刘伟
- 作品数：4 被引量：43H指数：3
- 供职机构：云南农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金：云南省应用基础研究基金云南省应用基础研究计划面上项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 利用微卫星DNA标记分析槟榔江水牛群体遗传特征被引量：6
- 2011年
- 槟榔江水牛是近年在我国云南西部发现的第一个本土河流型水牛。为了揭示其群体遗传多样性、群体遗传组成、其与河流型和沼泽型水牛的遗传关系及沼泽型水牛对该水牛的基因渗入等重要遗传背景信息,本研究采用30个微卫星DNA标记对141份槟榔江水牛样品和对照群体24份河流型水牛(摩拉水牛)样品、41份沼泽型水牛(滇东南水牛)样品进行了检测分析。结果,在槟榔江水牛群体中共检测到253个等位基因,其中,54个为3个群体所共享的等位基因,58个为只在槟榔江水牛与摩拉水牛间共享的等位基因,73个为只在槟榔江水牛与滇东南水牛间共享的等位基因,其余68个等位基因为该群体所独有。槟榔江水牛平均等位基因数、平均表观杂合度、平均期望杂合度和多态信息含量等参数均显著高于对照组群体,分别为8.433 3、0.640 5、0.600 9和0.594 7。该水牛群体近交系数FIS值为0.061 9。槟榔江水牛与摩拉水牛间的DA遗传距离为最小(0.114 4),在NJ树上聚为一支;而滇东南水牛与槟榔江水牛和摩拉水牛间的遗传距离较大(分别为0.382 9和0.555 3),其在NJ树上单独聚为一支。群体遗传结构分析显示,槟榔江水牛遗传组分为河流型与沼泽型2种类型水牛混合的模式(当K=2时),整个群体中有相当数量的个体存在沼泽型水牛的遗传渗入(群体中沼泽型水牛遗传组分为0.067 2)。结果揭示,槟榔江水牛遗传资源独特,群体遗传多样性丰富,但该群体杂合子缺乏,且存在一定沼泽型水牛的基因渗入。
- 刘伟苗永旺李大林唐贺张慧芳章纯熙
- 关键词：槟榔江水牛微卫星DNA标记基因渗入
- 利用mtDNA D-loop序列为遗传标记分析槟榔江水牛的群体遗传特征被引量：3
- 2011年
- 槟榔江水牛是近年在云南西部发现的中国第一个本土河流型水牛群体,具有较高种用价值,但其重要遗传背景信息还不清楚。本文采用PCR产物直接测序法对86头槟榔江水牛mtDNA D-Loop序列进行了突变检测,并以GenBank上已发表的70条河流型和112条沼泽型水牛mtDNA D-Loop序列为对照,对所得数据进行群体遗传和系统发育分析。结果在槟榔江水牛中检测到33种单倍型,112个多态位点。其中单一变异位点14个,简约信息位点98个。槟榔江水牛mtDNA D-Loop序列T,C,A,G的平均含量分别为28.43%,24.82%,31.96%,14.79%,单倍型多样度为(0.948±0.012),核苷酸多样度为(0.038 1±0.001 6),序列间平均核苷酸差异数为33.288,群体内平均遗传距离为(0.043±0.005)。系统发育、中介网络图和群体遗传关系分析表明,槟榔江水牛含有两个差异显著的母系世系组分,其中一个为河流型世系,在群体中占61.63%;另一个为沼泽型世系,在群体中占38.37%,而其沼泽型世系可进一步分为A,B,C 3个支系,其中,C为在水牛中新发现的支系,其频率极低。结果揭示了槟榔江水牛群体遗传多样性丰富,但该群体存在一定的沼泽型水牛基因渗入。
- 苗永旺李大林袁峰梁建平李卫真刘伟李卓然章纯熙
- 关键词：槟榔江水牛MTDNAD-LOOP遗传分化基因渗入
- 水牛催乳素基因第3外显子群体遗传特征分析被引量：2
- 2011年
- 催乳素基因(PRL)第3外显子(exon 3)对奶牛产奶量、乳脂产量和乳蛋白产量有显著影响,但在水牛中该基因的遗传特征及其与产奶性状是否有遗传关联目前还不清楚。本研究采用PCR-SSCP并结合PCR产物直接测序技术,分析了沼泽型水牛和河流型水牛共12个群体275个个体PRL exon 3的遗传变异,结果表明:水牛PRL exon 3由108个核苷酸组成,编码36个氨基酸,在水牛群体中未检测到单核苷酸多态性位点(SNPs),PRL exon 3与水牛产奶量之间没有直接相关性。通过序列比对发现在不同物种中PRL exon 3具有高度保守性。但在PRL第2内含子(intron 2)的2 265 nt和2 335 nt分别检测到G>A突变和C>T突变,其中2 335 nt位点突变仅在2头槟榔江水牛中检测到。
- 袁峰苗永旺李大林刘丽仙熊飞刘伟贡潘偏抽
- 关键词：河流型水牛沼泽型水牛催乳素EXON
- 基于线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)序列分析瓢鸡的遗传多样性被引量：33
- 2011年
- 采用PCR产物直接测序技术对云南省镇沅县50只瓢鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第Ⅰ高变区序列进行了分析。结果表明:在所分析的D-loop区序列中(520 bp),T,C,A,G平均含量分别为30.4%,29.6%,27.4%,12.6%;共检测到27个核苷酸多态位点,其中24个为转换,3个为颠换,序列突变率为5.19%;序列存在13种单倍型,单倍型多样度(H)为0.883±0.028,核苷酸多样度(π值)为0.015 03±0.000 99,表明瓢鸡群体内遗传变异较丰富。瓢鸡样品可划分为A,B,E,F,G等5个世系,在NJ无根系统树上聚为5大枝,揭示瓢鸡在遗传组成上具有5个母系血统来源。
- 贡潘偏抽刘丽仙李大林袁跃云孙利民杨润刘文瑜刘伟苗永旺
- 关键词：线粒体DNA单倍型
