丁朋举
- 作品数：8 被引量：7H指数：1
- 供职机构：河南工业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生历史地理自动化与计算机技术生物学更多>>
- 北京谱系结核分枝杆菌临床相关研究
- 目的 初步探讨中国结核病专科医院就诊的结核病人感染北京谱系M.TB的流行特征.方法 连续收集前来中国国家结核病临床中心(首都医科大学附属北京胸科医院)就诊的结核病人临床分离菌株,抗酸染色、NHP和TCH鉴定.对所有M.T...
- 李卫民黄延风李晓迎康万里马异峰戴文涛丁朋举黄海荣
- 脓肿分枝杆菌硝基还原酶基因的克隆表达及生物信息学分析(英文)被引量：1
- 2013年
- 目的克隆表达脓肿分枝杆菌中的硝基还原酶(nitroreductase,Nrd)基因,并对其对应的蛋白质进行生物信息学分析。方法利用PCR技术从脓肿分枝杆菌中扩增Nrd的全基因序列,采用原核表达系统进行体外表达。采用生物信息学方法对Nrd蛋白的理化性质、结构和功能等重要参数进行了预测和分析,对其三级结构进行了同源建模。结果从脓肿分枝杆菌中扩增出660bp的目的片段,体外表达获得了大小约为30kDa的带有His标签的重组蛋白。生物信息学分析显示Nrd蛋白有219个氨基酸组成,理论分子量和等电点分别为24.38kDa和6.52,是一种不稳定的亲水性蛋白质(不稳定系数为54.52,总平均亲水性为-0.244);二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主要构件;该蛋白的氨基酸序列与蛋白质结构数据库中3gr3蛋白A链的相似性最高为60%,以3gr3蛋白A链为模板构建了Nrd蛋白的三维结构分子模型。结论成功表达并纯化了脓肿分枝杆菌中的Nrd蛋白。预测结果显示该蛋白是硝基还原酶家族成员之一,这提示Nrd蛋白在脓肿分枝杆菌中可能执行还原对硝基苯甲酸的功能。
- 丁朋举惠明姜广路戴广明赵立平付育红李卫民黄海荣
- 关键词：脓肿分枝杆菌克隆表达分离纯化生物信息学分析
- 中国北方部分地区北京谱系结核分枝杆菌群体遗传关系的分析被引量：5
- 2013年
- 目的应用分子遗传学方法探讨234株北京谱系结核分枝杆菌的起源进化及群体间基因流动特征。方法对来源于中国北方五省区（黑龙江、吉林、辽宁、内蒙古和宁夏）234株北京谱系结核分枝杆菌进行24位点可变数目串联重复序列（VNTR）基因分型，计算各VNTR位点的等位基因多态性（h）；从个体水平分析其系统发育，即构建NJ树和最小生成树；构建群体水平系统发育树，并在此基础上通过贝叶斯模型计算最近共祖年代；通过分子方差分析了解五省区菌株间的基因流动情况。结果24个VNTR位点的等位基因多态性较低（h值：0．000～0．744）。234株北京谱系结核分枝杆菌分散存在NJ树各个进化分支，最小生成树中约62．0％（145／234）的菌株被划分到同一“克隆复合群”。群体水平系统发育树显示234株菌与MIRU-VNTRplus数据库（http：／／www．miru—vntrplus．org）中的北京谱系结核分枝杆菌的遗传关系最近（Bootstrap值为100）；最近共祖年代为5308年（95％CI：4263～6470年）。通过分子方差分析发现吉林与黑龙江、辽宁菌株之间。内蒙古与宁夏菌株之间遗传分化系数的差异无统计学意义（P〉0．05）。结论中国北方五省区北京谱系结核分枝杆菌的遗传相似性较高，菌株问种系发生关系不明显。推测这些菌株由近期（约5000年前）结核分枝杆菌北京谱系的某一“克隆”进化而来。地理位置接近的区域，菌株问存在基因流动现象。
- 丁朋举惠明梁倩张乾李卫民黄海荣
- 关键词：系统发育基因流动
- 分枝杆菌系统进化及其硝基还原酶基因克隆表达
- 分枝杆菌尤其是结核分枝杆菌是引起人类患结核病的主要病原微生物,目前结核病仍然是我国严重的公共卫生问题。本文旨在通过对结核分枝杆菌(北京谱系)的群体遗传关系及脓肿分枝杆菌中硝基还原酶基因的克隆表达相关研究,希望能够为结核病...
- 丁朋举
- 关键词：分枝杆菌系统发育克隆表达响应面优化
- 文献传递
- 北方五省北京谱系结核分枝杆菌起源进化及基因流动特征
- 目的 探讨我国北方五省(黑龙江、吉林、辽宁、内蒙古和宁夏)结核分枝杆菌北京谱系菌株的群体多样性、起源进化及群体间基因流动特征.方法 对北方五省212株北京谱系结核分枝杆菌进行24位点MIRU-VNTR基因分型分析,计算各...
- 丁朋举梁倩张乾惠明李卫民黄海荣
- 关键词：系统发育基因流动
- 文献传递
- 中国北方五省区北京谱系结核分枝杆菌起源进化及基因流动特征
- 目的 应用分子遗传学方法探讨我国北方五省区(黑龙江、吉林、辽宁、内蒙古和宁夏)212株北京谱系结核分枝杆菌的起源进化及群体间基因流动特征.方法 对北京谱系结核分枝杆菌进行24位点可变数目串联重复序列(VNTR)基因分型，...
- 丁朋举惠明梁倩张乾黄海荣李卫民
- 关键词：系统发育基因流动
- 北京谱系结核分枝杆菌(北方五省)起源进化及基因流动特征
- 目的 从方法学角度探讨212株(来源于我国北方五省：黑龙江、吉林、辽宁、内蒙古和宁夏)结核分枝杆菌北京谱系菌株的群体多样性、起源进化及群体间基因流动特征.方法 对北方五省212株北京谱系结核分枝杆菌进行24位点MIRU-...
- 李卫民丁朋举梁倩张乾惠明黄海荣
- 关键词：系统发育基因流动
- 茶氨酸制备方法研究新进展
- 茶氨酸是茶叶和部分山茶科植物特有的酰胺类物质,是已得到公认的三大茶叶提取物(茶多酚、茶多糖和茶氨酸)之一,是一种重要的功能成分.它在保护神经、调节情绪、提高认知能力等方面有良好的保健作用,在医药和食品加工等行业也具有广阔...
- 丁朋举惠明刁大鹏张开平张新武黄继红
- 关键词：茶氨酸微生物发酵法生理功能代谢调控
- 文献传递
