姜永帅
- 作品数：10 被引量：25H指数：2
- 供职机构：哈尔滨医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国博士后科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学文化科学医药卫生更多>>
- 结合已有知识体系的酒精中毒相关的SNP单体型及其相关基因挖掘被引量：1
- 2008年
- 高通量的单核苷酸多态(single nucleotide polym orphism,SNP)检测技术与已有的知识体系(如KEGG,GO数据库等)为与疾病相关的SNP单体型及相关基因挖掘提供了有力支撑.本研究对高通量SNP基因型数据,采用4种SNP单体型板块(block)识别方法(置信区间、FGT、连锁不平衡的稳定连接以及单体型板块融合技术),用聚类分析方法验证其效能,通过风险分析方法确定酒精中毒相关的SNP单体型,并基于已有知识体系建立SNP单体型与基因的映射,通过查询NCBI SNP与gene数据库定位SNP单体型板块,确定候选基因,最后结合KEGG,Biocarta及GO数据库进行基因功能注释.在对人类22对常染色体的分析中,寻找到可能与酒精中毒相关的159个单体型板块,包含227个SNP单体型,并预测其中102个SNP单体型可能会增加酒精中毒的发病风险.挖掘得到了121个酒精中毒相关基因,并进一步进行可靠的生物学功能注释验证.结果提示:采用聚类效果验证及风险分析的单体型识别机制,基于单体型的疾病相关基因定位并结合已有知识体系的疾病相关基因挖掘策略,不仅能大大缩减SNP数据挖掘的工作量,实现复杂疾病相关基因的精细定位,而且对于多因素复杂疾病发病机制的探索将更有指导意义.
- 张瑞杰李霞姜永帅刘桂友李传星张帆肖云宫滨生
- 关键词：酒精中毒基因定位
- HapMap群体遗传差异的系统生物学研究
- 人类群体生存在不断变化的环境中，许多人口和进化事件，如迁移、人口扩张、殖民、遗传漂变、选择、重组和突变等，形成了人类基因组中的遗传变异。为了充分理解这些遗传变异，一些大型的国际计划，如HapMap计划、千人基因组计划等，...
- 姜永帅
- 关键词：单核苷酸多态
- 统计遗传学在线开放课程建设助推创新人才培养
- 2020年
- 统计遗传学是生物信息专业的专业课,由于受教学学时所限,课堂教学无法满足学生对统计遗传学知识的渴望,因此文章提出建设统计遗传学在线开放课程。通过建设包括基础教学资源、学术拓展资源和在线开放课程的学生测试平台和在线开放课程的实践与创新平台的统计遗传学在线开放课程来开拓学生视野,激发学生学习的积极性和主动性,培养学生创新思维能力和团队意识。
- 张明明姜永帅吕洪超
- 关键词：统计遗传学
- 基于SVM的药物靶点预测方法及其应用被引量：2
- 2012年
- 目的:基于已知药物靶点和潜在药物靶点蛋白的一级结构相似性,结合SVM技术研究新的有效的药物靶点预测方法。方法:构造训练样本集,提取蛋白质序列的一级结构特征,进行数据预处理,选择最优核函数,优化参数并进行特征选择,训练最优预测模型,检验模型的预测效果。以G蛋白偶联受体家族的蛋白质为预测集,应用建立的最优分类模型对其进行潜在药物靶点挖掘。结果:基于SVM所建立的最优分类模型预测的平均准确率为81.03%。应用最优分类器对构造的G蛋白预测集进行预测,结果发现预测排位在前20的蛋白质中有多个与疾病相关。特别的,其中有两个G蛋白在治疗靶点数据库(TTD)中显示已作为临床试验的药物靶点。结论:基于SVM和蛋白质序列特征的药物靶点预测方法是有效的,应用该方法预测出的潜在药物靶点能够为发现新的药靶提供参考。
- 尚振伟李晋姜永帅张明明吕洪超张瑞杰
- 基于网络的食物频率问卷信度和效度研究被引量：17
- 2014年
- 目的：研究基于网络调查的食物频率问卷的信度和效度。方法在哈尔滨医科大学随机抽取84名学生就最近4个月内膳食习惯进行两次食物频率的问卷调查。比较学生食物摄入的营养素的相关性，检验问卷的信度；并在第一次网络食物频率问卷调查之后连续记录3天的膳食日志，用三日膳食日志的平均结果与第一次网络食物频率问卷的相关性分析结果评价问卷的内容效度。结果①效度研究中，除了胆固醇、维生素A和铜元素，网络食物频率问卷与三日膳食日志的能量和21种营养素摄入量均为显著相关，r为0.229～0.996，r平均值0.594。②信度研究中，两次网络食物频率问卷的能量和24种营养素均为显著相关，r为0.541～0.917，r平均值为0.722。③一致率分析中，营养素的效度研究一致率为88％，营养素的信度一致率为100％。结论基于网络食物频率问卷具有良好的信度和效度，是研究人群营养与慢性病关系的理想工具。
- 李国强李彦川冯任南姜永帅
- 关键词：食物频率问卷
- 以学生为主体的医学统计学教学实践被引量：3
- 2013年
- 医学统计学是基础医学七年制专业的专业基础课之一。为了提高学生的理论基础和实践能力,解决以往重理论轻实践的问题,强调以学生为主体,通过让学生自学、讨论、试讲、提问,教师补充讲解的方式来改革课程教学方式。实践证明,该方法大大提高了学生的学习积极性,得到了很好的教学效果。
- 李晋姜永帅张瑞杰张明明吕洪超尚振伟李霞
- 关键词：教学实践
- 生物统计学课程教学方法的几点体会
- 2012年
- 生物统计学是一门实践与理论相结合的数学课程,针对生物统计学概念公式繁多且复杂,应用性强的特点,总结多年来的教学心得提出在生物统计学课程教学方法的几点体会：适当采用直观教学法;教学过程中要善于总结归类,帮助学生对比记忆复杂公式、概念;培养学生动手计算能力;注重实验课的开设;激发学习兴趣,促使学生主动学习。
- 尚振伟李晋张明明姜永帅吕洪超张瑞杰
- 关键词：生物统计学教学方法教学心得
- 生物标志物的可解释交互作用快速遍历检测方法及装置
- 本发明提供一种生物标志物的可解释交互作用快速遍历检测方法及装置，该方法包括如下步骤：S1、获取原始数据，并计算交互作用分析次数；获得GPU单次运算可承载的运算批次数；对原始数据进行数据分割，得到对应的数据分割结果；构建可...
- 姜永帅陶俊先张明明徐静吕洪超魏思宇孙晨吕文华
- “双一流”背景下统计遗传学金课建设探索与思考被引量：1
- 2021年
- 文章根据统计遗传学课程教学经验,从教学内容、教师教学科研一体化、教学方式等方面对统计遗传学金课建设进行了探索,提出构建“理论—应用—前沿”三位一体的知识框架体系;建设教学水平一流,科研突出的任课教师队伍;加强在线开放课程的建设,采用线上线下互补的教学方式;注重学生的主体地位,开展以学生为主体的探究教学法、学生分组合作以及师生互动的多种教学方法。通过课程教学实践,教学效果和学生的创新能力得到显著提高。
- 张明明姜永帅张瑞杰
- 关键词：统计遗传学
