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宣黎明

作品数：4 被引量：1H指数：1
供职机构：上海生物信息技术研究中心更多>>
相关领域：生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 2篇专利
  • 1篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 2篇生物学

主题

  • 3篇基因组学
  • 2篇数据库
  • 2篇数据库资源
  • 2篇物种
  • 2篇物种组成
  • 2篇模拟系统
  • 2篇基因
  • 2篇基因组
  • 2篇宏基因组
  • 2篇GPU
  • 2篇病原
  • 2篇病原鉴定
  • 2篇测序
  • 1篇显卡
  • 1篇模拟软件
  • 1篇疾病相关性
  • 1篇宏基因组学
  • 1篇并行化
  • 1篇并行化计算

机构

  • 3篇上海生物信息...
  • 2篇华东理工大学

作者

  • 4篇宣黎明
  • 3篇韦朝春
  • 3篇李亦学
  • 2篇刘雷
  • 2篇贾鹏
  • 2篇蔡锴晔

传媒

  • 1篇华东理工大学...

年份

  • 1篇2017
  • 1篇2013
  • 2篇2012
共 4 条 记 录，以下是 1-4
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排序方式：
基于元基因组学的未知病原快速鉴定系统及分析方法
本发明提供一种基于元基因组学的未知病原的快速鉴定系统及分析方法，运用元基因组学的方法进行未知病原鉴定及分析：包括：测序质量控制系统：对测序数据进行质量分析，把测序质量不合要求的部分去除；Meta-All分析系统：本系统的...
韦朝春蔡锴晔宣黎明贾鹏刘雷李亦学
文献传递
基于GPU并行化计算的宏基因组第二代测序模拟系统
宏基因组学能够在未知领域揭露出大量的不能培养的微生物。由于其极其广泛的应用领域,高保真的宏基因组模拟系统在帮助工具开发和制定宏基因组项目上都有很大的需求。然而,目前存在的系统都只能模拟一些过于简化的宏基因组。 在此,我们...
宣黎明
关键词：宏基因组学模拟系统显卡
文献传递
基于GPU运算的宏基因组第二代测序模拟软件被引量：1
2012年
提出一个新的宏基因组模拟系统NeSSM(Next-Generation Sequencing Simulator forMetagenomics)。通过结合目前数据库中所有的基因组信息和一些初步的宏基因组测序信息,该系统可以产生一个接近于实际情况的模拟宏基因组测序数据。为了加快该系统的运行时间,运用了显卡计算(GPU并行化计算),通过并行化运算有效地缩短了程序运行所需时间。目前,NeSSM支持454和Illumina的测序平台。
宣黎明韦朝春李亦学
关键词：宏基因组GPU模拟系统
基于元基因组学的未知病原快速鉴定系统及分析方法
本发明提供一种基于元基因组学的未知病原的快速鉴定系统及分析方法，运用元基因组学的方法进行未知病原鉴定及分析：包括：测序质量控制系统：对测序数据进行质量分析，把测序质量不合要求的部分去除；Meta‑All分析系统：本系统的...
韦朝春蔡锴晔宣黎明贾鹏刘雷李亦学
文献传递
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