张秀英
- 作品数:2 被引量:12H指数:1
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- 栉孔扇贝BES-SSR的开发及遗传多样性分析被引量:12
- 2012年
- 通过分析栉孔扇贝BAC末端序列,发现大量微卫星DNA;随机选择14个多态性BES-SSR标记,在我国栉孔扇贝大连群体(DL)和青岛群体(QD)中验证标记的可用性,同时对这两个群体的遗传结构及其分化进行研究。结果表明,从17447条BESs中得到微卫星3374个,以四核苷酸重复为主(26.6%),五核苷酸重复次之(17.7%),六核苷酸重复最少(12.0%)。BES-SSR引物的扩增效率为77.3%(99/128),在作图亲本中的多态比例为33.6%(43/128),14个基因座在两群体中的平均等位基因数Na分别为18.9286和26.2143,平均有效等位基因数Ne为11.7505和17.0891,平均观察杂合度Ho为0.5100和0.4204,平均期望杂合度He为0.9156和0.9450,多态信息含量PIC分别为0.8940和0.9302,群体遗传多样性水平较高。两群体间的无偏遗传相似性系数为0.4879,遗传距离为0.7177,平均基因分化指数FST为0.0243,基因流Nm为10.0179,显示群体间遗传分化程度较弱,遗传变异主要来自于群体内个体之间,经Hardy-Weinberg平衡检验,两群体普遍存在杂合子缺失现象。研究表明,所开发的BES-SSR是高度多态位点,用于群体遗传多样性分析效果很好,显示BES是微卫星标记开发和应用的重要资源。
- 张秀英张晓军赵翠常亚青郇聘李富花相建海
- 关键词:栉孔扇贝微卫星
- 栉孔扇贝(Chlamys farreri)BAC未端序列中SSR和SNP分子标记的开发及初步应用研究
- 栉孔扇贝(Chlamys farreri)是我国重要的经济养殖贝类,具有抗逆及快速生长性状群体的选育是栉孔扇贝养殖业得以持续发展的基础。目前迅速发展的分子标记辅助育种技术为优良品种的快速选育提供了有力支撑。本研究以栉孔扇...
- 张秀英
- 关键词:分子标记
- 文献传递