佟晓梅
- 作品数:2 被引量:0H指数:0
- 供职机构:大连交通大学理学院更多>>
- 发文基金:辽宁省教育厅计划项目更多>>
- 相关领域:生物学理学更多>>
- 结构矩阵在生物序列相似性比较中的应用
- 根据DNA初级序列的特性,把DNA初级序列转换成数字序列,即离散的时间序列:A,T,G,C用1,2,3,4表示。蛋白质与DNA和RNA一样,也是线性大分子。它是字符集N={A C,D,E,F,G,H,I,K,L,M,N,...
- 佟晓梅
- 关键词:结构矩阵
- 文献传递
- 基于结构矩阵的DNA序列的相似性模型
- 2010年
- 通过一维映射把DNA序列转化为时间序列,即把数字1,2,3,4分别分配给组成DNA序列的核苷酸A,T,G,C,用时间序列的结构矩阵来描述DNA序列的结构特征,并根据结构矩阵的一些性质定义了结构矩阵的相似性度量,进而利用结构矩阵之间的相似性度量构建了比较DNA序列的相似性模型,以9个不同物种的β-球蛋白基因的第一个外显子(表1)为例验证了该模型的适用性.并得到了较好得结果.
- 白凤兰佟晓梅
- 关键词:DNA序列时间序列结构矩阵