钟振晖
- 作品数：4 被引量：9H指数：2
- 供职机构：福建农林大学植物保护学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划教育部科学技术研究重点项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 稻瘟病菌类LxAR家族基因的预测及表达分析被引量：2
- 2018年
- 在侵染水稻过程中,稻瘟病菌分泌一系列效应因子来抑制寄主免疫系统。无毒效应因子AVR Pii和AvrPiz-t的氨基酸序列含有类LxAR基序,基于此,本研究利用生物信息学技术,从稻瘟病菌基因组中筛选获得了99个含有类LxAR基序的假定效应因子(MoLLEs)。该家族蛋白都为小分子蛋白(70~300 aa),富含半胱氨酸氨基,绝大多数为未知功能的蛋白。24个蛋白含已知的功能域,可能涉及了多种生命过程,其中有9个蛋白编码植物细胞壁降解酶。通过表达模式分析发现,MoLLEs家族基因成员的表达受到饥饿胁迫、附着胞生长发育以及侵染水稻等过程的诱导,此外一部分基因受到附着胞发育关键基因PMK1调控。基因表达交叉分析表明,部分基因同时在附着胞发育和致病过程中上调表达。在与水稻的相互作用中,MoLLEs在稻瘟病菌侵染不同阶段均有上调表达,并且部分基因受亲和或非亲和反应特异性诱导。
- 韩艺娟钟振晖吴剑英鲁国东王宗华
- 关键词：稻瘟病菌生物信息学预测附着胞RNA-SEQ
- 稻瘟病菌MoSSPs生物信息学分析与MoSSP7定位研究被引量：3
- 2016年
- 真核生物中,SET蛋白在基因转录的表观遗传调控方面是必需的,基因转录通过催化组蛋白赖氨酸甲基化而受调控。某些病原性细菌和病毒可以分泌SET蛋白去修饰宿主基因组,进而抑制宿主细胞免疫反应。真菌中SET蛋白已有较为深入的研究。但是,分泌型SET蛋白的功能,很大程度上仍然未知。为了研究稻瘟病菌分泌型SET蛋白的功能,我们从稻瘟病菌数据库中搜索获得8个预测的分泌型SET蛋白,分别命名为MoSSP1-8。通过在线的生物信息学工具分析了Mo SSP蛋白功能结构域和理化特性。RNA-Seq数据揭示其中6个基因在侵染时期表达量上调。序列比对和进化分析结果表明,Mo SSP7及其真菌同源蛋白在SET结构域都具有保守的基序,并且在进化上关系较近。共聚焦显微观察结果表明,在侵染菌丝中MoSSP7蛋白主要集中在BIC上,这说明它是一个胞质效应因子。
- 徐凌鸿郑华坤钟振晖陈晓峰张冬梅王宗华
- 关键词：稻瘟病菌生物信息学亚细胞定位
- 稻瘟病菌中蛋白激酶CK2的功能预测分析
- 2013年
- 通过生物信息学分析,初步掌握了稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)中蛋白激酶CK2三亚基的结构特点,生物进化树分析表明CK2的蛋白序列在进化上的高度保守性;利用酵母同源比对的方法预测分析了稻瘟病菌中潜在的互作底物,揭示了CK2可能参与的生理生化过程,并且重点预测分析了CK2与小G蛋白Rho3之间的互作关系,为进一步揭示稻瘟病菌蛋白激酶CK2的功能及其参与调控的信号通路提供了理论基础。
- 张连虎林婕翟珍珍钟振晖陈少华张承康王宗华鲁国东
- 关键词：稻瘟病菌蛋白激酶CK2生物信息学信号转导
- 稻瘟病菌NUDIX水解酶家族的生物信息学及表达特性研究被引量：4
- 2016年
- NUDIX水解酶家族能够清除和调节细胞内产生的有害代谢产物,在机体保护、调节和信号传递等过程中发挥重要的生物学功能,大豆疫霉中的无毒蛋白Avr3b就具有NUDIX水解酶活性。为了探究稻瘟病菌中NUDIX水解酶家族的生物学功能,我们借助生物信息学手段对稻瘟病菌中鉴定出的18个NUDIX蛋白的结构、理化性质、系统进化关系进行了分析,结合RNA-seq和RT-PCR数据,我们发现其中的两个蛋白NUDIX15-1和NUDIX15-2同大豆疫霉无毒蛋白Avr3b高度同源,极有可能在稻瘟病菌的侵染过程中发挥功能。
- 陈龙洪永河吴晓贤黄峻陈美莲钟振晖陈晓峰张冬梅鲁国东
- 关键词：稻瘟病菌生物信息学
