刘文博
- 作品数：12 被引量：17H指数：2
- 供职机构：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所更多>>
- 发文基金：公益性行业科研专项国家肉牛牦牛产业技术体系项目中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 牦牛重要功能基因的挖掘与标识应用研究
- 梁春年裴杰丁学智阎萍包鹏甲郭宪褚敏郎侠刘文博王宏博曾玉峰朱新书郭天芬吴晓云刘健
- 运用分子生物学技术对中国牦牛高寒适应性、生长发育性状、繁殖性状、肉用性状、角性状等相关重要功能基因进行标识和鉴定，取得了以下创新型成果：(1)首次克隆了牦牛LPL基因、MSTN基因和IGF1R基因的cDNA全序列，并开展...
- 关键词：
- 关键词：牦牛功能基因基因克隆
- 牦牛VEGF-A基因的克隆及生物信息学分析被引量：4
- 2012年
- 利用分子克隆技术获得了牦牛VEGF-A基因编码区序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,牦牛VEGF-A基因包含一个573 bp的开放阅读框,编码190个氨基酸;其编码蛋白属于亲水性蛋白,具有明显的信号肽。二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主。VEGF-A基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛VEGF-A与黄牛、绵羊和成都麻羊等物种的VEGF-A氨基酸遗传距离较近,具有高度同源性。
- 吴晓云阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰褚敏丁学智刘文博焦斐刘建
- 关键词：牦牛克隆生物信息学分析
- 牦牛HORMAD1基因的克隆及生物信息学分析
- 2012年
- 利用分子克隆技术获得了牦牛HORMAD1基因编码区序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,牦牛HORMAD1基因包含一个长度为1 182 bp的开放阅读框,编码393个氨基酸;其编码蛋白属于亲水性蛋白,无明显的信号肽,含有很多个磷酸化位点。二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主。HORMAD1基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛HORMAD1与黄牛、马和猪等物种的HORMAD1氨基酸遗传距离较近,具有高度相似性。
- 金帅齐社宁阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰褚敏丁学智刘文博吴晓云刘建
- 关键词：牦牛克隆生物信息学分析
- 牦牛MSTN基因分子克隆及序列分析被引量：10
- 2013年
- 设计特定引物对牦牛MSTN基因PCR分段扩增并克隆和测序,利用分子生物学软件进行序列拼接,获得牦牛MSTN基因序列(GenBank登录号EU926670)。该基因由3个外显子和2个内含子组成,CDS序列全长为1 128 bp(GenBank登录号EU926671),由375个氨基酸组成。外显子大小分别为373,374,381 bp,内含子大小分别为1 843,2 028 bp。牦牛与普通牛的MSTN基因编码区中,在417位发生一次碱基转换(C→T),但未造成氨基酸改变。不同物种间在该基因编码区核苷酸序列和氨基酸序列上有较高的相似性,牦牛与普通牛、绵羊、猪、人、狗、小鼠、马、兔子、鸡、猩猩各物种间核苷酸相似性大小分别为99.9%,96.5%,94.3%,89.1%,91.9%,91.3%,93.6%,91.7%,82.0%,92.0%。牦牛与普通牛MSTN氨基酸序列相似性最高,为100%;而与绵羊、猪、小鼠、人、狗、马、兔子、鸡、猩猩各物种间相似性大小分别为93.3%,95.5%,92.5%,94.1%,93.3%,94.9%,94.4%,88.0%,94.4%。生物信息学软件分析发现:牦牛MSTN基因编码蛋白的理论分子量约为42.6 kDa,PI值为6.14,Leu的含量最高(9.9%),其次是Lys(7.2%)。牦牛MSTN基因编码蛋白二级结构以β折叠为主,属于跨膜蛋白,跨膜区位于AA6-AA23之间;具有一个分泌信号肽结构,其氨基酸序列MQKLQICVYIYLFMLIVA具有TGF-β家族的特征。
- 梁春年丁学智包鹏甲郭宪裴杰王宏博褚敏刘文博吴晓云阎萍
- 关键词：牦牛MSTN基因克隆
- 一种无角牦牛新品系的育种方法
- 本发明公开了一种无角牦牛新品系的培育方法，具体做法是：(1)对选育区的牦牛群体进行普查，普查的内容主要是牦牛角的有无，体形结构，外貌特征等；(2)对步骤(1)普查的牦牛选择外貌基本一致，无角，性状相似母牛打号、登记，建立...
- 梁春年阎萍丁学智郭宪王宏博包鹏甲刘文博朱新书
- 文献传递
- 牦牛PRKAG3基因部分序列多态性分析被引量：2
- 2012年
- 采用PCR-SSCP技术,对甘南牦牛、大通牦牛和天祝白牦牛的PRKAG3基因第3、第9内含子的多态性进行检测。结果表明,牦牛PRKAG3基因在第3、第9内含子中均存在多态位点,2个位点分别存在AA、AB和EE、EF基因型。其中,A和E为优势等位基因,2个位点在3个牦牛群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态。独立性检验结果表明,在1 806 bp处天祝白牦牛与甘南牦牛之间差异显著(P<0.05),大通牦牛与甘南牦牛、天祝白牦牛之间差异不显著(P>0.05);在4 487 bp处大通牦牛和天祝白牦牛、甘南牦牛之间差异极显著(P<0.01),天祝白牦牛与甘南牦牛之间差异不显著(P>0.05)。
- 焦斐杨富民阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰丁学智褚敏刘文博吴晓云刘建
- 关键词：牦牛PRKAG3基因PCR-SSCP多态性
- 牛RHOQ基因的电子克隆与生物信息学分析被引量：1
- 2012年
- 利用电子克隆技术获得牛RHOQ基因cDNA序列,采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构和亚细胞定位等方面进行预测和分析。结果表明,牛RHOQ基因的cDNA序列全长1 517 bp,包含1个618 bp开放阅读框,编码205个氨基酸;其编码蛋白属疏水性蛋白,不存在信号肽及跨膜结构,定位于分泌系统囊泡;二级结构主要以无规则卷曲和α-螺旋为主。牛RHOQ基因编码蛋白可能具有生长因子功能,可能在神经再生和突触延伸过程中起重要作用。
- 吴晓云阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰丁学智褚敏刘文博焦斐刘建
- 关键词：电子克隆生物信息学分析
- 一种无角牦牛新品系的育种方法
- 本发明公开了一种无角牦牛新品系的培育方法，具体做法是：(1)对选育区的牦牛群体进行普查，普查的内容主要是牦牛角的有无，体形结构，外貌特征等；(2)对步骤(1)普查的牦牛选择外貌基本一致，无角，性状相似母牛打号、登记，建立...
- 梁春年阎萍丁学智郭宪王宏博包鹏甲刘文博朱新书
- 文献传递
- 牦牛无角性状相关基因SNP标记筛选
- 本研究将以青海大通牦牛为研究对象，随机采集33份无角个体和32份有角个体血样。通过候选基因法，利用DNA测序和高分辨率溶解曲线SNP检测技术筛选与牦牛无角性状呈显著性关联的SNP标记。
- 刘建刘文博阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰王宏博褚敏
- 关键词：牦牛DNA测序
- 牦牛CART基因克隆、单核苷酸多态性检测及生物信息学分析
- 2013年
- 旨在克隆牦牛可卡因-苯丙胺调节转录肽基因(Cocaine-and amphetamine-regulated transcript,CART),获得基因全长序列并分析基因结构和相关遗传变异,检测单核苷酸多态性(SNP)位点在不同品种牦牛群体中的分布,通过生物信息学相关方法分析预测SNP位点对CART基因表达的影响,为牦牛CART基因功能研究奠定基础。以243头大通牦牛、208头天祝牦牛、208头甘南牦牛和53头帕里牦牛血样为材料,提取基因组DNA,克隆出牦牛CART基因全长序列;运用高分辨率熔解曲线分析技术(High-resolution melting,HRM)检测CART基因4个SNPs在4个牦牛品种中的分布,进行遗传统计分析,并应用生物信息学分析SNPs可能对基因功能产生的影响。本研究发现,牦牛CART基因4个SNPs,1个位于基因上游序列、1个位于内含子、2个位于3′-UTR。2检验表明,除大通牦牛V-221位点和甘南牦牛V1816位点外,其他所有群体各个位点都处于哈代-温伯格平衡(P>0.05)。群体遗传学分析显示,V168和V1816位点属于中度多态,V-221和V1791属于低度多态,单倍型C属于优势单倍型。生物信息分析发现,V1791和V1816位点碱基变化导致RNA二级结构发生变化,可能会对CART基因的表达产生影响。
- 刘建刘文博吴晓云阎萍梁春年
- 关键词：牦牛克隆多态性RNA二级结构
