孟令芝
- 作品数:4 被引量:64H指数:3
- 供职机构:山西农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:山西省自然科学基金国家自然科学基金山西省科技攻关计划项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 药用植物长春花WRKY转录因子的鉴定及表达谱分析被引量:10
- 2013年
- WRKY是调控植物生长发育和逆境胁迫反应等生命活动的一个转录因子大家族。然而,有关药用植物长春花CrWRKY转录因子的种类和功能却知之甚少。从26 009个长春花蛋白中鉴定出47个CrWRKY转录因子。依据WRKY结构域和系统进化,将CrWRKY分为G1、G2和G3三大类群。表达谱数据分析表明,长春花CrWRKY基因的表达具有器官特异性。47个CrWRKY基因的表达谱可分为3种表达模式:第1类型主要在花、甲基茉莉酸甲酯(MeJA)或酵母提取物(YE)处理的原生质体中高表达;第2类型主要在茎和毛状根中高表达;第3类型在根、茎、叶、幼苗和MeJA处理的毛状根中高表达。进一步用实时定量PCR检测了16个代表性CrWRKY基因在不同器官、MeJA处理原生质体和毛状根中的表达模式,检测结果与上述数字基因表达谱数据基本一致。约1/3以上CrWRKY基因的表达受MeJA和YE的调控,暗示它们可能参与萜类吲哚生物碱的合成和逆境胁迫反应。为进一步解析长春花WRKY转录因子的功能和萜类吲哚生物碱合成调控的网络奠定了基础。
- 杨致荣王兴春薛金爱孟令芝李润植
- 关键词:WRKY萜类吲哚生物碱表达谱
- 植物耐低磷的转录调控机制被引量:2
- 2014年
- 植物缺磷已经成为世界性的难题,越来越多的研究表明,转录调控是植物耐低磷调控的的重要环节,因此,有关植物低磷诱导转录因子转录机制的研究已成为国内外研究的热点。综述了与植物磷胁迫相关的转录因子PHR1,PHO1,WRKY6等调控磷酸饥饿的方式及其在植物生长发育、根系形态变化和激素信号等方面的功能,并对其研究前景进行了展望。
- 孟令芝樊娟陈钊李亚娟王兴春杨致荣
- 关键词:低磷转录因子分子机制植物
- 基于高通量测序技术的连翘转录组分析及SSR分子标记的开发
- 连翘是重要的药用植物,含有多种有效成分,且分布广泛,具有极大的开发利用的潜力。对连翘的研究随着科学技术的进步逐渐从理化水平深入到基因水平,但目前对连翘的研究多利用其它物种的分子标记,连翘本身的分子标记少之又少,使得连翘转...
- 孟令芝
- 关键词:连翘高通量测序技术转录组SSR分子标记
- 文献传递
- 基于RNA-Seq技术的连翘转录组组装与分析及SSR分子标记的开发被引量:47
- 2015年
- 连翘既是传统的中药材,又是优良的城市绿化树种,具有重要的经济价值和生态价值.但是连翘基因资料非常匮乏,限制了其分子生物学和基因功能的研究.本研究以连翘根、茎、叶、花和果实等器官的混合样品作为材料,利用Illumina Hi SeqTM 2500测序平台对其进行转录组测序.共获得23164327条干净数据(clean reads),总碱基数为4678791021 bp.Clean reads经de novo组装后获得45112条unigenes.进一步利用五大公共数据库进行同源比对,注释了28699条unigenes.其中,473个基因参与了连翘次生物质的合成和代谢,包括81个与苯丙氨酸和苯丙烷代谢相关的基因.对这81个基因的分析表明,有4个基因编码苯丙氨酸脱氨酶,1个基因编码肉桂酸4-羟化酶,2个基因编码4-香豆酰:辅酶A连接酶.这3个酶催化了连翘中主要药用活性物质苯乙醇苷和木脂素前体肉桂酸衍生物的生物合成.此外,还发现了2个松脂醇-落叶松树脂醇还原酶和1个开环异落叶松脂醇脱氢酶编码基因,这2个酶是木脂素合成的关键酶.最后,分析了长度在1 kb以上的12721个unigenes的基因结构,检测到3199个SSR位点,并对其中40个位点进行了验证.本研究不仅为连翘基因克隆和分子生物学研究提供了丰富的基础数据信息,而且为连翘遗传多样性研究、指纹图谱构建和分子标记辅助选育奠定了分子基础.
- 王兴春谭河林陈钊孟令芝王文斌范圣此
- 关键词:RNA-SEQ转录组次生代谢苯乙醇苷SSR分子标记连翘