遗传图谱,并进行了生长相关性状的QTL定位。在正交群体中,14对AFLP引物共产生542个多态性标记,其中325个标记符合3∶1的孟德尔分离比例,利用其构建的遗传图谱涵盖50个连锁群,图谱总长度3 676.1 cM,并获得了与全长、体长、体高、尾柄长和尾柄高5个生长性状相关的17个QTL,可解释表型变异的1.66%-70.49%;在反交群体中,14对AFLP引物共产生605个多态性标记,其中333个标记符合3∶1孟德尔分离比例,构建的遗传图谱也涵盖50个连锁群,图谱总长度3 943.1 cM,获得了与体重、全长、体长、体高和尾柄长5个生长性状相关的15个QTL,可解释表型变异的1.58%-63.89%。还对正、反交群体构建的遗传图谱及QTL定位差异及结果进行了初步分析和探讨。; 王军王成辉刘豪马玉清杨新鑫; 关键词：AFLP标记 QTL

红、白两种体色瓯江彩鲤的抑制性差减杂交被引量：5: 2009年; 为了解瓯江彩鲤红、白两种体色差异的分子基础,应用抑制性差减杂交(SSH)技术对这两种体色的差异表达基因进行了初步研究,以"全红"体色(全身体表为红色)彩鲤的cDNA为检验cDNA(Tester),以"粉玉"体色(全身体表为粉白色)彩鲤的cDNA为比对cDNA(Driver),进行抑制差减杂交。对筛选出的42个阳性克隆进行测序和序列比对,发现16条EST序列,其余26个克隆为空载体序列。在16条EST序列中,6条为鲤的线粒体DNA序列(鲤的线粒体:16S rRNA序列,COⅢ),5条为斑马鱼的相关基因序列(斑马鱼的骺蛋白聚糖、核心蛋白聚糖、光蛋白聚糖等相关基因;斑马鱼新型免疫型受体基因,Olfm1蛋白合成基因;斑马鱼原骨胶原蛋白mRNA),1条为鲫的mRNA序列,2条与无脊椎动物基因相类似(利氏曼原虫的22号基因组基因;蝇的抗菌缩氨酸前体mRNA基因),另2条为未知基因序列;比对结果发现4条序列可能与体色有关。为进一步筛选鲤体色调控相关的功能基因奠定了基础。; 刘豪王成辉杨新鑫王军马玉清; 关键词：瓯江彩鲤体色差异表达基因抑制性差减杂交

瓯江彩鲤酪氨酸酶基因的克隆与序列分析被引量：4: 2012年; 瓯江彩鲤(Cyprinus carpio var.color)是分布在我国瓯江流域的一种鲤科鱼类,色彩艳丽,体形优美,深受人们喜爱。瓯江彩鲤有5种基本体色:"全红"、"大花"、"麻花"、"粉玉"和"粉花",是研究鱼类体色遗传的良好材料和理想模型。酪氨酸酶(tyrosinase)是影响黑色素合成的关键酶,其转录的提前终止会导致黑色素无法合成。采用RACE技术从瓯江彩鲤皮肤转录本中克隆5种体色酪氨酸酶基因全序列,并对序列进行分析。发现在瓯江彩鲤的5种体色中,酪氨酸酶基因cDNA序列长度存在差异:"全红"为2 100 bp,"麻花"为2 107 bp,"大花"为2 073 bp,"粉玉"为1 976 bp,"粉花"为2 111 bp;且每种体色都存在两种类型酪氨酸酶基因(TYR-1,TYR-2)的转录。这两种酪氨酸酶基因mRNA所翻译成的氨基酸序列仅在一二级结构上有所差异,而在结构域和三级结构上不存在差异。但酪氨酸酶基因的这些差异是否与瓯江彩鲤体色相关还有待后续的证明。研究亮点:在国内外首次克隆了鲤的酪氨酸酶基因,发现不同体色瓯江彩鲤均转录完整的酪氨酸酶基因,且每种体色都存在两种酪氨酸酶的mRNA转录。揭示了5种体色瓯江彩鲤酪氨酸酶基因的序列差异,对进一步研究该基因与体色的关系提供了依据。; 杨新鑫王成辉马玉清项松平王剑; 关键词：瓯江彩鲤体色酪氨酸酶基因

瓯江彩鲤酪氨酸酶基因全长cDNA的克隆与序列分析: 瓯江彩鲤(Cyprinus carpio var.color)具有红色、花色等多种体色,是鱼类体色遗传研究的良好材料.酪氨酸酶是鱼体黑色素形成的关键酶.本研究应用RACE技术,克隆了"全红"体色瓯江彩...; 杨新鑫王成辉马玉清王军; 关键词：瓯江彩鲤酪氨酸酶基因 RACE

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杨新鑫

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