高峰涛
- 作品数：19 被引量：65H指数：5
- 供职机构：中国海洋大学海洋生命学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山东省“泰山学者”建设工程项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 一种半滑舌鳎性别特异SCAR标记及应用方法
- 本发明首先提供一种半滑舌鳎性别特异微卫星标记，包括有位于Z染色体上的微卫星标记，其核苷酸序列为SEQ？ID？NO:1。本发明还提供从上述微卫星标记设计的引物，其上、下游引物序列分别为SEQ？ID？NO:2和SEQ？ID？...
- 陈松林刘洋高峰涛孟亮邵长伟宋文涛
- 文献传递
- 牙鲆三倍体批量化诱导及其生长和性腺发育观察被引量：11
- 2011年
- 对牙鲆三倍体鱼苗的诱导、生长及性腺发育进行了一系列研究,发现在14.8～15.5℃的海水温度条件下授精,授精后3 min将受精卵放入3℃的海水中冷休克处理45 min,可以得到牙鲆三倍体;120日龄、348日龄、630日龄时对三倍体和二倍体的全长和体质量进行测量,发现在120日龄时二倍体与三倍体体质量差异不显著,348日龄时三倍体体质量明显大于二倍体体质量(P<0.05),630日龄时三倍体的全长和体质量均高于二倍体,且差异极显著(P<0.01)。通过比较630日龄时的性腺指数,发现二倍体牙鲆雌性和雄性的性腺指数分别是三倍体的3.3倍和3.1倍,三倍体牙鲆性腺明显小于二倍体,二倍体和三倍体卵巢指数之间及精巢指数之间差异均极显著(P<0.001);组织切片观察显示,在二倍体卵巢中可见正常卵母细胞,三倍体卵巢处于未分化的卵原细胞阶段,三倍体精巢中有精母细胞,但数量明显少于二倍体精巢。结果表明,研究采用的方法能够大量获得诱导率为100%的三倍体牙鲆鱼苗,三倍体成鱼性腺发育不良,并且其生长速度显著快于二倍体对照,适合在生产中推广。
- 王磊王磊陈松林谢明树邓寒李文龙
- 关键词：牙鲆三倍体性腺发育
- 牙鲆遗传连锁图谱的构建被引量：3
- 2012年
- 利用基因组测序得到的大量微卫星序列,以681383B为父本、6812E36为母本杂交获得的F1为作图群体,构建了牙鲆(Paralichthys olivaceus)微卫星标记(SSR)遗传连锁图谱。雌雄图谱共定位SSR标记529个,其中雄性连锁图谱包括418个标记,分布在24个连锁群上,总长度1 418.1 cM,标记平均间隔3.62 cM,图谱覆盖率为88.7%;雌性连锁图谱包括437个标记,分布在24个连锁群上,总长度1 298.1 cM,标记平均间隔为3.16 cM,图谱覆盖率为89.1%。牙鲆中密度遗传图谱的构建为QTL分析以及分子标记辅助育种进一步奠定基础,并可以有效推动牙鲆的遗传改良工作,推动牙鲆养殖业的可持续发展。
- 庞仁谊宋文涛高峰涛廖小林赵永伟牛余泽王磊赵文田永胜陈松林
- 关键词：牙鲆SSR分子标记遗传连锁图谱
- 半滑舌鳎微卫星标记遗传连锁图谱的构建被引量：5
- 2012年
- 利用全基因组测序方法筛选出微卫星标记,以渤海近海野生个体和人工养殖的半滑舌鳎(Cynoglossus semi-laevis)为亲本交配产生的F1全同胞家系为作图群体,构建了半滑舌鳎雌、雄微卫星标记遗传连锁图谱。用320对引物对父母本和92个F1个体进行遗传分析,共得到288个分离标记,其中包含112个偏分离标记(P<0.05)。其中雌性框架图包含242个标记,分布在21个连锁群上,总长度1 311.9 cM,标记间平均距离为4.9 cM,图谱覆盖率为83.3%;雄性框架图定位标记218个,21个连锁群,总长度1 316.2 cM,标记间平均距离为5.5 cM,覆盖率为82%。半滑舌鳎遗传连锁图谱的构建为半滑舌鳎重要经济性状QTL定位、分子标记辅助育种和性别控制奠定了重要基础。
- 赵永伟宋文涛廖小林牛余泽庞仁谊高峰涛沙珍霞陈松林
- 关键词：半滑舌鳎微卫星遗传连锁图谱分子标记辅助育种
- 基于高通量测序的青石斑鱼基因组微卫星开发及评价被引量：9
- 2017年
- 本研究采用基因组高通量随机测序的方法对青石斑鱼(Epinephelus awoara)微卫星标记进行了发掘,结果共获得青石斑鱼(Epinephelus awoara)基因组原始数据2.860G。采用MISA(MIcroSAtellite)软件进行微卫星位点搜索,获得967 657条微卫星序列。随机选取了96条微卫星序列设计引物并利用8尾青石斑鱼个体进行多态性位点筛选,共获得60个具有多态的微卫星标记。利用其中16个微卫星标记对一个青石斑鱼亲鱼群体的种群遗传学特征进行评价,共检测到129个等位基因,单个标记的表观等位基因数(NA)分布范围为2~14,平均为7.167;表观杂合度(HO)分布范围为0.422~1.000,平均为0.678 6;期望杂合度(HE)分布范围为0.481~0.893,平均为0.676 8。有5个标记的等位基因频率不符合"哈迪-温伯格平衡",其中EAW-55596、EAW-21755、EAW-30334 3个标记表现为杂合子显著缺失(P<0.05),而EAW-33674和EAW-52520 2个标记表现为杂合子显著过剩(P<0.05)。连锁不平衡检测表明各位点间无连锁不平衡现象。多态信息含量(PIC)分布范围为0.362 3~0.872 2,平均PIC=0.639 7>0.5,说明该亲鱼群体的遗传多样性比较高。而这些微卫星标记将对于青石斑鱼的遗传变异分析、亲缘关系鉴定提供了技术支持,这也将为青石斑鱼的分子遗传育种奠定了基础。
- 高峰涛邵长伟崔忠凯王升鹏魏敏陈松林杨官品
- 关键词：青石斑鱼高通量测序微卫星标记多态性
- 半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因克隆与表达分析及SNP筛选被引量：4
- 2016年
- 天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural resistance-associated macrophage protein,Nramp)属于膜整合转运蛋白,具有抑制胞内寄生菌侵染、调节巨噬细胞的抗菌活性等作用。本研究对半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因进行了克隆和表达分析,并对其与抗鳗弧菌感染相关的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点进行了筛选。该基因c DNA序列全长3717 bp,其中开放阅读框(Open reading frame,ORF)1677 bp,所编码蛋白含有558个氨基酸,该蛋白具有Nramp家族的典型特征,包括10个跨膜区(Transmembrane,TM)、1个由20个氨基酸残基组成的胞质内转运蛋白特征结构域(Consensus Transport Motif,CTM)。半滑舌鳎Nramp的ORF末端有1个类似于脊椎动物Nramp2中的铁反应控制蛋白结合位点(Iron-responsive regulatory protein-binding site,IRE)。半滑舌鳎Nramp与其他14个物种的Nramp氨基酸序列同源性在63%-91%之间,系统进化分析表明,半滑舌鳎Nramp和所有鱼类Nramp聚集为一簇,与其他物种Nramp2的亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析显示,Nramp基因在半滑舌鳎脾脏和肾脏中的表达量最高,而在肌肉和性腺中的表达量最低;在哈维氏弧菌感染的半滑舌鳎肾脏、脾脏和肝脏中表达量呈升高趋势,而在鳃中则表现为下调趋势。利用直接测序法检测感染鳗弧菌后同一家系的233个个体(抗病个体165个,感病个体68个),共检测到15个SNP位点,对其中3个SNP位点即SNP-g.3113(T→C)、SNP-g.3125(A→G)和SNP-g.3164(A→T)进行测序分型后发现,SNPg.3125(A→G)的等位基因(G)频率和基因型(GG)频率与半滑舌鳎抗鳗弧菌疾病呈极显著相关(P<0.01)。研究结果表明,Nramp基因不同基因型对半滑舌鳎的抗病能力有着极其重要的影响,SNP-g.3125(A→G)可作为潜在的抗性遗传标记位点。本研究将为半滑舌鳎抗性品系培育提供技术支持。
- 邢贺飞高峰涛张永珍董忠典陈松林
- 关键词：半滑舌鳎基因克隆RT-PCR
- 一种牙鲆抗迟钝爱德华氏菌病优良品系的选育方法
- 本发明建立了牙鲆抗迟钝爱德华氏菌病优良品系选育方法，主要包括如下的步骤：迟钝爱德华氏菌感染牙鲆鱼苗及其抗病力测定方法、抗迟钝爱德华氏菌病群体筛选方法、抗迟钝爱德华氏菌病家系筛选方法以及抗迟钝爱德华氏菌病家系特异微卫星标记...
- 陈松林张英平刘洋孙何军田永胜王磊范彩霞高峰涛沙珍霞王娜
- 文献传递
- 海参螺旋藻营养片及其生产工艺
- 本发明涉及一种海参螺旋藻营养片及其生产工艺，其特征在于它包括海参冻干粉和海水螺旋藻，且海参冻干粉占两者混合重量的10％-20％；其生产工艺是先将新鲜海参预处理，再利用冷冻干燥技术制成海参冻干粉；然后将海参冻干粉和螺旋藻粉...
- 姜国建高峰涛丛日山杨澍邵梅雪王介川
- 文献传递
- 两种石斑鱼的微卫星标记开发及两种杂交后代的线粒体基因组序列分析
- 本研究采用基因组高通量随机测序的方法对青石斑鱼(Epinephelusawoara)微卫星标记进行了发掘，结果共获得青石斑鱼(Epinephelusawoara)基因组原始数据2.860G。采用MISA(MIcroSAt...
- 高峰涛
- 关键词：云纹石斑鱼青石斑鱼线粒体基因组系统进化分析
- 牙鲆遗传作图及生长性状QTL定位被引量：5
- 2012年
- 采用牙鲆日本群体和韩国群体杂交的92个F1个体作为分离群体，利用微卫星标记和Joinmap4．0作图软件构建了牙鲆遗传连锁图谱。共有221个SSR标记用于连锁图谱构建，雌性图谱中，共178个微卫星标记定位到22个连锁群上，观测总长度为（Goa）599．0cM，覆盖率（Coa）达76．27％。雄性图谱中，共194个微卫星标记定位到23个连锁群上，Goa为693．4cM，Coa为78．82％。对全长、体质量、体高3组数据进行主成分分析处理，得到可解释3个性状的89．6％特征的一组数据，命名为牙鲆生长性状GT。用WinQTLCart2．5软件的复合区间作图，在已构建的遗传连锁图谱上对牙鲆生长性状GT进行QTL定位，取LOD经验值2．5为QTL存在的阈值；对微卫星标记进行性状一标记之间的回归分析。本研究共定位3个与牙鲆生长性状GT相关的QTLs，qGT-f4qGT-m20qGT-f20，可解释表型变异率分别为27．60％，13．74％，10．27％。在性状一标记之间的回归分析中，得到22个与生长性状GT相关（P〈O．05）的微卫星标记，单个标记可解释表型变异率介于3．70％～10．42％，其中6个微卫星标记scaffold558_51720、scaffold558_26183、scaffold903_69232、scaffold485_47120、scaffoldl262_77386、scaffold809_65154与生长性状GT之间呈极显著相关（P〈O．01），可解释表型变异率分别为10．42％、7．31％、10．07％、10．07％、8．39％和11．26％。
- 牛余泽廖小林宋文涛王磊赵永伟高峰涛陈松林
- 关键词：牙鲆微卫星生长性状QTL定位
