贾伟
- 作品数：16 被引量：42H指数：4
- 供职机构：军事医学科学院放射与辐射医学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学生物学医药卫生更多>>
- 核心岩藻糖化蛋白质规模化精确鉴定策略的建立与应用
- 糖基化蛋白质的核心岩藻糖化结构是由岩藻糖残基与糖基化蛋白质的N-糖链还原端的N-乙酰氨基葡萄糖残基的碳六原子连接产生。已经发现糖基化蛋白质的核心岩藻糖化与多种重要的生理过程密切相关(如转化生长因子-β1信号通路和表皮生长...
- 贾伟
- 基于母离子排除的串联质谱数据采集方法的研究被引量：1
- 2010年
- 生物样本中的蛋白质复杂程度很高,尚无一种分析方法能够全面分析复杂生物样本中的所有蛋白质。实验证明:重复的质谱分析能增加蛋白质的鉴定数量,但鉴定到的蛋白质冗余度很高,高丰度肽段被反复检出。为了降低鉴定冗余度,提高鉴定效率,对线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱仪的串联质谱采集方法进行了研究,建立了基于母离子排除的串联质谱采集方法。此方法能极大降低二级质谱采集的冗余度,提高蛋白质的鉴定效率。
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- 关键词：液相色谱-串联质谱
- 基于液相色谱-串连质谱的糖基化蛋白质组研究策略
- 人体内50％以上的蛋白质是糖基化修饰蛋白质。糖基化对于蛋白质的折叠、运输、定位起着重要作用，免疫系统中几乎所有的关键分子都是糖蛋白，蛋白质糖基化程度及糖链结构的异常变化也常常是癌症及其他疾病发生的标志。本文以标准糖基化蛋...
- 贾伟卢庄米薇宋丽娜应万涛蔡耘钱小红
- 关键词：液相色谱质谱分析糖基化蛋白质组
- 文献传递
- 应用超高分辨双向凝胶电泳技术进行正常人类肝脏蛋白质组研究被引量：1
- 2010年
- 肝脏是人体最大的实质器官,承担着人体许多关键的生理功能,在生命活动中占有重要地位.根据人类肝脏蛋白质组计划,本实验旨在构建人肝脏蛋白质双向凝胶电泳表达谱,尽可能分离和鉴定更多的蛋白.在双向凝胶电泳第一向等电聚焦水平上,从上样方式、水化液配方、聚焦时间等方面优化了碱性蛋白的分离条件,利用超放大胶分离技术搭建了高分辨的双向凝胶电泳分离平台,构建了人类肝脏蛋白质2-DE参考谱,检测到5481个蛋白质点.这是目前国际上最为全面的人体器官蛋白质组2-DE参考谱,为其他肝病的研究提供了较好的参照系.成功鉴定了429个非冗余蛋白,对pH4.0～7.0,5.0～6.0,5.5～6.7,6.0～9.0部分蛋白质点在胶上进行了注释,由此构建了人肝2-DE蛋白质表达谱数据库.对蛋白质的理化性质、功能及亚细胞定位进行了全面分析.研究中构建的人类肝脏蛋白质2-DE图谱将为肝脏比较蛋白质组学研究提供参考.
- 米薇刘新贾伟李蕾蔡耘应万涛钱小红
- 关键词：双向凝胶电泳质谱
- 麦胚凝集素亲和色谱富集糖肽过程中的肽键裂解被引量：4
- 2009年
- 蛋白质的糖基化是最重要的翻译后修饰之一,与蛋白质结构和功能的关系密切。凝集素亲和色谱是蛋白质糖基化研究中很常用的工具,不同的凝集素可以对不同的单糖或寡糖有特异的富集作用。麦胚凝集素(W GA)由于其特异作用的糖型广泛存在而成为使用最多的凝集素之一。在本研究中,发现将W GA用于糖肽亲和富集会导致部分肽段的降解,从而导致后续的肽段序列分析的失败。本文用4种标准蛋白质对这种现象进行了验证,结果表明肽段的降解可以发生在多个位点,其中较多地发生在酪氨酸、苯丙氨酸及亮氨酸的羧基端。这一结果提示:在糖蛋白质组研究中,如果应用W GA富集糖肽并采用质谱进行鉴定,则采用半酶切或非特异性酶切的检索策略更为合适。
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- 关键词：糖肽肽键蛋白质组学
- 蛋白质组学研究中傅立叶变换离子回旋共振质谱数据采集方法的比较被引量：2
- 2010年
- 探讨了线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱(LTQ-FT)的数据采集模式对蛋白质组鉴定结果的影响,比较和分析了针对不同复杂程度样本的最佳采集模式。对于α-乳清蛋白4种标准蛋白质酶切肽段混合物的简单体系,在傅立叶变换离子回旋共振腔中选3个最强母离子进行选择离子监测扫描后,再实施二级碎裂的方法(SIM3)得到的肽段覆盖率,分别是直接选10个最强母离子进行二级碎裂(FT10)方法得到的肽段覆盖率的1.5～1.9倍。另外,对酵母蛋白酶切肽段混合物的复杂体系鉴定时,只采集双电荷和三电荷母离子进行二级扫描的方法(FT10_23)比单电荷、双电荷和三电荷都采集的方法(FT10_123)得到的图谱鉴定成功率提高64.1%。实验还对不同数据采集模式下图谱的特点进行了考察。本研究表明,针对不同复杂程度的样本,应采取不同的质谱数据采集方法。
- 曾家伟贾伟应万涛钱小红
- 关键词：蛋白质组学
- 天冬氨酸作为非特异性吸附抑制剂在二氧化钛选择性富集磷酸肽中的应用被引量：6
- 2010年
- 二氧化钛富集法作为目前使用最为广泛的金属氧化物富集磷酸肽的方法,在富集过程中常常对富含天冬氨酸和谷氨酸的酸性非磷酸化肽段存在一定的非特异性吸附作用。这些肽段与磷酸化肽段一同被富集,降低了磷酸肽富集的选择性。传统方法中使用的非特异性吸附抑制剂常会对质谱的电喷雾离子源造成污染,因而限制了其在液相色谱-质谱联用(LC-MS)系统中的应用。本研究将天冬氨酸作为一种新型的非特异性吸附抑制剂加入到二氧化钛富集体系中,并分别对3种和9种标准蛋白质酶切肽段混合物进行富集实验,同时与添加另一种非特异性吸附抑制剂——谷氨酸以及不添加任何非特异性吸附抑制剂的富集体系进行了富集效果的比较。结果表明,天冬氨酸可以有效地提高二氧化钛对磷酸肽富集的选择性。将添加天冬氨酸的二氧化钛富集体系应用于鼠肝全蛋白质磷酸肽的富集中,同样取得了很好的效果,表明天冬氨酸在复杂的生物样本的磷酸肽富集中也同样具有良好的应用前景。此外,由于天冬氨酸在反相色谱中极易被洗脱去除,从而避免了传统抑制剂对LC-MS系统离子源的污染问题。
- 迟明毕炜卢庄宋丽娜贾伟张养军钱小红蔡耘
- 关键词：二氧化钛天冬氨酸鼠肝
- 另辟蹊径——串联质谱肽段断裂的新军“电子捕获解离”被引量：10
- 2007年
- 一种新型的串联质谱断裂方式——电子捕获解离,以其完全不同于其他串联质谱肽段断裂的机理,提供了全新的肽段序列标签。它集众多优点于一身:对蛋白质和多肽的主链断裂无偏好;高断裂覆盖度;优先断裂二硫键;保留翻译后修饰基团;中性丢失少、可区分亮氨酸和异亮氨酸等。这些特点使电子捕获解离充满魅力,特别在Top Down技术和翻译后修饰中具有广阔的应用前景。
- 贾伟应万涛钱小红
- 改进的^18O同位素标记法标记蛋白质多肽被引量：3
- 2010年
- 针对18O同位素标记反应两个重要影响因素——肽段分散度和胰酶灭活方法,进行了标记条件的改进和灭活方法的优化。在H218O中加入RapigestTM SF助溶剂并微波辅助加热,使α-酪蛋白胰酶酶切肽段的标记效率得到明显改进(18O/16O峰面积比值>99%)。标记后,对胰酶进行还原烷基化化学修饰彻底灭活,使标记后的肽段稳定性显著提高,放置6d不发生回交反应。对标准蛋白质甲状腺球蛋白酶切肽段混合物标记后的质谱实验结果表明:优化的标记方法能快速稳定地标记蛋白质酶切多肽。
- 赵焱卢庄贾伟应万涛钱小红
- 关键词：多肽蛋白质组
- 基于膜超滤的糖肽富集新方法被引量：1
- 2009年
- 建立了一种用于糖肽富集的新型超滤方法,采用截留相对分子质量为3 000 u的超滤膜,截取相对分子质量大于3 000 u的组分,同时完成糖肽的富集、样本的脱盐及浓缩,简化了操作过程并减少了样本损失。用4种标准蛋白酶切肽段混合物测试方法的有效性,结果表明,采用超滤方法富集后的样品可以多鉴定1个糖肽,且所有鉴定的糖肽丰度远高于未富集的样品。将该方法用于人血浆样本,血浆全酶切肽段的1个SCX组分用超滤法富集后,其鉴定的糖肽数量超过未富集组分的6倍,且糖肽富集的选择性大于85%。该方法为糖蛋白质组学的研究及糖相关生物标志物的开发提供了有力的技术支持。
- 卢庄贾伟宋丽娜蔡耘邓玉林张玉奎钱小红
- 关键词：超滤
